Сравнительная характеристика ДНК коринеморфных бактерий

• Автор: Фомин, Борис Андреевич
• Шифр специальности: 03.00.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 1984
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 152 c. : ил

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ .

ГЛАВА I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Феносистематика коринеформной группы

бактерий

1.2. Геносистематика коринеформной группы

бактерий

1.2.1. Нуклеотидный состав .

1.2.2. Размер генома .

1.2.3. Систематика на основе изучения гомологий нуклеотидных последовательностей

1.2.4. Систематика на основе изучения структуры РНК

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Материалы
2.1.1. Исследуемые микроорганизмы .
2.1.2. Реактивы.
2.2. Методы.
2.2.1. Культивирование микроорганизмов .
2.2.2. Выделение ДНК из биомассы .
2.2.3. Определение нуклеотидного состава .
2.2.4. Фрагментирование ДНК
2.2.5. Определение размера генома.
2.2.6. Получение радиоактивномеченых препаратов ДНК
2.2.7. Молекулярная ДНКДНК гибридизации на фильтрах.
Стр.
2.2.8. Определение термостабильности гибридных дуплексов ДНК
2.2.9. Молекулярная ДНКДНК гибридизация в растворе .
2.2 Математическая обработка результатов
экспериментов .
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ
3.1. Испытание питательной среды и культивирование исследуемых микроорганизмов .
3.2. Выделение и характеристика препаратов ДНК исследуемых микроорганизмов .
3.3. Мечение препаратов ДНК радиоактивными изотопами
3.4. Нуклеотидный состав ДНК коринеморфных бактерий.
3.5. Размер генома коринеморфных бактерий
3.6. Определение гомологий нуклеотидных последовательностей ДНК коринеморфных бактерий .
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ ПОЛУЧЕННЫХ РЕЗУЛЬТАТОВ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ.
ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ.
СПИСОК ЦИТИРУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ


СВОе отражение В ряде фундаментальных обзоров , , а i, , i . Исследования антигенного состава клеточных стенок позволили V прийти к выводу о наличии значительного сходства между коринебактериями, мик обактериями и нокардиями. Следует отметить, что аналогичное предположение высказывалось еще в г. С года в литературе для обозначения этих микроорганизмов стал применяться термин группа i, i, i ,, получивший в настоящее время широкое распространение. x . , iv . Проведенные исследования и сделанные на их выводах таксономические заключения нашли свое отражение в восьмом издании Оцределителя бактерий Берги , где,после упразднения присутствующего в шестом и в седьмом изданиях Определителя семейства i 9 размещенатак называемая,Группа коринеформных бактерий . В целом следует сказать, и в восьмом издании Определителя широко применяется термин коринеформный, отражающий морфологическую особенность микроорганизма. , iii полагают, что это может приводить к накоплению необъективных данных при характеристике Граммположительных, неспорообразующих, коротких палочек иррегулярной формы, большей частью аэробного типа дыхания. Особые затруднения, вследствие ограниченных возможностей фенотипической классификации коринеформных бактерий, встречались при идентификации вновь выделяемых морфологически сходных микроорганизмов. i. Тем не менее, внутригрупповое распределение изолятов оставалось неизвестным. Кроме того, антигенный анализ позволял усомниться в принадлежности изолятов к коринебактериям 9 . Аналогичная ситуация наблюдалась при исследовании обширной группы полиморфных микроорганизмов, выделяемых от больных злокачественными образованиями людей. Причем некоторые из авторов Крестовникова,, , относили их к семейству i7 другие i . КОринебактериям, третьи I i ,,к переходным между ними формам. В г. В дальнейших работах Гевондян,Бархударян,Карпов,, они были названы коринеморфными изолятами. Исследование культур коринеморфных изолятов и морфологически сходных с ними микроорганизмов, выделяемых от больных злокачественными образованиями людей Андреева и др. Однако в силу разнообразия биохимических характеристик большинство из культур не было окончательно отнесено к какомулибо определенному виду коринебактерий. Сомнительным оставался вопрос о родственных связях внутри этой группы. Этот факт может указывать на то, что видовые признаки этих бактерий не определены точно, а родовой критерии расширен без достаточных исследований , , Ъ. Учитывая приведенные факты, становится очевидным необходимость применения для систематики новых подходов и критериев, позволяющих создать действительно объективную классификацию. В обзоре книги , , написанной по материалам конгресса Сравнение современных методов классификации и идентификации vi, , приводится подразделение таксономических критериев, используемых в настоящее время при изучении микроорганизмов. По мнению авторов существуют четыре уровня характеристик, применяемых для классификации. Самый низкий уровень морфология объекта, далее в порядке возрастания таксономической ценности анализ клеточных компонентов пиролитическая хроматография, липидный анализ, состав клеточных стенок и т. Основными характеристиками нуклеиновых кислот, применяемыми для систематики микроорганизмов, также в порядке возрастания, можно считать I. Определение нуклеотидного состава как надежный родовой критерий. Размер генома, особенно в сочетании с нуклеотидным составом. Определение гомологий нуклеотидных последовательностей ДНК в различных вариантах. Наряду с перечисленными характеристиками в последнее время все чаще применяется метод картирования рРНК, основным достоинством которого считается возможность установления родства между весьма удаленными друг от друга таксонами.