Особенности ядерных и митохондриальных геномов у аллоплазматических эуплоидных и анеуплоидных линий : Hordeum marinum subsp. gussoneanum - Triticum aestivum

• Автор: Трубачеева, Наталия Викторовна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2007
• Место защиты: Новосибирск
• Количество страниц: 154 с. : ил.

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Распространенность отдаленных гибридов и полиплоидов у покрытосеменных растений.

1.2. Геномные изменения при аллополиплоидизации пшеницы

1.3. Использование отдаленных гибридов мягкой пшеницы в селекционногенетических исследованиях.

1.4. Отдаленная гибридизация между видами ячменя и мягкой пшеницей

1.4.1. Особенности получения ячменнопшеничных гибридов . v . х

Г. iv

1.4.2. Особенности получения пшеничноячменных гибридов Т. iv . х

. v .
1.4.3. Линии мягкой пшеницы, полученные в результате реконструкции геномов пшеничноячменных гибридов Т. iv . х Н. v .
1.4.4. Гибридизация между дикорастущими видами ячменя и культурными видами пшеницы.
I.5. Особенности ядерноцитоплазматических взаимодействий при отдаленной гибридизации и получении аллоплазматических форм злаков
1.5.1. Цитоплазматическая мужская стерильность ЦМС.
1.5.2. Гены ядерноцитоплазматической совместимости
1.5.3. Наследование цитоплазматических геномов у высших растений.
1.5.4. Проявление гетероплазмии митохондриальной ДНК.
1.6. Методы геномного анализа, используемые для изучения растений гибридного происхождения.
1.6.1. Цитологические методы анализа.
1.6.2. Биохимические методы анализа
1.6.3. Молекулярногенетические методы анализа.
1.6.4. маркеры ii i.
1.6.5. маркеры i.
1.6.6. маркеры ii i.
1.6.7. маркеры ii i случайным образом амплифицированная ДНК.
1.6.8. маркеры i ii i охарактеризованный секвенированием амплификационный район.
1.6.9. маркеры i .
1.6 маркеры i i i.
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Исходный материал
2.2. Выделение ДНК
2.2.1. Выделение ДНК растений с использованием протеиназы К
2.2.2. Выделение ДНК плазмид методом щелочного лизиса
2.3. Условия ПЦР, анализ и кроссгибридизация фрагментов
2.4. Электрофорез в агарозном геле
2.5. Клонирование и секвенирование ПЦРпродуктов
2.6. анализ
2.7. анализ.
2.8. Геномная i i гибридизация I.
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.
3.1. Результаты анализа аллоплазматических эуплоидных 2п и анеуплоидных линий .i . .iv
3.2. Результаты анализа аллоплазматической телоцентрически дополненной линии Л
3.3. Результаты анализа линии Л3 2п.
3.4. Результаты геномной i i гибридизации аллоплазматических линий .i . .iv.
3.5. анализ аллоплазматических линий .i .
.iv с применением микросателлитных маркеров пшеницы.
3.5.1. Анализ сортов мягкой пшеницы и ячменя .i . при помощи маркеров пшеницы
3.5.2. Анализ аллоплазматических линий .i . .iv с использованием маркеров пшеницы.
3.6. Изучение митохондриальных геномов аллоплазматических линий .i . .iv.
3.6.1. ПЦРанализ локусов мтДНК у аллоплазматических линий .i . .iv
3.6.2. анализ локусов мтДНК у аллоплазматических линий .i . .iv
3.6.2.1. Сравнение спектров мтДНК аллоплазматических линий и их
родительских видов
3.6.3. ПЦРанализ 5 рекомбинационного повтора мтДНК у
аллоплазматических линий .i . .iv
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.
4.1. Особенности ядерного генома у аллоплазматических линий .i . .iv разного происхождения.
4.2. Типы митохондриальных локусов у аллоплазматических линий
пшеницы .i . .iv
ЗАКЛЮЧЕНИЕ.
