Характеристика штаммов вируса кори, циркулирующих на территории Российской Федерации в период массовой вакцинопрофилактики

• Автор: Журавлева, Юлия Николаевна
• Шифр специальности: 03.00.06
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2004
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 160 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ3.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

ГЛАВА 1. Структура вируса кори и функциональная активность

вирусных белков.

ГЛАВА 2. Геном вируса кори и генотипирование диких штаммов

коревого вируса.

ГЛАВА 3. Географическое распространение штаммов вируса кори

разных генотипов

СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

ГЛАВА 4. Материалы и методы исследования

ГЛАВА 5. Подбор праймеров и условий для проведения реакции
обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции.
ГЛАВА 6. Анализ нуклеотидной последовательности СООНконцевого участка Ыгена штаммов вируса кори, изолированных на
территории России.
ГЛАВА 7. Анализ нуклеотидной последовательности полноразмерного
Нгена штаммов вируса кори, изолированных на территории России .
ОБСУЖДЕНИЕ
ВЫВОДЫ0.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫИЗ.
ПРИЛОЖЕНИЕ3.
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
Д1I дезоксирибонуклеиновая кислота кДНК клональная ДНК
ВОЗ Всемирная Организация Здравоохранения НК нуклеотид
ПААТ полиакриламидный гель
ПСПЭ подострый склерозирующий панэнцсфалит
ПЦР полимеразная цепная реакция
РНК рибонуклеиновая кислота
ТЦДтитр цитопатогенных доз
ЭР эндоплазматический ритикулум
ЭТВ энцефалит телец включений
i i
Vi vi i
реакция обратной транскрипции
ВВЕДЕНИЕ


ПРАКТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ РАБОТЫ заключается в создании на основе разработанных специфических праймеров для СООНконцевого участка Ыгена вируса кори и определении оптимальных условий проведения реакции обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции Набора реагеггов для выделения РНК и диагностики вируса кори методом обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции в одной пробирке ДВКПЦР в соответствии с п. ГОСТ Р . Проект технических условий данного набора был представлен и рассмотрен на заседании комиссии по РИА и ИФАнаборам Комитета но новой медицинской технике М3 РФ года. В депонировании одного из изученных штаммов вируса кори Viv4 в Государственную коллекцию вирусов ГУ НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского РАМН, Москва, Россия. Данному штамму присвоен номер ГКВ . В депонировании ти изученных штаммов вируса кори, циркулирующих на территории Российской Федерации, в Международную коллекцию штаммов , , США и передачи нуклеотидных последовательностей данных штаммов в I, , США. С помощью реакции обратной транскрипции, полимеразной цепной реакции и ссквснирования установлено, что на территории России в периоде по годы циркулировали штаммы вируса кори четырех генотипов , 4, 6 и Н1. В течение последних лет на территории России произошли изменения в генотипическом пейзаже штаммов вируса кори. Циркуляция штаммов генотипа А, эндемичного для России в довакцинальный период, в последние годы не зафиксирована. Наиболее постоянной циркуляцией отличается вирус кори, принадлежащий к генотипу 4, который и является эндемичным для России в настоящее время. Для штаммов вируса кори генотипа Э4, выделенных на территории Российской Федерации характерно интенсивное ежегодное накопление мутаций на нуклеотидном и аминокислотном уровне, что свидетельствует о важности постоянного слежения за дикими штаммами вируса кори с помощью методов молекулярной эпидемиологии. ГЛАВА 1. Корь занимает значительное место среди инфекционных болезней человека . До получения в начале х годов живой атгенуированой вакцины, корь имела повсеместное распространение с периодическими эпидемическими подъемами и вспышками , и, несмотря на то, что в настоящее время некоторые страны добились контроля над корыо, это заболевание остается эндемичным в большинстве мест. Вирус кори был впервые изолирован в клеточной культуре в году . Т. из крови больного ребенка Дэвида Эдмонстона, в первый день сыпи . Авторы установили возможность пассирования вируса кори в клеточных культурах и отметили, что появление и развитие специфических дегенеративных изменений в инфицированной культуре сопровождается накоплением вируса в культуральной жидкости. Вирус кори является представителем группы vi, которая объединяет семейства , i и ixvii 0. Семейство ixvii, к которому принадлежит вирус кори обширная группа вирусов, имеющих разных хозяев табл. Вирион вируса кори, диаметр которого варьирует ог 0 до 0 нм рис. РНК, и наружную, близкую к сферической, липопротеиновую оболочку 5, 0. Таблица 1. Классификация семейства Рагагтнхочпс1ае. Рис. Вирион вируса кори , Р. Вирусная оболочка достаточно прочна и защищает нуклеокапсиды при переносе из клетки в клетку. Вирус кори инфицирует многие клетки человека и приматов i vi, но редко инфицирует клетки других видов животных . I viv репликация этого вируса происходит, главным образом, в системе мононуклеарных фагоцитов, эндотелиальных и эпителиальных клетках. Иногда инфицируются нейроны и другие клетки центральной нервной системы, что в отсутствие эффективного иммунного ответа может приводить к персистирующей инфекции
Нуклеокапсиды вируса кори обладают спиральной симметрией и благодаря большому размеру белковых субъединиц имеют зубчатые границы рис. Вирион содержит также РНКзависимую РНКполимеразу, состоящую из белковых субъединиц I. Р. Этот фермент катализирует транскрипцию и репликацию нуклеокапсидной матрицы 3. Рис. ViВ V. С помощью иммунохимических и биохимических методов исследования у вируса кори обнаружено 8 структурных белков рис. Три белка связаны с нуклеокапсидом , Р и . Три белка связаны с оболочкой вируса М, ТО 1 и 2 и . Особое внимание уделяется изучению 3 структурных компонентов вируса М, и , т. Мбелок имеет ключевое значение в созревании и сборке вириона 3. Белок М является пусковым механизмом, ответственным за созревание и отпочковывание инфекционных парамиксовирусов .