Молекулярно-генетический анализ эндогенных ретровирусов у некоторых пород свиней и диких кабанов

• Автор: Айтназаров, Руслан Бейшеналиевич
• Шифр специальности: 03.00.15, 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2006
• Место защиты: Новосибирск
• Количество страниц: 158 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

Список сокращений.

Введение .

Глава I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1 1. Происхождение и эволюция домашних свиней.

1.1.1. Систематика свиней

1.1. 2. Дикий кабан.

Г. 1 3. Домашние свиньи

1.2. Исследованные в работе популяции домашних свиней

1. .Тз истории создания отечественных минисвиней

I. 3. Использование иммуногенстических показателей крови

в.качестве генетических маркеров.
1 3. 1 Иммуногенетические системы сывороточных
аллотипов свиньи.
1 2. Общие сведения о строении, функции классах и
биосинтезе липопротеинов сыворотки крови
1. 3. 3. Структура и функции амакроглобулинов.
1. 3.4. Иммуногенетическая система аллотипов
сывороточных, иммуноглобулинов.
1.4. Картирование генома свиньи.
1.4.1. Генстическая.карта свиньи.
1. 5. Ретровирусы Общая харакгеристика ретровирусов.
1 5.1. Эндогенные ретровирусы свиней РЕИУ и проблемы
ксенотрансплантации.
Г. 5. 2. Молекулярная характеристика РЕИУ.
Г. 5. 3. Филогенетический анализ РЕИУ
Г. 5. 4. Разработка диагностических методов для контроля за
экспрессией и передачей РЕНУ
1. 5. 5. Экспрессия ивыделение РЕКУ клетками свиньи
1. 5. 6. Тропизм РЕИУ к клеткам человека
Г. 5. Ретроспективные исследования набольных, при лечении
которых использовали биологический
трансплантационный материал от свиньи
1. 5 8. Использование некоторых видов мелких животных в
качестве биологической модели. ,
1 . Использование приматов в качестве модели
1 5 . Патогенныйпотенциал РЕКУ.
1. 5. Данные о картировании и локализации РЕКУ
Глава II МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
Т. Материалы исследований
2 1. Р. Характеристика исследуемых животных .
2.1 2. Получение охранение биологического материала
2. V. 3 Характеристика аллоантисывороток
2 2 Мегоды исследований
2. 21. Выделение ДНК.
2. 2. 2 Праймеры.
2 ПЦРанализ.
I ,
2 2. 4 Определение аллотипов сывороточных. белков
2.3. Статистическая, обработка1 результатов
2. 4. Компьютерные базы данных.
Глава III. РЕЗУЛЬТАТЫ
3. 1. Генотипирование РЕКУ разных популяций домашних свиней и
диких кабанов. . 8Г
3.1.1. Наличие РЕКУ разных типов в популяциях домашних
свиней и диких кабанов
3.1. 2. Влияние генотипа и среды на частоту носителей
различных типов РЕКУ у диких кабанов и домашних свиней
3.1. 3. Попарное сравнение выборок по частотамносителей
различных типов РЕКУ
3.1. 4. Отцовский и материнский эффект на частоту V у
потомков.
3. 2. Иммуногенетическое изучение полиморфизма сывороточных
белков у домашних свиней и диких кабанов
3. 2.1. Иммуногенетический анализ среднеазиатского дикого
кабана.
3.3. Изучение ассоциаций различных типов V с аллотипами сыворотки крови и полом животных в популяциях домашних свиней и диких кабанов
3. 4. Изучение ассоциаций между наличием различных типов
V в геномах домашних свиней и диких кабанов.
Глава IV. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
4.1. V разных типов в популяциях домашних свиней и диких
кабанов
4. 2. Разнообразие популяций диких и домашних свиней по
комплексу аллотипов сыворотки крови
4.3. Ассоциации V разных типов с генетическими маркерами в
популяциях домашних и диких свиней.
Выводы.
Список литературы


