Новые актиномицеты семейства Microbacteriaceae, ассоциированные с нематодами подсемейства Anguininae

• Автор: Дорофеева, Любовь Владимировна
• Шифр специальности: 03.00.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2002
• Место защиты: Пущино
• Количество страниц: 138 с. : ил

СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Глава 1. Современная система классификации актиномицетов

основывается на принципах полифазной таксономии

1.1. Фенотипические признаки, используемые для классификации

и идентификации актиномицетов.

1.2. Характеристики генома, используемые в классификации и

идентификации актиномицетов.

Глава 2. Систематика и экология актиномицетов семейства

МкгоЪасипасеае.

Глава 3. Актиномицетнонематодные комплексы
3.1. Краткая характеристика нематод подсемейства Авдшшпае
3.2. Актиномицетнонематодные комплексы
ЭКСГШРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
Глава 4. Материалы и методы
4.1. Объекты исследования
4.2. Обработка галлов и посев образцов.
4.3. Изучение морфологических и культуральных признаков
4.4. Изучение физиологобиохимических признаков
4.5. Изучение хемотаксономических признаков
4.6. Молекулярногенетические методы.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Глава 5. Выделение микроорганизмов.
Глава 6. Таксономическое изучение актиномицетов с диаминомасляной
кислотой ДАМК в клеточной стенке.
6.1. Штаммы ВКМ Аст, ВКМ Ас и близкие организмы
6.2. Штаммы ВКМ Асг и ВКМ Ас5 из галла на
6.3. Ш таммы из галлов на листьях ii ii, семенах
i . и стеблях
6.4. Штаммы ВКМ Ас и ВКМ Ас из семенных галлов на
i .
6.5. Штамм ВКМ Ас из филлосферы .
Глава 7. Таксономическое изучение актиномицетов, содержащих ДАМК и орнитин в
клеточной стенке.
Глава 8. Таксономическое изучение актиномицетов с орнитином в клеточной
стенке.
Глава 9. Таксономическое изучение актиномицетов с лизином в клеточной
стенке.
9.1. Штаммы ВКМ Ас и ВКМ Ас из семян рябчика
русского и клематиса
9.2. Штамм ВКМ Ас из листового галла на .
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
Глава . Выделение и описания новых таксонов актиномицетов
.1. Новый род ii и его видовой состав
.2. Новый род i и его видовой состав.
.3. Новый род ii и вид ii iii
.4. Новые виды i ii и i .
.5. i i . v., i i . v. и
i ii . v.
.6. . v
.7. i i . v
.8. iii i . v
Глава . Местообитание бактерий изученных таксонов и актиномицетно
нематодные фитопатогенные комплексы
ЗАКЛЮЧЕНИЕ П
ВЫВОДЫ.
ЛИТЕРАТУРА


Диссертация изложена на 6 страницах и состоит из введения, обзора литературы, экспериментальной части, включающей описание материалов и методов исследований, результатов исследований и их обсуждения, выводов и списка цитируемой литературы, включающего 2 ссылки содержит таблицы и 7 рисунков. Автор выражает благодарность российским и зарубежным ученым, принимавшим участие на различных этапах работы к. В.М. Аданину ИБФМ им. Г.К. Скрябина РАН, к. В.Н. Акимову ИБФМ им. Г.К. Скрябина РАН, к. Т.Г. Добровольской МГУ, к. Н.Ф. Зеленковой ИБФМ им. Г.К. Скрябина РАН, к. В.И. Краузовой ИБФМ им. Г.К. Скрябина РАН, м. В.Я. Лысанской ИБФМ им. Г.К. Скрябина РАН, к. С.А. Субботину Институт паразитологии РАН, доктору М. Такеучи Институту ферментации, Осака, Япония, профессору Д. Тиджс Мичиганский Университет, США, к. С.М. Трутко ИБФМ им. Г.К. Скрябина РАН. Особую благодарность автор выражает своим наставникам и учителям к. Л.И. Евтушенко, чл. РАН Л. В. Калакуцкому, к. Э.В. Глава 1. Актиномицеты обширная группа филогенетически близких грамположительных бактерий с высоким содержанием ГЦпар в ДНК выделяются среди других бактерий наиболее сложной организацией генома и фенотипа на прокариотном уровне. Они широко распространены в природе, многие из них хорошо известны своей способностью синтезировать антибиотики и другие физиологически активные соединения Калакуцкий и Агре, , . Современная система классификации актиномицетов, как и большинства прокариот, во вес возрастающей мере базируется на полифазном принципе, предполагающем, что выделение и описание новых и ревизия известных таксонов осуществляется с учетом самых разнообразных согласующихся фенотипических, филогенетических и экологических характеристик организмов. Успехи последних лет в систематике бактерий обусловлены возможностью определения филогенетических связей микроорганизмов. Создаваемые древа служат не только базисом для реконструкции филогении бактерий, но и способствуют форсированию понимания эволюции биохимических, экологических и физиологических взаимоотношений микроорганизмов . i, . Однако схемы филогенетических взаимоотношений бактерий, с определенной степенью допущения отражающие их эволюционные связи, не могут быть использованы непосредственно для посгроения иерархической классификации необходима дополнительная информация фенотипического плана для характеристики и разграничения таксономических групп видов, родов и высших таксонов i, . В . рДНК. В предложенной недавно системе классификации vii предпринята попытка усилить филогенетические критерии выделения высших таксонов от порядка до подцарства фенотипическими, а в некоторых случаях и палеонтологическими данными. Авторы предложили объединить все прокариотные микроорганизмы в царство i, включающее 2 подцарства ii и ii. Подцарство ii объединяет преимущественно грамотрицательные бактерии, ii архебактерии и большинство грамиоложительных бактерий. В системе vii повышены в статусе высшие таксоны актиномицетов, предложенные . Актиномицеты в этой системе входят в подотдел ii отдела ii и представлены тремя классами i, i и . Классы выделяются на основе морфологических и хемотаксономических критериев. Большинство коринеформных организмов, включая семейство ii, входят в класс i. Морфологические и культуральные признаки как и у большинства культивируемых микроорганизмов традиционные таксономические характеристики актиномицетов. Физиологобиохимические признаки, такие как образование кислоты из углеводов, гидролиз различных веществ, использование разнообразных соединений в качестве источников углерода или азота, устойчивость к ингибиторам роста, способность расти при определенных температурах и , образование различных ферментов, отношение к кислороду и др. Красильников, Агре, , .