Анализ вариабельности структуры кластера рибосомных генов рыжего таракана : Blattella germanika L.

• Автор: Лазебная, Ирина Викторовна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2000
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 145 с. : ил

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Структурнофункциональная организация кластера генов

рибосомных РНК эукариот

1.1.1. Общая характеристика организации кластера генов

рибосомных РНК эукариот

1.1.2. Сравнительный анализ структуры рДНК наиболее изученных

видов насекомых.

1.2. Рибосомная ДК биологический хронометр эволюционного

процесса.

1.2.1. Макроэволюция кластера рибосомных генов

1.2.2. Микроэволюция кластера рибосомных генов
1.3. Характеристика объекта исследований
1.3.1. Биология i i.
1.3.2. Обзор данных по генетике В. i
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
2.1. Перечень видов тараканов, использованных в данном
исследовании.
2.2. Выборки В. i из природных популяций.
2.3. Условия содержания В. i в инсектарии
2.4. Постановка скрещиваний
2.5. Анализ тотальной ДНК тараканов
2.6. Получение зондов и их характеристика
2.7. Методы статистической обработки.
3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ.
3.1. Исследование внутривидовой изменчивости структуры
кластера рибосомных генов рыжего таракана В. i .
3.1.1. Клонирование и анализ первичной последовательности
фрагмента рДНК В. i
3.1.2 Анализ структурной организации кластера рибосомных генов
В. i.
3.1.3. Анализ наследования вариантов структуры кластера
рибосомных генов В. i в индивидуальном
скрещивании
3.1.4. Анализ вариабельности структуры кластера генов
рибосомных РНК в лабораторных линиях и природных
популяциях рыжего таракана
3.2. Изменчивость рДНК в отряде и возможность ее
использования для выявления филогенетических связей
В. i с представителями данного таксона
4. ЗАКЛЮЧЕНИЕ
5. ВЫВОДЫ
6. СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
7. ПРИЛОЖЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ


Вариабельность рДНК в природных популяциях обеспечивает дополнительные генетические маркеры, которые наряду с белковым полиморфизмом и морфологическими признаками используются для мониторинга окружающей среды, а также решения проблем микро и макроэволюции v, ii, , . В настоящее время накоплена обширная информация о структуре рДНК насекомых i, . Алешин и др. ДНК различных видов последовательность расположения генов, чередование их со спейсерными последовательностями в повторах тандемного кластера рДНК и индивидуальных особенностей их микроструктуры тонкое строение генов, высоковариабельньгх районов нетранскрибируемого и транскрибиремых спенсеров, степень внутривидовой изменчивости последних. ДНК, размером от нескольких сот до полутора тысяч пар нуклеотидов . ДНК конкретного вида, а тем более ее внутри и межвидовой изменчивости. При этом, вне поля зрения исследователей часто остаются не только виды, но семейства и даже отряды насекомых, среди которых отряд является одним из древнейших. Представители его многочисленны около видов и сильно различаются по морфологическим и поведенческим признакам. Тараканы занимают различные экологические ниши всеядные синантропные виды лесные виды, перерабатывающие древесину и характеризуются неодинаковыми адаптивными способностями. Самый распространенный в России вид таракана, i отряд , семейство i, является генетически наиболее изученным по сравнению с другими представителями отряда . В отличие от i классического объекта генетических исследований, с детально изученной во всех отношениях структурой рДНК . ДНК. Так, у . Ххромосоме. С учетом типа определения пола у В. XX, самцы ХО, это позволяет исследовать структуру и описывать изменчивость рибосомной ДНК индивидуальных Ххромосом при анализе отдельных самцов популяции. В. i является представителем одного из наиболее древних отрядов класса I , , , , обладает высоким уровнем морфологического и генетического консерватизма. Так, мутационный груз у исследуемого вида составляет 0, 0, на особь, для примера, у дрозофил 0,5 1,5 v , , а у москитов 0,5 3,0 i, i, . Это позволяет рассматривать структуру рДНК В. I и ее исследование является важным для понимания процесса эволюции кластера рибосомных генов в пределах данного таксона. Интерес к генетической структуре популяций В. Кроме того, В. Очевидно, что для проведения сравнительного анализа структуры рДНК В. Отметим отсутствие какихлибо данных на эту тему. Целью настоящей работы являлось изучение структурной организации и полиморфизма кластера ядерных рибосомных генов В. ДНК В. ДНК В. РНК 6 видов из отряда и определение возможности применения ядерной рДНК в качестве маркера филогенетических связей В. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ. В настоящем обзоре описана структура кластера рибосомных генов, присущая большинству эукариотических организмов, и существующие отклонения от нее у низших эукариот, а также показано функциональное значение различных элементов кластера генов рРНК. Поскольку кластер рибосомных генов . На примере ряда видов высших эукариот продемонстрированы существующие у них особенности микроструктуры, определяющие видоспецифичные характеристики последовательности кластера рДНК и особенности регуляции транскрипции. Эта информация представляется актуальной в связи с впервые проведенным нами исследованием структуры кластера рибосомных генов В. ДНК как предковую по отношению к большинству таксонов высших эукариот. В обзоре приводится также фактический материал но использованию кластера рибосомных генов как маркера микро и макроэволюционных событий. Существует множество литературы на эту тему, однако, большинство результатов оказались несопоставимыми и трудно поддавались систематизации изза фрагментарного характера исследований. ДНК для проведения популяционных и филогенетических сравнений. Раздел по биологии исследованных видов был включен в обзор литературы в связи с тем, что тараканы в целом, и даже наиболее изученный из них вид В. РИК эукариот. Общая характеристика организации кластера генов рибосомных РНК эукариот. Гены рибосомных РНК рРНК формируют в геноме эукариот группы тандемно расположенных повторяющихся единиц , i, i, . Каждая из них содержит последовательности, кодирующие 5,8 и рРНК, разделенные некодирующими районами спенсерами рис.