Генотипическая гетерогенность спирохет Borrelia afzelii - одного из возбудителей иксодовых клещевых боррелиозов

• Автор: Фадеева, Ирина Анатольевна
• Шифр специальности: 03.00.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2006
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 124 с. : 7 ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ ВВЕДЕНИЕ

Актуальность проблемы Цель исследования Задачи исследовашя Научная новизна исследования Практическая значимость Публикации

Объем и структура диссертации

2.3. Гены, контролирующие основные поверхностные белки, и их экспрессия

2.4. Ген, кодирующий белок Р, его структура и вариабельность

2.5. Важнейшие поверхностные белки боррелий

2.5.1 Оврсемейство

2.5.2 У1бЕ белок

2.5.3 Интегральный поверхностный белок Р

2.5.4 Топологические и функциональные взаимоотношения между белками поверхностной мембраны
2.6. Внутрипопуляционная генотипическая гетерогенность боррелий.
ГЛАВА 3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
3.1. Изоляты и бактериальные термолизаты
3.2. Амплификация вариабельного спсйсерного региона 5
3.3. Амплификация участка гена, кодирующего белок Р
3.4. Дополнительная идентификация изолятов методом ПЦР ПДРФ
3.5. Секвенирование ампликонов спейсерного региона 5
3.6. Секвенирование участка гена, кодирующего белок Р
3.7. Материалы и методы эпидемиологического анализа
ГЛАВА 4. ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ВАРИАНТЫ I II, ВЫЯВЛЕННЫЕ НА ОСНОВАНИИ СЕКВЕНИРОВАНИЯ СПЕЙСЕРА 5
ГЛАВА 5. АЛЛЕЛЬНЫЕ ВАРИАНТЫ I I ВЫЯВЛЕННЫЕ НА ОСНОВАНИИ СЕКВЕНИРОВАНИЯ ХРОМОСОМНОГО ГЕНА р
ГЛАВА 6. ГЕТЕРОГЕННОСТЬ БОРРЕЛИЙ, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ В ПРИРОДНОМ ОЧАГЕ СРЕДНЕГО УРАЛА ПЕРМСКИЙ КРАЙ
6.1 Краткая характеристика природного очага
6.2 Гетерогенность i ii
ГЛАВА 7. КЛИНИКОЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКАЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА ИКСОДОВЫХ КЛЕЩЕВЫХ БОРРЕЛИОЗОВ В ПЕРМСКОМ КРАЕ
7.1. Доля Иксодовых клещевых боррелиозов в структуре официально регистрируемой инфекционной заболеваемости
7.2. Проявления эпидемического процесса иксодовых клещевых боррелиозов
7.3. Оценка основных факторов риска заражения иксодовмми клещевыми боррелиозами
7.4. Разнообразие клинических проявлений ИКБ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Ш выявить генотипическую гетерогенность этого возбудителя и изучить его внутривидовую таксономию. Изучить возможную внутривидовую вариабельность гена, кодирующего белок Р у спирохет В. На примере В. Ш изучить естественную генотипическую структуру популяции возбудителя ИКБ, циркулирующих в пределах одного природного очага. На примере Пермского края изучить особенности эпидемического проявления природных очагов ИКБ, в которых циркулируют различные внугривидовые варианты возбудителей. Научная новизна исследования. Впервые выявлена значительная внутривидовая генотипическая гетерогенность боррелий В. Ш, циркулирующих в пределах ареала этого возбудителя и обосновано существование новой внутривидовой таксономической категории боррелий геновариант. Показано, что каждая из двух известных генетических подгрупп В. УБ1 7 геновариаптов, ЫТ 3. Распространение большинства из них, но всей видимости, не связано с ареалом определнного вида переносчика или резервуарного хозяина. Впервые установлены различия в структуре хромосомного гена рбб у изолятов одного геновида боррелий, и по этому признаку выделено 7 аллельных вариантов В. Ш. При этом не обнаружено связи конкретного аллельного варианта с определенным видом переносчиков или резервуарных хозяев. Впервые на примере В. Ш изучена естественная структура популяции возбудителя ИКБ, что дат новые представления об эпизоотологии и эпидемиологии инфекций этой группы. Практическая значимость. Выявленные аллельные варианты могут иметь значение в этиологии и патогенезе ИКБ. Нуклеотидные последовательности спейсера 8 го изолята и участков гена рбб х изолятов В. Ш депонированы в ОепВапк. Министерства здравоохранения и соцразвития РФ, и кафедры Инфекционных болезней Пермской Государственной Медицинской Академии. Публикации. По теме диссертационной работы опубликовано работ. Объм и структура диссертации. Диссертация изложена на 0 страницах компьютерного текста и состоит из введения, двух глав обзора литературы, главы Материалы и методы исследования, четырх глав исследований, заключения, выводов и списка литературы, включающего отечественных и 6 зарубежных источников. Диссертация иллюстрирована таблицами и рисунками. Диссертация выполнялась при консультативном содействии специалистов отдела переносчиков инфекций ГУ НИИЭМ им. Н.Ф. Гамалеи РАМП Н. Б. Гореловой, Ю. В. Ковалевского, В. ООО Омникс, СанктПетербург, В. Н. Куликова, А Л. Маркова, Ю. В. Андрейчука, которым я хочу выразить глубокую благодарность. Отдельно благодарю рецензентов А. П. Самсонову и В. Н. Башкирова. Особую благодарность выражаю моим научным руководителям профессору Э. И. Коренбергу и доктору медицинских наук И. ГЛАВА 1. В начале XX столетия бактерии рода i привлекли пристальное внимание исследователей, так как с ними связывали возникновение эпидемий так называемых возвратных тифов или рекуррентных лихорадок человека, которые теперь принято называть боррслиозами , 0. Хотя ещ в конце века были описаны некоторые кожные заболевания, связанные с укусом клеща 5, основоположником изучения клинических проявлений клещевого боррелиоза можно считать . . i, который впервые описал мигрирующую эритему . Позднее, в х гг были описаны неврологические симптомы этого заболевания 4. Серьзные эпидемиологические исследования были начаты в середине х гг XX века изза частых вспышек заболеваний неизвестной этиологии у детей городка Лайма, штат Коннектикут, протекавших по типу ювенального ревматоидного артрита в сочетании с кольцевидной мигрирующей эритемой, при этом этом уровень заболеваемости в 0 раз превышал официально регистрируемый показатель заболеваемости артритом 7 9. Тогда же было установлено, что болезнь Лайма в США и хроническая мигрирующая эритема в Европе это одно заболевание 9, впервые упомянутое как болезнь Лайма БЛ 7. Несмотря на то, что клинические симптомы заболевания были известны с конца века, только в году из клещей Ix ii был выделен неизвестный ранее этиологический агент 5, 5, что стало практически сенсационным открытием, т.