Аллельные варианты генов подверженности туберкулезу у тувинцев

• Автор: Рудко, Алексей Анатольевич
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2004
• Место защиты: Томск
• Количество страниц: 114 с. : 9 ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

Список сокращений .

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Клиникоэпидемиологические сведения о значении наследственной подверженности к туберкулезу у человека
1.2. Ассоциации генетических маркеров с подверженностью и резистентностью к туберкулезу концепция геиовкандидатов.
1.3. Результаты анализа сцепления и полногеномного скрининга в исследовании наследственной компоненты подверженности к туберкулезу
1.4. Геном возбудителя М. i и особенности клинических проявлений туберкулеза у человека

1.5. Заключение

Глава 2. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ.

2.1 Характеристика обследованных выборок.

2.2. Молекулярногенетические методы анализа полиморфизма генов
2.3. Генетикостатистические методы анализа
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.
3.1. Популяционные особенности полиморфизма генов 1, V,
I, I1, I населения Республики Тыва
3.2. Анализ ассоциаций полиморфизмов генов 1, V, I, 11, I1 с туберкулезом и его клиническими формами у коренного населения Республики Тыва
3.3. Результаты исследования взаимосвязи полиморфизмов генов с патогенетически значимыми для туберкулеза признаками.
3.3.1. Анализ ассоциаций изученных полиморфизмов генов с патогенетически значимыми для туберкулеза количественными признаками.
3.3.2. Анализ ассоциаций изученных полиморфизмов генов с патогенетически значимыми для туберкулеза качественными признаками
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Таким образом, учитывая мультифакториалы ую природу ТБ, всестороннее изучение факторов, в том числе и генетических, способствующих развитию этого заболевания, должно в конечном итоге привести к определению причин, лежащих в основе межпопуляционных различий распространенности этой инфекции, что в свою очередь в будущем может привести к созданию более эффективных методов борьбы с ТБ. Цель исследования Изучить популяционную распространенность полиморфных вариантов геновкандидатов подверженности к туберкулезу, их патогенетическую значимость в развитии заболевания и его клинических проявлений у тувинцев. Оценить частоты аллелей и генотипов по маркерам геновкандидатов подверженности к туберкулезу ген макрофагального белка, ассоциированного с естественной резистентностью ТУКАМР1, рецептора к витамину Б УОЯ, домена В интерлейкина 1Ы2В, домена В интерлейкина 1 1ЫВ, антагониста рецептора к интерлейкину 1 1ЫЯТУ у коренного населения Республики Тыва. Изучить гаметическое неравновесие по аллельным вариантам исследуемых генов в тувинской популяции. Изучить связь полиморфизма генов АГЯАМР1, УОЯ, 1ВВ, 1ЫВ и 1ЫЯ1Г с туберкулезом и его отдельными клиническими формами инфильтративная, диссеминированная, фибрознокавернозная у тувинцев. Изучить ассоциации полиморфных вариантов исследуемых генов с качественными и количественными патогенетически значимыми для туберкулеза признаками у больных. Получены новые знания об особенностях структуры генофонда коренного населения Республики Тыва по генам ККЛМР1, УЛЯ, 1Ы2В, 1Ь1В и 1Ы1Ш. Впервые изучено влияние полиморфных вариантов комплекса геновкандидатов подверженности к туберкулезу на развитие различных клинических форм заболевания. Выявлена ассоциация цолиморфизма 0А гена АГЯЛМР1 с туберкулезом у тувинцев. Впервые оценена роль генов 1, УИЯ, 1Ы2В, 1ЫВ и 1ЫЯЛГ в изменчивости комплекса качественных и количественных, патогенетически значимых при туберкулезе признаков. Установлена связь изученных полиморфизмов генов АГЯАМР1, УПК и 1ЫК1 с клиническими проявлениями туберкулеза. Полученная информация о полиморфизме геновкандидатов подверженности к туберкулезу у тувинцев может быть использована в эволюционной геномике для анализа структуры генофондов мирового народонаселения и создания геногеографических карт, а также в генетической эпидемиологии инфекционных заболеваний. Сведения о вкладе полиморфных вариантов геновкандидатов подверженности к туберкулезу в изменчивость патогенетически значимых при туберкулезе признаков, и формирование клинического полиморфизма заболевания могут быть учтены при формировании групп риска и организации профилактических мероприятий. Тувинский генофонд характеризуется низким уровнем генной дифференциации по исследованным аллельным вариантам, неравновесием по сцеплению между маркерами гена и гаметическим неравновесием между аллелями генов, расположенных на разных хромосомах 1 и I, I1 и V. Изученные аллели генов 1, V, I, I1 и I1 не вносят существенного вклада в развитие конечного фенотипа туберкулеза. Изменчивость генов 1, V, I1 является одним из факторов формирования клинического полиморфизма эндофенотипов туберкулеза, оказывая влияние на варьирование количественных и качественных, патогенетически значимых для заболевания, признаков. Аллельные варианты 3, 4СТ, 9 гена , и ВЬ гена V, V полиморфизм гена I1 могут служить маркерами особенностей клинического течения туберкулеза. Результаты работы были отмечены дипломом лауреата II степени и премией им. С.П. Карпова на конкурсе научных работ Томск, , дипломом III степени на конкурсе молодых ученых Национального конгресса по болезням органов дыхания СанктПетербург, . Публикации. По теме диссертации опубликовано работ. Структура и объем диссертации Диссертационная работа изложена на 3 страницах машинописного текста и состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, собственных результатов и их обсуждения, заключения и выводов. Библиографический указатель включает 7 источников, из них работ отечественных авторов.