Сравнительный анализ геномов крупного рогатого скота и овец

• Автор: А.К.М. Абдул Ахад Бисвас
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2004
• Место защиты: Санкт-Петербург
• Количество страниц: 166 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Краткий исторический очерк генетических исследований

1.2. Методы анализа локализации генов. Генетические и физические карты

1.3. Генетические маркеры в селекции животных

1.4. Генетические маркеры в филогенетических

исследованиях

1.5. Механизмы эволюции хромосомного набора

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ

3.1. Характеристика генома крупного рогатого скота
3.2. Гсииые карты у крупного рогатого скота
3.3. Характеристика генома овец
3.4. Генные карты у овец
3.5. Сравнение генных карт и анализ дивергенции
кариотипов . и vi i .
3.6. Сиитенные генетические карты домашней овцы
ОБСУЖДЕНИЕ
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКОЕ ПРЕДЛОЖЕНИЕ
СПИСОК РСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность


Амплификация определенного гена методом ПЦР, с одновременным его мечением, во много раз повышает чувствительность метода в сравнении с классической гибридизацией i i. Применение различных методов картирования привело к созданию двух видов карт физической и генетической. Физические карты отражают реальное положение гена на хромосоме, а генетические их расстояние друг от друга и реперной точки в единицах перекреста сМ. Карты сцепления и физические карты дают тождественное отображение генных последовательностей. Однако расстояния между генами на них различается, что связано с вариабельностью частоты рекомбинации по длине хромосом. Конструирование физических карт ведется на основе прямого определения положения генов на хромосоме методом гибридизации i i с учетом дифференциальной структуры хромосом. Существенным дополнением этого метода является сравнительный анализ генных карт разных видов, основанный на явлении консерватизма групп синтеиии у разных видов животных. В основе построения генетических карт лежат феномен мейотического кроссинговера, методы гибридологического и популяционногенетического анализа. Среди сельскохозяйственных животных наиболее изучен геном крупного рогатого скота и свиньи. Для этих видов существуют достаточно подробные генетические и физические карты. Физическая карта у этого вида отсутствует. У лошади работы по картированию хромосом находятся в начальной стадии исследования. Считается, что для построения генной карты, приемлемой для анализа генома, расстояние между маркерами не должно превышать сМ i . ., . Было подсчитано, что для построения генетической карты крупного рогатого скота с разрешением сМ необходимо, как минимум 00 маркеров. Однако если учесть то, что маркеры выделяются случайным образом, эта стратегия становится мало эффективной и уже требуется не менее 0 маркеров для достижения полноты карты с такими промежутками . ., М. Маркеры должны быть мультиаллельными и обладать высоким уровнем гетерозиготности или высоким уровнем полиморфизма РС i . Значение РС, показывающее пригодность показателя информативности для генетического картирования и рассчитывается по частоте встречаемости аллелей в популяции . .. С. М. . Карты сцепления с низкой плотностью маркеров, полученные при использовании независимых семейств, были опубликованы для крупного рогатого скота . i . . . . . . . . i . . . . . . Vi . Генетическая карта крупного рогатого скота, опубликованная М. М. Карта, описанная . Тогда же появляются первые обобщающие работы, результатом которых становятся карты физически закрепленных групп сцепления, как, например карта, предложенная i . . . X и Ухромосомами плюс небольшое число незакрепленных групп, покрывающих сМ генома крупного рогатого скота. Эти карты были использованы для идентификации некоторых локусов хозяйственнополезных признаков у крупного рогатого скота локус комолости М. Позднее был выявлен локус, ответственный за генетическую болезнь прогрессирующую дегенеративную миелоэнцефалопатию v синдром М. М. i С. i С. У овец аналогичным образом были выявлены локус плодовитости . . . . . . В это же время у свиней были вскрыты локусы, определяющие жирность и скорость роста i. i . .. . В нее были включены маркеры 1 и II типов из существующих карт, а также 0 новых микросателлитных маркеров. Для построения карты было использовано 9 гетерозиготных маркеров, из которых 9 микросателлиты и структурные гены. В среднем, на каждую хромосому приходилось 8,2 маркера от 2 до . Средняя генетическая дистанция составила 9, сМ для ,1 карты расстояние меньше сМ и для 4. М. Общая протяженность карты составляла сМ . . . Большинство этих локусов было картировано на участках хромосом с расстоянием между маркерами более сМ.