Формирование филогеографической структуры и генетического разнообразия парнокопытных млекопитающих : Artiodactyla, Ruminantia

• Автор: Холодова, Марина Владимировна
• Шифр специальности: 03.00.08
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2006
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 256 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ стр.

Глава 1. ПОСТАНОВКА ПРОБЛЕМЫ И ВЫБОР ОБЪЕКТОВ ИССЛЕДОВАНИЯ

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

Глава 3. ОСОБЕННОСТИ ВЫДЕЛЕНИЯ ДНК ПРИ ИСПОЛЬЗОВАНИИ ОБРАЗЦОВ ТКАНЕЙ РАЗЛИЧНОЙ СОХРАННОСТИ
Глава 4. ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И ФИЛОГЕОГРАФИЯ МОДЕЛЬНЫХ ВИДОВ ПРЕДСТАВИТЕЛИ РАЗНЫХ СЕМЕЙСТВ ПОДОТРЯДА
II

4.1. Сайгак i i сем. vi

.4.2. Монгольский дзсрен сем. vi

4.3. Европейский лось . сем. vi.

4.4. Кабарга i сем. i

Глава 5. ВЗАИМОСВЯЗЬ МЕЖДУ ДИНАМИКОЙ ЧИСЛЕННОСТИ И ГЕНЕТИЧЕСКИМ

РАЗНООБРАЗИЕМ ПОПУЛЯЦИЙ.
Глава 6. ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ У ЖВАЧНЫХ ПАРНОКОПЫТНЫХ МЛЕКОПИТАЮЩИХ В ЗАВИСИМОСТИ ОТ ОСОБЕННОСТЕЙ ИХ РАЗМНОЖЕНИЯ
Поддержание генетического разнообразия при нестабильной численности у видов с разной скоростью размножения
Особенности поддержания, генетического разнообразие ужвачных с различной системой спаривания у полигамных и моногамных видов
Возрастной кросс
Глава 7. ЗАКОНОМЕРНОСТИ ФОРМИРОВАНИЯ ФИЛОГЕОГРАФИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ И ПОД ДЕРЖАНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ В ЗАВИСИМОСТИ ОТ ЭКОЛОГИЧЕСКИХ ОСОБЕННОСТЕЙ ВИДОВ
Формирование филогеографической структуры и
генетического разнообразия у видов с различной степенью пищевой и биотопической специализации Филогеографическая структура и генетическое разнообразие у оседлых и мигрирующих видов
Глава 8. ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ДАННЫХ ПО ПОЛИМОРФИЗМУ мтДНК ДЛЯ РЕКОНСТРУКЦИИ ИСТОРИИ ВИДОВ И ПОПУЛЯЦИЙ
Характеристики гаплотипического и нуклеотидного разнообразия .
как отражение истории популяций
Анализ структуры филогенетических деревьев и частотного распределения парных различий между гаплотипами Молекулярногенетические характеристики и длительность существования видов подвидов как отдельных эволюционных линий
Индекс утраты генетического разнообразия
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


В качестве модельных видов были выбраны сайгак , монгольскйй дзерен Ь сем. Воу1сае, лось п9 сем. Сетс1ае и кабарга п сем. МозсЫбае. Дополнительно для решения отдельных задач использованы оригинальные и литературные данные по другим видам жвачных парнокопытных Табл. Приложении. Таблица 2. Сайгак Республика Калмыкия, РФ Арылов Ю. Н., Близнюк А. И., Букреева О. М., Лущекина , Сорокин П. А., Сидоров С. В., Холодова М. Калмыкия Музейные образцы Зоомузей МГ ЗИН, Зоол. УстьУрт Казахстан Грачев Ю. БстпакДала, Казахстан Грачев Ю. Кабарга Алтай 6 Приходько В. Вост. Сибирь Приходько В. Д. Восток 7 Приходько В. И., Зайцев В. Сахалин 5 Приходько В. Монгольский Дзерен Вост. Монгол Кирилюк В. Е. Сорокин П. Забайкалье Р 4 Кирилюк В. Лось Европейская Часть РФ Давыдов , Рожков Ю. Урал Марков Н. Зап. Чукотка 5 Сипко Т. П., ЖелезновЧукотский Н. Якутия 8 Сипко Т. Камчатка 3 Сипко Т. Северный олен Мурманская обл. Ямал 7 Мирутенко В. Таймыр 2 Мирутенко В. Якутия 9 Сипко Т. Чукотка Ситпсо Т. О.Врангеля дом. Сипко Т. Благородный олень Воронежкий Заповедник 5 Казьмин В. Англия Холодова М. Европейская косуля Сочинский нац. Семенов У. Всем коллегам, помогавшим в сборе образцов, я приношу искреннюю благодарность. Кроме того, для сайгака п и монгольского дзерена гг4 использованы образцы из музейных коллекций ЗИНа и Зоологического музея МГУ. При отборе материала оказывали помощь сотрудники этих музеев д. И.Я. Павлинов, к. А.Н. Тихонов и другие, которым автор приносит искреннюю благодарность. ДНК Холодова и др. Контроль за загрязнением. ДНК обязательно использовалась
пробирка со всеми реактивами, но без исследуемых проб . Если в ней обнаруживалось присутствие ДНК, то процесс повторяли вновь. Специфика большинства образцов, включающих шерсть, кусочки шкур, рогов и костей, собранных в полевых условиях безвредными для изучаемых популяций методами, а также образцов из музейных коллекций, потребовала разработки специальных методов выделения ДНК Холодова и др. Важным компонентом методической части работы было апробировать и оптимизировать методы выделения для разных типов образцов разной степени сохранности. Среди ряда апробированных методов наиболее пригодным для работы с обрацами шерсти был метод с использованием реагента x 0 i, США. В работе применялись разные модификации этого метода по прописи производителя, по протоколу, используемому в криминалистике . Департаменте Рыбы и дичи США. Также
введены некоторые изменения, улучшающие эффективность выделения см. Проведен анализ оптимального количества шерстинок для одного выделения ДНК. Проведена оценка средней доли удачных выделений из линной шерсти оленей, собранной в полевых условиях. Ткани мышц кожи и плаценты животных, помещнные в спирт , использовали для выделения ДНК с помощью препарата x 0, i, США. Небольшое количество ткани помещали в пробирку 1,5 мл, с 0мкл 5 раствора x 0 и мкл протеиназы К 0мкгмл и термостатировали при С в течение часа или при С в течение ночи. После перемешивания на вортексе в течение сек термостатировали при 0 С 8 мин. Далее содержимое пробирки перемешивали на вортексе в течение сек. Верхняя, прозрачная часть содержимого использовалась для амплификации. Также использовался стандартный фенолхлороформный метод выделения ДНК . В пробирку 1,5мл с 1мл визирующего буфера Трис 0,1 М, ЭДТА 0,1М, 0, М, 1 и мкл протеиназы К 0мгмл помещали кусочек ткани кожа, мышцы размером мм. После перемешивания термостатировали при температуре С часов. К 0,5 мл полученной суспензии добавляли 0,5мл фенола и перемешивали, переворачивая пробирку снизу вверх. Далее центрифугировали мин. Супернатант помещали в новую пробирку и добавляли 0,5 мл хлороформа. Перемешивали, переворачивая пробирку, и затем центрифугировали мин. Супернатант переносили в новую пробирку и добавляли мкл 5. После
этого доливали до верха спирт и перемешивали. Полученную смесь помещали в холодильник С на ночь. Затем центрифугировали мин на тыс. Данный метод выделения позволяет получить ДНК, которая обладает высокой стабильностью и может храниться в холодильнике неопределнно долгое время.