Сибирские минисвиньи апробированы в ряде медицинских и биологических институтов Сибири для моделирования атеросклероза, механизма взаимодействия гетерогенных тканей в плаценте, патогенеза язвы желудка и двенадцатиперстной кишки, влияния стрессапри трансплантации кожи и сосудов Тихонов, Горелов и др. Впервые сердечные клапаны минисвиней для пересадки человеку были использованы в Кемеровском кардиологическом центре Тихонов, Горелов и др. Несколько лет успешного использованияклапанов свиных сердец в качестве биопротезов показали, что в отличие от зарубежных аналогов, онигораздо дешевле и более надежны. В Институте патологии кровообращения им. МешалкинаМЗ РФ проводятся исследования по трансплантации сердца, клапанов, кровеносных сосудов и других тканей у минисвиней. В Новосибирском научноисследовательском институте травматологии и ортопедии М3 РФ па минисвиньях ведутся исследования по коррекции сколиоза. Перечисленные проблемы обусловливают актуальность изучения эндогенных ретровирусов РЕЯУ типов, А, В и С у лабораторных минисвиней, созданных для медикобиологических исследований в ИЦиГ СО РАН, а также у некоторых родоначальных пород домашних свиней и диких кабанов. Целью исследования является выявление эндогенных ретровирусов типов А, В и С в геномах лабораторных минисвиней и их некоторых родоначальных пород, а также изучение факторов, влияющих на частоту встречаемости РЕЯУ. Изучить частоту встречаемости эндогенных ретровирусов разных типов у нескольких пород домашних свиней и диких кабанов. Оценить влияния средовых условия содержания и обитания и генетических факторов породы и подвиды на наличие разных типов ретровирусов в геноме домашних и диких свиней. Провести анализ ассоциаций различных типов эндогенных ретровирусов между собой и традиционными генетическими маркерами, использовавшимися при селекции свиней. Впервые изучена порода лабораторных сибирских минисвиней на наличие эндогенных ретровирусов РЕУ типов А, В, С. Показано, что эндогенные ретровирусы типа Л, В и С широко распространены у лабораторных миниатюрных свиней. Обогащенность геномов животных этой породы, ретровирусами, вероятно, обусловлена внесением их от породоснователей. В то же время среди породоснователей диких и домашних свиней имеются животные, свободные от некоторых типов эндогенных ретровирусов. Поскольку существует опасность активации эндогенных ретровирусов свиней при ксенотрансплантации, необходимо учитывать, что частота встречаемости эндогенных ретровирусов в некоторых выборках домашних и диких свиней существенна. На наличие эндогенных ретровирусов разных типов в популяциях свиней оказывает влияние не только порода подвид, но и условия содержания обитания. При селекции и разведении свиней для медикобиологических исследований необходимо строгое соблюдение зоогигиенических норм. В ходе работы выявлены ассоциации эндогенных ретровирусов свиней с разными, генетическими маркерами и полом животного, которые могут быть использованы в дальнейших научных исследованиях и при селекции. Метод однофакторного дисперсионного анализа, кластеризация методом двух главных компонент и семейный анализ пометов свиньи крупной, белой породы, показали достоверное влияние факторов среды условия содержания и обитания на частоту носителей V в популяциях домашних и диких свиней. Выявлены ассоциации ретровируса V типа А с локусами эритроцитарных антигенов ЕЛЕ, ЕАК,. и полом животных, а также ассоциации ретровируса V типа В с локусами аМ,. ЕЛЕ и у разных подвидов диких кабанов Показана ассоциациямежду V типов А и некоторых пород свиней. Высказанагипотеза о. V могут выступать в качестве инфекционного вируса. Материалы исследования были представлены на XII Международнойконференции Новые информационные технологии в. ЯлтаГурзуф на международном конгрессе i i. i i, на международной научнопрактической конференции молодых ученых СО РАСХН Новейшие направления развития Новосибирск, на, Сибирском Актуальные вопросы ветеринарной медицины Новосибирск, наотчетной конференции Динамика генофондов растений, животных и человека Москва, на отчетной сессии ИЦиГ СО РАН Новосибирск, . По теме диссертации опубликовано работ.