Галоалкалофильные аэробные метилобактерии рода Methylophaga

• Автор: Ли Цырегма Дармаевна
• Шифр специальности: 03.00.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2006
• Место защиты: Пущино
• Количество страниц: 114 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

Введение.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

Глава I. Особенности биологии аэробных метилобактсрии

1.1. Общая характеристика и таксономия.

1.2. Особенности метаболизма

1.3. Экология аэробных метилобактсрии и их роль в природе.

1.4. Биотехнологический потенциал аэробных метилобактсрии.

Глава II. Галоалкалофильныс микроорганизмы

2.1. Физиологические особенности

2.2. Содовые озера источник галоалкалофильиых микроорганизмов.
2.3. Мраморные памятники как источники галоалкалофильиых микроорганизмов
2.4. Стратегии адаптации бактерии к высоким значениям солености и
2.5. Галофильные и алкалофильные метилобактсрии.
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЫ1АЯ ЧАСТЬ.
Глава III. Материалы и методы.
3.1. Объекты исследования.
3.2. Выделение накопительных культур
3.3. Выделение чистых культур.
3.4. Культивирование бактерий.
3.5. Электронная микроскопия
3.6. Изучение культуральных и фнзиологобнохнмичсских свойств.
3.7. Определение активности ферментов.
3.8. Аналитические методы.
3.8.1. Выделение и идентификация изопреноидных компонентов
3.8.2. Определение фосфолииидного состава.
3.8.3 Определение соегава жирных кислот.
3.8.4. Выделение экзополисахаридов и определение мономерного состава
3.8.5. Н ЯМРанализ осмоиротекторов
3.8.6. ТСХ метод определения содержания осмоиротекторов.
3.8.7. ВЭЖХ метод определения содержания эктоииа
3.8.8. Определение внутриклеточного объема
3.9. Молекулярногенетические методы и филогенетический анализ
3.9.1. Выделение и очистка препаратов ДК
3.9.2. Определение нуклеотидного состава ДНК
3.9.3. ДНКДНК гибридизация.
3.9.4. ПЦРамплификация гена Б рРНК.
3.9.5. ПЦРамплификация гена ДАБаминотрансферазы сс В.
3.9.6. Секвенирование ДНК и филогенетический анализ.
Глава IV. Выделение и характеристика галофильных алкалофильиых и
галофильных нейтрофильиых метилобактсрии
4.1. Выделение и характеристика галоалкалофильиых метилобактсрии из содовых озер.,
4.2. Выделение и характеристика галоалкалофильиых метилотрофов из разрушающегося мрамора
4.3. Выделение и характеристика галофильных нейтрофильиых
метилобактерий с водорослей Красного моря.
Глава V. Особенности метаболизма гатоалкатофильных и галофильных
нейтрофильиых метилобактерий
Глава VI. Филогенетическое и таксономическое положение новых изолятов.
Глава VII. Осмоадаптация представителей рода .
7.1. Состав фосфолипидов и жирных кислот клеток в зависимости от солености среды.
7.2. Осмопротекторы.
Гла ва V ПI. Обсужден не
ЗАКЛЮЧЕНИЕ.
ВЫВОДЫ.
ЛИТЕРАТУРА


Полученные результаты свидетельствуют о широком рас пространении и важной зкофизиологпческой роли галоалкалофилы Практическое значение. могут являться модельными объектами для выявления особенностей их осмоадаптации на молекулярногенетическом уровне с целью создания болсс эффективных штаммовпродуцептов эктоина. Апробации работы. Основные положения диссертации доложены на V и VI конференциях молодых ученых г. Пущино , , на VII симпозиуме i i i , , , VIII н IX Международных Путинских школахконференциях молодых ученых Пущино, и , на молодежной школеконференции Актуальные аспекты современной микробиологии Москва, , а также па ежегодных отчетных конференциях ИБФМ РАН . Публикации. По материалам диссертации опубликовано 3 статьи и 6 тезисов. Структура и объем работы. Диссертация изложена па 4 страницах и состоит из введения, обзора литературы, экспериментальной части, обсуждения, заключения, выводов и списка литературы, включающего 5 ссылок, из них на русском и 5 на английском языках, содержит таблиц и рисунков. Место проведении работы. Экспериментальная часть работы выполнена в лаборатории радиоактивных изотопов и метилотрофии в рамках плана научноисследовательских работ ИБФМ им. Г.К. Скрябина РАН но теме С груктурнофупкциопальное и таксономическое разнообразие аэробных мстилотрофов Госрегистрации . Автор искренне признателен всем сотрудникам лаборатории метилотрофии и радиоактивных изотопов, способствовавшим выполнению данной диссертационной работы, а также д. Намсараеву Б. Б. Институт общей и экспериментальной биологии СО РАН, г. УланУдэ, д. Сорокину Д. Ю Институт микробиологии им. С.И. Виноградского РАН, г. Москва, к. Пстушковой . П. МГУ, г. Москва, д. Осипову Г. А. Академическая группа ак. Исакова Ю. Ф., РАМП, г. Москва, к. Калимапу . . Институт Белка РАН, к. Сузипой П. П., к. Сахаровскому В. Г., к. Шляпникову М. Г, к. Аданину В. М., Ильченко В. Особую благодарность автор выражает своим учителям д. Троцснко Ю. А. и д. Дорониной . . за постоянное внимание и полезные советы. Глава I. Особенности биологии аэробных метплобактерии 1. Впервые бактерии, способные к аэробному росту на метаноле как единственном источнике углерода и энергии, были выделены в г. i i . С этого времени и до начала х годов удалось выделить только несколько штаммов мстилотрофиых микроорганизмов. Начало систематическому изучению их биологии и метаболизма было положено описанием розовоокрашенного метилотрофа . 1 , , . К настоящему времени выделены и изучены согни штаммов метплобактерии, проявляющих поразительное морфологическое, физиологобиохимическос и таксономическое разнообразие. Аэробные метплобактерии представлены широким спектром морфотипов палочковидные, кокковидные, тетраэдральные, ветвящиеся, плеоморфиме, гифообразующис, делящиеся и почкующиеся, подвижные и неподвижные, бесцветные и имеющие каротиноидные пигменты. Могут иметь грамположительный или грамотрицательиыи тип клеточной стенки, среди них обнаружены гало, термо и ацидотолсрантные формы. По характеру углеродного питания различают облигатные и ограниченно или типичнофакультативные метплобактерии. Кроме того, в соответствии с реализуемыми путями первичной iассимиляции сериновыи, рибулозомонофосфатный или рибулозобисфосфатный аэробные метплобактерии можно условно разделить на 3 основные группы, хотя ряд метплобактерии может использован эти пути одновременно i i i. К настоящему времени известно родов аэробных метплобактерии, относящихся к X, i i i. , , i i . v vi. , , i vi . ii . Iii i, , i i , i , i i . ii i . i i . ii . ii . i .