Молекулярно-генетические аспекты эпидемиологии внутрибольничных инфекций, вызванных представителями вида Staphylococcus aureus, устойчивыми к метициллину/оксациллину

• Автор: Дмитриенко, Ольга Александровна
• Шифр специальности: 03.00.07
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 227 с. : 34 ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ Роль метициллинрезистентных оксациллинрезистентных в

инфекционной патологии человека

Глава 1. Микробиологическая характеристика.

1.1. Таксономическое положение и биологические особенности

1.2. Факторы патогенности

1.3. Структурная организация генома

1.3.1. Хромосомное ядро и мобильный генетический пул микробной клетки.

1.3.2. Феномен гетерорезистентности стафилококковой популяции по устойчивости к мстициллину и его генетический контроль.
1.4. Лабораторные методы идентификации и тонирования.
1.4.1. Детекция .
1.4.2. Внутривидовая дифференциация .
Глава 2. Классификация и номенклатура стафилококковых
заболеваний человека.
Глава 3. Особенности эпидемиологии заболеваний, вызванных
3.1. Общая характеристика эпидемического процесса
стафилококковой инфекции.
3.2. Распространенность и клиникоэпидемиологические
особенности госпитальных инфекций, вызванных
3.3. Клональность госпитальных
3.4. Внегосиитальная заболеваемость, вызванная
СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
Глава 4. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
4.1. Бактериальные штаммы.
4.2. Среды, антибиотики, реактивы.
4.3. Методы изучения фенотипических свойств клинических
изолятов .
4.3.1. Анализ экспрессии белков.
4.3.2. Определение чувствительности к антибиотикам
4.3.3. Определение чувствительности к бактериофагам
4.4. Разработка методологии анализа генома и выбор
молекулярных маркеров.
4.5. Методы работы с нуклеиновыми кислотами.
4.5.1. Разработка методики выделения ДНК из стафилококка, предназначенной для постановки ПЦР
4.5.2. Амплификация геномной ДНК
4.5.3. Электрофорез и визуализация продуктов амплификации и рестрикции
4.6. Оптимизация условий и программ ПЦР для исследования
генов и генных комплексов .
4.6.1. Амплификация гена, кодирующего синтез
коагулазы.
4.6.2. Амплификация генов и генных комплексов, входящих в
состав стафилококковых хромосомных кассет тес.
4.6.3. Разработка мультиплексной ПЦР для детекции генов, детерминирующих синтез энтеротоксинов А, В и С, и детекция гена, детерминирующего синтез токсина синдрома токсического шока
4.7. Разработка условий рестрикции гена, детерминирующего
синтез коагулазы
4.8. Определение нуклеотидных последовательностей генов,
входящих в состав хромосомного ядра.
4.9. Эпидемиологический метод.
4 Статистические методы.
Глава 5. ЗНАЧЕНИЕ КАК ВОЗБУДИТЕЛЕЙ
ВНУТРИБОЛЬНИЧНЫХ ИНФЕКЦИЙ В СТАЦИОНАРАХ РФ
5.1. Идентификация изолятов . , устойчивых к
оксациллину.
5.2. Фенотипические свойства клинических изолятов
5.3. Роль в возникновении различных форм
внутрибольничной инфекции.
Глава 6. ГЕНОМНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ КЛИНИЧЕСКИХ
ИЗОЛЯТОВ
6.1. Детекция гена тесА.
6.2. Структурный полиморфизм генов, входящих в состав
хромосомного ядра.
6.2.1. Вариабельность гена, кодирующего синтез коагулазы
6.2.2. Вариабельность гена, кодирующего синтез протеина А
6.3 Идентификация генов и генных комплексов в составе
мобильного генетического пула микробной клетки
6.3.1. Структурный полиморфизм тес ДИК генетической
области, детерминирующей устойчивость к оксациллину
6.3.2. Детекция генов, кодирующих синтез пирогенных
токсинов суперантигенов.
Глава 7. КЛОНАЛЬНОСТЬ КЛИНИЧЕСКИХ ИЗОЛЯТОВ , ВЫЯВЛЕННАЯ МЕТОДАМИ
МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ.
7.1. Идентификация и характеристика эпидемических
штаммов, выявленных среди клинических изолятов, выделенных в г. г.
7.2. Анализ клинических изолятов, выделенных в
г. г
ГЛАВА 8. ИСПОЛЬЗОВАНИЕ РАЗРАБОТАННОГО
МУЛЬГИЛОКУСНОГО АНАЛИЗА ГЕНОМА
В СИСТЕМЕ ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО
НАДЗОРА.
8.1. Молекулярногенетическая модель формирования идентифицированных эпидемических штаммов и гипотеза их появления в стационарах РФ.
8.2. Молекулярногенетический мониторинг А
8.2.1. Ретроспективный анализ вспышек внутрибольничной инфекции, вызванной , в стационарах различного
профиля.
8.2.2. Идентификация госпитального эпидемического штамма
