Молекулярно-генетический анализ вакцинных и вирулентных штаммов пестивирусов

• Автор: Южаков, Антон Геннадиевич
• Шифр специальности: 03.00.06, 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2009
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 105 с. : ил.

Диагностика заболеваний, вызываемых пестивирусами

3. Штаммы и изоляты вируса диареи крупного рогатого

4. Список сокращений . ВВД КРС вирус вирусной диареи крупного рогатого скота ВДКРС вирусная диарея крупного рогатого скота ВКЧС вирус классической чумы свиней ДНК дезоксирибонуклеиновая кислота ДЕГЖ диэтилпирокарбонат ЖКТ желудочнокишечный тракт ЙФА иммуноферментный анализ ИФН интерферон ПБО пограничная болезнь овец КРС крупный рогатый скот КЧС классическая чума свиней ПЦР полимеразная цепная реакция к ДНК комплентарная ДНК Мат моноклональные антитела мРНК матричная РНК НГО нетранслируемая область НЦП нецитопатогенный ОТ обратная транскрипция п. Пестивирусы важные патогены КРС, овец и свиней, приносящие серьзный экономический ущерб во всм мире. Пестивирусные инфекции вызывают различные расстройства, такие как проблемы воспроизводства, иммуносупресию, диарею, тромбоцитопению и часто протекают латентно. У беременных животных трансплацентарная инфекция может привести к аборту, мертворождению, уродствам и персистентной инфекции у потомков , . В настоящее время классическая чума свиней КЧС и вирусная диарея КРС ВД КРС заболевания, часто регистрируемые на территории России и ряда других стран и приносящие серьезный экономический ущерб промышленному животноводству. Так, потери стран ЕС в результате эпизоотий КЧС гг. ВД КРС, вероятно, самая распространенная вирусная болезнь жвачных, антитела к ней обнаруживают в сыворотке крови у КРС во всем мире . Вирусы КЧС и ВД КРС, вместе с вирусом пограничной болезни овец ПВО составляют род Резйуцш Пестивирус, входящий в семейство Р1аМпбае . Вирусы данного рода представляют 7 антигенных групп вирус КЧС, 2 вируса вирусной диареи КРС ВВД КРС1 и ВВД КРС2, 3 вируса пограничной болезни овец ПБО1, БО2, ПБО3, и одну антигенную группу представляет штамм 8, выделенный от жирафа в Кении. При этом каждый вид вирусов разделен на генетические подгруппы, основываясь на различиях нуклеотидной последовательности генома . В соответствии с эпизоотологической важностью и затруднениями в диагностике пестивирусных инфекций, возникла потребность в разработке новейших методов быстрой детекции, идентификации и классификации вирусов, улучшении систем контроля циркуляции вирусов и молекулярного типирования. Генетическую и антигенную вариабельность вирусов изучают методом филогенетического анализа, на основе частичного секвенирования определенных фрагментов геномов и аминокислотных последовательностей различных вирусных изолятов и сравнения их с рядом наиболее известных референтных штаммов. При анализе определнных фрагментов геномов в разных лабораториях, получают сходные, воспроизводимые результаты. Поэтому важно, чтобы во всм мире использовались стандартные методы исследований. Типирование с моноклональными антителами и филогенетический анализ показали, что псстивирусы, внутри вида могут быть отнесены в разные генетические группы и подгруппы , . Возможность различать между собой изоляты необходима для того, чтобы изучать эпизоотологию и эволюцию вирусов. За рубежом созданы базы данных геномов вирусов, куда добавляются вес вновь выделенные полевые изоляты. Это позволяет более полно видеть картину эпизоотического процесса, определять пути распространения вируса, и соответственно принимать меры по их пресечению. Необходимо создание в РФ базы данных геномов вирусов, используя те же фрагменты геномов, что и во всем мире. Сегодня, как и ранее, очень важно иметь наиболее полную информацию о циркулирующих на территории Российской Федерации штаммах ВКЧС и ВВД КРС. Эго позволяет контролировать эпизоотологическую ситуацию но вызываемым данными вирусами заболеваниям, а также идентифицировать и определять происхождение новых изолятов вирусов. Целью данной работы являлось генотипирование и филогенетический анализ вакцинных и полевых изолятов пестивирусов ВКЧС и ВВД КРС, циркулирующих на территории РФ.