Генетический полиморфизм мультилокусных маркеров и генных последовательностей ДНК в природных популяциях Drosophila melanogaster Северной Евразии

• Автор: Ваулин, Олег Викторович
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Новосибирск
• Количество страниц: 132 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ

Список сокращений

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Маркеры генетической изменчивости популяций

1.1.1. Фенотипическая изменчивость и моды на мутации в природных популяциях i

1.1.2. Рецессивные летальные мутации как компонент генетического груза популяций частота возникновения и концентрация

1.1.3. Хромосомные перестройки цитогенетические маркры геномов и генофондов

1.1.4. Изменчивость по изоферментным маркрам

1.1.5. Изменчивость, выявляемая с помощью ДНКмаркеров

1.1.5.1. Мультилокусные маркеры ДНК

1.1.5.2. Микросателлитные маркеры
1.1.5.3. Анализ нуклеотидных последовательностей фрагментов ДНК
1.1.6. Мобильные генетические элементы
1.2. Формирование и поддержание генетической изменчивости в
популяциях
1.2.1. Спонтанный мутационный процесс
1.2.2 Отбор
1.2.3. Миграция
1.2.4. Генетический дрейф
Глава 2. Материалы и методы
2.1. Исследованный материал
2.2. Методы работы с ДНК
2.2.1. Выделение ДНК
2.2.2. Полимеразная цепная реакция
2.2.3. Электрофорез
2.2.4. Секвенированис
2.3. Статистическая обработка результатов
Г лава 3. Результаты
3.1. Особенности генетической изменчивости в популяциях i северной Евразии
3.2. Динамика изменчивости геномной ДНК в популяции . Умани с по годы
3.3. Популяционная изменчивость фрагмента ДНК гена i
3.4. Популяционная изменчивость фрагмента ДНК гена i
Глава 4. Обсуждение
4.1. Межпопуляционная изменчивость по маркерам i
4.2. Временная динамика Iмаркеров в популяции i Умани
4.3. Особенности оценки мер генетического расстояния
4.4. Изменчивость по гену алкогольдегидрогеназы в североевразийских популяциях i
4.5. Географическая изменчивость по фрагменту гена i
Заключение
Выводы
Литература


Результаты работы следует учитывать при изучении популяционной динамики у i и других видов, имеющих модельное или хозяйственное значение. Структура и объем работы. Работа изложена на 8 страницах, включает 9 рисунков и таблиц. Список цитируемой литературы включает 6 наименований. Апробация работы. Результаты работы были представлены на 4й Общероссийской межвузовской конференция студентов, аспирантов и молодых ученых Наука и образование Томск, й Международной научной студенческой конференции Студент и научнотехнический прогресс Новосибирск, НГУ, 3м съезде ВОГиС Москва, й Пущинской школеконференции молодых ученых, посвященной летию Пущинского НЦ РАН Пущино, конференции Современные проблемы биологической эволюции, посвященной 0летию Государственного Дарвиновского музея Москва, международной конференции Развитие эволюционной идеи в биологии, социологии и медицине, посвященной летию со дня рождения академика Д. К. Беляева Новосибирск, отчтных конференциях Динамика генофондов растений, животных и человека Москва, , , отчтной сессии Института цитологии и генетики СО РА Новосибирск, . По результатам диссертации, опубликовано научных работ, из них 6 статей в журналах, в которых, согласно требованиям ВАК, должны быть опубликованы работы кандидатских диссертаций. Глава 1. Чтобы изучить внутри и межпопуляционный полиморфизм, понять особенности его формирования, причины его пространственных и временных изменений следует выбрать удобные для исследования и адекватные поставленным задачам признаки маркеры изменчивости. Практически все признаки живых организмов морфологические, физиологические, поведенческие, молекулярные, имеют генетическую компоненту, то есть могут быть использованы как маркеры генотипической изменчивости. Следует отметить, что, вопервых, почти всегда вопрос заключается в том, в какой степени признак определяется генетической составляющей, а в какой модифицируется влиянием внешней среды или другими факторами. Вовторых, приходится решать задачу сопоставления и экстраполяции получаемых на основе применения разных маркеров оценок генетического разнообразия. Цель данного раздела работы рассмотреть, охарактеризовать и сравнить особенности групп используемых в биологии генетических маркеров фенотипических вариаций, летальных мутаций, хромосомных перестроек, различных типов молекулярногенетических маркеров. Проведнный обзор маркеров генетической изменчивости кратко обобщн и систематизирован в табл. Таблица I. Типы и особенности генетических маркеров, используемых в популяционных исследованиях Алтухов, Рубцов, Ваулин, данная работа. Видимые мутации Спонтанный мутационный процесс, нее типы мутаций по механизму возникноиения. Фенотипический и генетический анализ. Субьсктивиость в выявлении мутантов низкая сравниваемость результатов, получаемых разными исследователями. Рецессивные летальные мутации Спонтанный мутационный процесс, делении, эффекты сверхдомнннрования. Генетический анализ использование стандартизированных генетических методов выделения РЛМ. Объективность в оценке частоты возникновения и концентрации мутаций как в отдельных локусах и хромосомах, так и в целом генофонде популяций. Хромосомные перестройки Спонтанный мутационный процесс разрывы и воссоединение хромосом эффекты сверхдоминировання, естественный отбор. Световая и флюоресцентная мнкросхопия цитогенетический анализ хромосом. Разрешающая способность метода в сильной степени зависит от особенностей строения митотические или мейотичсскне, полнтенные и размера хромосом вида размера и типов использованных в анализе хромосомных перестроек. Изофермеитные маркеры Спонтанный мутационный процесс эффекты сверхдомнннрования естественный отбор. Биохимический анализ, электрофорез белков с последующим специфическим окрашиванием. Для некоторых видов отмечена клинальная изменчивость полиморфизма по определенным изоферментам, указывающая на онрсслснную роль отбора зависимость между изменчивостью ферментовмаркеров и их функциональной значимостью. Мультилокусныс маркеры ДНК, выявляемые методом Спонтанный мутационный процесс.