у больных при поступлении в стационар.
ГЛАВА 9. ОБСУЖДЕНИЕ.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Согласно современной классификации, основанной преимущественно на данных геносистематики, род вместе с другими, менее известными, родами , , i и i, образует семейство , которое относят к порядку i, классу ii, группе бактерий с плотной клеточной стенкой. Филогенетически наиболее близкими ему являются представители рода i из семейства i, а также представители семейства ii, которые также отнесены к порядку i , i x i, . Основной экологической нишей для стафилококков считаются кожные покровы и слизистые оболочки теплокровных животных и человека, однако они могут быть изолированы из пищевых продуктов и воздуха, значительно реже из пыли и воды. Стафилококки неподвижные и не образующие спор бактерии. По типу питания они хемоорганотрофы, по типу дыхания факультативные анаэробы. Выраженная метаболическая активность стафилококков позволяет им колонизовать, а в последующем и активно вегетировать в различных органах и тканях макроорганизмахозяина. Некоторые виды могут формировать капсулу и биопленки, которые повышают устойчивость микроорганизмов к действию неблагоприятных факторов внешней среды, антибиотиков и дезинфектантов, а также механизмов иммунной защиты хозяина, обеспечивают им возможность колонизовать поверхность синтетических полимеров медицинского назначения, способствуют длительной персистенции микробов в условиях макроорганизма. Клеточная стенка содержит два главных компонента пептидогликан и связанные с ним тейхосвые кислоты. В отличие от других грамположительных факультативно анаэробных кокков стафилококки чувствительны к действию лизостафина эндопептидазы, гидролизующей глицилглициновые связи в межпептидных мостиках пептидогликана, но устойчивы к действию лизоцима i А. С., . Уацетилмурамовой кислоты в молекуле пептидогликана Вега . Род насчитывает около видов и подвидов i , , большинство из которых являются комменсалами с различной хозяйской специфичностью. Наиболее патогенным среди них как для человека, так и для многих млекопитающих, является вид . Это объясняется способностью представителей данного вида экспрессировать большое количество потенциальных факторов патогенности, участвующих в колонизации и развитии инфекционного процесса М. Наиболее известной таксономически значимой характеристикой . Взаимодействуя с протромбином, плазмокоагулаза активирует процесс превращения фибриногена в фибрин. Образовавшийся сгусток защищает микробные клетки от действия бактерицидных факторов макроорганизма и обеспечивает благоприятную среду для их размножения ix М. Н., С. I., . Одной из важнейших биологических особенностей стафилококков является способность приобретать устойчивость к антимикробным препаратам для обзора см. I. , . Уже через несколько лет после начала широкого использования пенициллина в х годах прошлого века появились сообщения о выделении пенициллинрезистентных изолятов . Устойчивый к действию стафилококковой Рлактамазы, первый полусинтетический пенициллин метициллин предназначался для лечения инфекций, вызванных пенициллинрезистентными штаммами. Однако менее чем через два года после его введения в лечебную практику появились первые сообщения о выделении метициллиирезистентных штаммов золотистого стафилококка, сокращенно называемых от английского обозначения iiii v М. Р.,. Их появление превратилось в серьезную проблему для специалистов к середине х началу х годов прошлого века, когда стало очевидным, что, обладая всеми характерными морфологическими, культуральными и биохимическими свойствами, характерными для золотистого стафилококка, имеют свои особенности. Несмотря на то, что впоследствии метициллин был заменен менее токсичными антибиотиками этой группы, такими как оксациллин и диклоксациллин, термин прочно закрепился в научной литературе. Почти вес штаммы секрстируют группу цитотоксинов и экзопротеииов, которая включает 4 гемолизина альфа, бета, гамма, дельта, нуклеазы, протеазы, липазы, гиалуронидазы и коллагеназы. Основная функция этих ферментов состоит в превращении тканей хозяина в питательный субстрат, необходимый для размножения бактерии. Некоторые штаммы продуцируют один или несколько дополнительных экзопротеинов, которые детерминируют развитие тех или иных форм стафилококковой инфекции.