АТФазный домен в транспортных белках вирусов растений

• Автор: Лещинер, Анна Дмитриевна
• Шифр специальности: 03.00.06
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2006
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 133 с. : ил.

Оглавление

Список сокращений

Введение.

Обзор литературы

Многокомпонентные транспортные системы вирусов растений.

Транспорт вирусов с тройным блоком транспортных генов.

Особенности транспортной системы гордеиподобных вирусов

Особенности транспортной системы погексподобных вирусов

Потивирусы

Клостеровирусы

Материалы и методы.

Результаты.
Обсуждение.
Выводы.
Список литературы


Первый способ характерен для вирусов, относящихся к группам vi, vi, vi, vi, ivi и vi v . i , . Второй механизм используется представителями родов vi, ivi, vi и вирусами, содержащими так называемый тройной блок генов, ТБГ vi, vi и ivi, способными транспортироваться из клетки в клетку в отсутствии вирусного белка оболочки . i , i . Xi . , , а также представителями родов vi, vi и ТБГсодержащего семейства xivii, которым для ближнего транспорта необходим БО i . . . . Согласно ранее устоявшемуся определению, хотя в последнем случае и необходим БО, он не является транспортным белком, так как не способен транспортировать через плазмодесмы ни РНК, ни самого себя . . . Однако новые данные о сложных транспортных системах, в частности у поти и клостеровирусов см. К ним, видимо, следует относить все вирусспецифические белки, необходимые для эффективного распространения вирусной инфекции. Вирусы, образующие тубулы, транспортируются в виде вирионов, в то время как транспортной формой вирусов, использующих механизм модификации плазмодесм, является предполагаемый невирионный рибонуклеопротеидный комплекс РНП, образованный геномом вируса и вирусными ТБ и БО, либо геномом и вирусным ТБ. Известна группа альфаподобных РНК вирусов с положительным геномом, в котором имеется сходный для всей группы модуль, называемый тройным блоком генов ТБГ, состоящий из трех частично перекрывающихся открытых рамок трансляции ОРТ v . . В состав этой группы включают представителей родов vi, vi, ivi и vi и представителей семейства xivii роды xvi, vi, xivi и vvi v vv, . Расположение консервативного модуля ТБГ в геноме вирусов из разных родов по отношению к другим генам сильно отличается, однако взаимное расположение трех ОРТ друг относительно друга и характер кодируемых ими белков остается неизменным. Продукты трансляции этих трех рамок получили название ТБГ1, ТБГ2 и ТБГЗ белки. Мутационный анализ инфекционных кДНК клонов вирусных геномов четко показывает, что все три белка необходимы для успешного транспорта вируса , . . i . . Таким образом, транспортная функция, осуществляемая одним ТБ у ВТМ, распределяется между тремя белками ТБГ. ТБГ1 белки белки, кодируемые ОРТ1 содержат НТФазнохеликазный домен, близкородственный репликативным хеликазам альфаподобных вирусов и принадлежащий к хеликазам суперсемейства 1 . i, i , . Филогенетический анализ НТФазнохеликазной последовательности позволяет объединить ТБГ1 белки в две основные группы, соответствующие нитевидным род xvi, vi, vvi и xivi и палочковидным вирусам род ivi, vi, vi, vi. Молекулярный вес ТБГ1 белка нитевидных вирусов варьирует от до кДа, последовательность всего белка это НТФазнохеликазный мотив, в то время как для палочковидных вирусов характерны ТБГ1 белки значительно большего размера от до кДа, содержащие дополнительный концевой домен. Следует дать краткое описание структуры и свойств консервативных мотивов, установленные для высокомолекулярных ДНКхеликаз. ДТФазной активности хеликазного домена ТБГ1 белков. Традиционно хеликазы определяют как белки, способные катализировать разделение полинуклеотидных дуплексов в АТФзависимой реакции. В зависимости от направления, в котором расплетающий фермент движется по полинуклеотидиой цепи в процессе расплетания дуплекса, выделяют 53 хеликазы и 35 хеликазы. i показали, что ряд отдаленно родственных хеликаз имеет общие короткие консервативные последовательности, или мотивы. Они предложили общую классификацию хеликаз с разделением их на пять суперсемейств ссем.