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Б. Добровольская, Т. Т. Ефремова, Н. П. Калинина, Л. А. Кравцова, Л. И. Лайкова, И. Н. Леонова, Т. С. Раковцева, Е. А. Салина, О. Г. Силкова, И . В. Трубачеева. Е.К. Хлесткина, А. И. Щапова, А. Б. Щербань, В. К. Шумный. Использование молекулярногенетических подходов и методов хромосомной инженерии для изучения и увеличения генетического разнообразия мягкой пшеницы. Отчетная конференция Динамика генофондов растений, животных и человека. Москва, РАН, Программа фундаментальных исследований. С. . Трубачеева Н. В Вильданова Л. Л. Характеристика генома аллоплазматических линий пшеницы с использованием метода. Тезисы международной конференции молодых ученых Современные проблемы генетики, биотехнологии и селекции растений, июля г. Институт растениеводства им. В.Я. Юрьева Украинской Академии аграрных наук, Харьков. С. . О.М. Е.А. V V , i i i i i i i. Ii ii i, , i. Трубачеева , Салина , Нумерова , Першина Л. Н. i . Г. iv . Материалы 2й конференции МОГиС Актуальные проблемы генетики, февраля г. ИОГен РАН, Москва. С. . Трубачеева Н. В., Салина Е. А., Нумерова О. М., Першина Л. Н. i . Т. iv . Международная конференция по отдаленной гибридизации, декабря г. Москва, С. Трубачеева Н. В Нумерова О. М., Салина Е. А. Характеристика ядерного и митохондриального геномов беккроссных потомков ячменнопшеничных гибридов Н. Материалы III съезда ВОГиС Генетика в XXI веке современное состояние и перспективы развития, 6 июня года, Москва. Т.1. С.2. Трубачеева Н. В Адонина И. Г., Салина Е. А., Першина Л. А. Молекулярно генетический и Iанализ геномов аллоллазматических рекомбинантных линий мягкой пшеницы . АН. Я. . Тезисы докладов и стендовых сообщений V Международного совещания и Школы молодых ученых по кариологии, кариосистематике и молекулярной систематике растений, Санкт Петербург, октября г. Трубачеева И. В Салина Е. А., Першина 1. А. Особенности проявления гетероплазмии митохондриальной ДНК у беккроссных потомков ячменнопшеничных гибридов . Н. i АП. Всероссийской научной конференции Структура и экспрессия митохондриального генома растений, Иркутск, сентября г. С. . Н или Нов сорт мягкой пшеницы Новосибирская П или Пир сорт мягкой пшеницы Пиротрикс таг дикорастущий ячмень . ГЛАВА 1. Отдаленная гибридизация широко распространена в природе и является важнейшим фактором формообразования Вавилов, . Считают, что не менее видов покрытосеменных растений произошли в результате отдаленной гибридизации Гершензон, . Основные пути формирования новых видов на основе межвидовых и межродовых скрещиваний это аллополиплоидизация, когда происходит удвоение числа хромосом у исходных гибридов, и гомоплоидное видообразование развитие новых видов без увеличения плоидности. Рассматривая роль полиплоидизации в процессе эволюции, следует подчеркнуть, что в настоящее время, благодаря достижениям сравнительной геномики, приходят к заключению, что многие, если не все виды, которые традиционно относили к диплоидным, фактически являются древними полиплоидами палеополиплоидами . Например, у таких видов, как человек , , дрожжи , , кукуруза . Iiiiv, хромосомный набор в прошлом был удвоен дуплицирован. Затем длительная эволюция полиплоидов сопровождалась масштабными геномными преобразованиями как на генном, так и на хромосомном уровнях , i, . Происходили процессы, направленные на элиминацию большого числа дуплицированных генов, возникновению мутаций и сайленсингу, что противодействовало избытку генетической информации , , и способствовало возвращению геномов в диплоидное состояние . По различным оценкам, от до покрытосеменных растений в своей эволюционной истории прошли через события полиплоидизации , , i, . Возникновение полиплоидных геномов связывают с несколькими механизмами. К ним относят слияние нередуцированных гамет близкородственных геномов автополиплоидия, комбинирование в одном ядре чужеродных геномов с последующим удвоением числа хромосом аллополиплоидия и объединение геномов с частично дивергировавшими хромосомами, состоящими из гомологичных и гомеологичных участков сегментная полиплоидия i,.