Генетическая дифференциация нерки (Oncorhynchus nerka) азиатских стад

• Автор: Хрусталева, Анастасия Михайловна
• Шифр специальности: 03.00.10
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2007
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 233 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
Введение

Глава 1. Сравнительная характеристика методов дифференциации стад нерки.

1.1. Особенности распространения и биологии нерки.

1.2. Популяционная организация нерки.

1.3. Обзор методов исследования популяционной структуры

1.3.1 .Морфологические методы

1.3.2. Паразитологические методы.

1.3.3. Мечение.

1.3.4. Генетические методы.

1.3.4.1. Иммуногенетические маркеры группы крови рыб.

1.3.4.2. Биохимические маркеры аллозимы
1.3.4.3. Молекулярногенетические маркеры
Маркеры митохондриальной ДНК.
ИТЕРмаркеры.
АЕЬРмаркеры.
КАРИмаркеры.
Микросателлитные последовательности ДНК
БНРмаркеры
1.3.4.4. Выбор молекулярных маркеров ядерной ДНК для
популяционногенетических исследований.
Глава 2. Материалы и методы.
2.1. Сбор материала
2.2. Обработка данных биоанализа и определение возраста
2.3. Методики молекулярногенетического анализа
2.4. Статистическая обработка данных.
Глава 3. Эффективность использования различных типов маркеров для изучения популяционной структуры и определения популяционной принадлежности нерки Западной Камчатки
3.1. Биологические показатели нерки рек западного побережья Камчатки.
3.2. Молекулярные ДНКмаркеры в изучении популяционной структуры и определении популяционной принадлежности
нерки Западной Камчатки
3.2.1. КАРОмаркеры
3.2.2. Микросателлитные маркеры
3.2.3. БИРмаркеры.
3.3. Сравнение эффективности биологических и молекулярных ДНК маркеров.
3.4. Основные выводы.
Глава 4. Сезонная и межгодовая генетическая изменчивость нерки Камчатки.
4.1. Полиморфизм микросателлитных локусов ДНК в смежных поколениях и подходах нерки р. Большая.
4.2. Сезонная изменчивость микросателлитной ДНК нерки в бассейне р. Камчатка
4.3. Основные выводы.
Глава 5. Дифференциация стад азиатской нерки.
5.1. Размерновозрастная структура нерки некоторых азиатских
5.2. Межлопуляционная генетическая дифференциация
азиатской нерки
5.3. Основные выводы.
Выводы.
Список литературы


Одна из главных проблем, возникающих при анализе морфологических признаков, их модификационная изменчивость, обусловленная переменными воздействиями факторов внешней среды. Наличие такой модификационной изменчивости во многих случаях ставит под сомнение правомерность выделения морфологически различающихся совокупностей рыб в качестве репродуктивно изолированных группировок Алтухов, . Попытки разграничения эпигенетической и наследственной компонент изменчивости морфологических признаков неоднократно предпринимались ранее Кирпичников, Алтухов, i, , . Таким образом, выбор признаков, привлекаемых к анализу, а также определение их оптимального количества, представляют собой достаточно сложную задачу, от решения которой зависит успех выявления популяционной струюуры вида Бобырев, . В каждом конкретном случае необходимо выбрать маркер наиболее подходящий для решения поставленной задачи. Водные биологические ресурсы. В то же время некоторые морфометрические признаки оказываются непригодными для анализа в силу присущей им значительной модификационной изменчивости. Другие обладают недостаточной межпопуляционной вариабельностью, чтобы служить надежным диагностическим показателем, что, как правило, свойственно меристическим признакам , , , . Помимо прочего, выбор морфологических признаков, используемых в анализе, осложняется еще и тем, что изза взаимной коррелировашюсти многих из них информация, содержащаяся в данных измерений, может существенно перекрываться. В подобных случаях обычно применяются многомерные статистические процедуры снижения размерности Айвазян и др. Как известно экстерьерные особенности тихоокеанских лососей существенно меняются при формировании у рыб брачного наряда Глубоковский, . В связи с этим, традиционным подходом к устранению компонент морфологической изменчивости, обусловленных половым диморфизмом либо изменением размеров тела рыб в процессе роста, является использование относительных показателей, или индексов признаков Правдин, . Появившиеся к настоящему времени методы так называемой геометрической морфометрии позволяют решать эту проблему гораздо более эффективно, за счет визуализации возрастных и ростовых модификаций пропорций тела и их корректного математического описания . i, i, . Совершенствование способов обработки и интерпретации данных о морфологической изменчивости рыб связано с привлечением все более эффективных процедур статистического анализа, в первую очередь с переходом от одномерных к многомерным статистическим методам. Айвазян и др. Предпосылкой к развитию морфометрических методов исследования популяционной структуры нерки явился тот факт, что средние размеры и пропорции тела особей даже на объединенных многолетних материалах обнаруживают связь с географической широтой места расположения устья реки обитания Бугаев, . Морфологические признаки ранее использовались для дифференциации крупных группировок нерки отдельных популяций или рас. Большинство работ ставили целью разделение азиатской и американской нерки , . , , , некоторые из них выделение сезонных рас Берг, . Усовершенствованный морфологический метод использовался для изучения популяционных взаимодействий различных субизолятов, а также сезонных рас нерки оз. Азабачьего Глубоковский, . Краниологические характеристики нерки оз. Азабачьего использовались для анализа внутрипопуляционной морфологической изменчивости и выявления морфотипов разных субпопуляций Коновалов, . Из существующих фенетических маркеров для дифференциации популяций тихоокеанских лососей ихтиологи чаще всего используют различия в структуре чешуи i, i, Крогиус, , , , . , Коновалов, Куликова, , , x, , , , , Каев, , , Запорожец, Запорожец, Кловач, Заварина, Запорожец, Кловач, Темных и др. Темных, v, а 6. Известно, что формирование структуфных элементов чешуи зависит от условий роста рыбы Мина, Клевезаль, .