Организация пиримидиновых олигонуклеотидных последовательностей в ДНК насекомых

• Автор: Тихомирова, Татьяна Петровна
• Шифр специальности: 03.00.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 1984
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 169 c. : ил

ОГЛАВЛЕНИЕ
Введение.

ГЛАВА I. Структурная организация и функционирование геногла

насекошх обзор литературы.

1.1. Общие представления о структурной организации генома насекошх

1.2. Характеристика структурных элементов генома насекомых.

.2 Сателлктная ДНК.

1.2.2. Обращенные повторы.

1.2.3. Умеренно повторяющиеся последовательности

1.2.3.1. Рассеянные повторы и их роль в регуляции активности генома насекошх

1.2.3.1. Сблоченные повторяющиеся последовательности .

Гены высокомолекулярных рРНК .
Гены 5Б рРНК.
Гены тРНК
Гистоновые гены
1.3. Изменения генома насекошх в процессе
эволюции.
Мобильные генетические элементы и их роль в шкроэволвдии насекошх.
1.4. Изменения генома насекошх в процессе развития
ГЛАВА П. Материалы и методы
ПЛ. Материалы
П. 2. Методы.
П.2.1. Выделение ДНК из грены тутового шелкопряда .
П.2.2. Выделение препарата ДНК из фиксированного биологического материала
П.2.3. Удаление из препаратов ДНК примесей РНК .
П.2.4. Деградация ДНК до пиримидиновых последовательностей и подготовка гидролизата для хроматографии
П.2.5. Разделение пиримидиновых олигонуклеотидов на изоплиты с помощью колоночной хроматографии
П.2.6. Разделение пиримидиновых изоплитов на компоненты, различающиеся содержанием тимидиловых и цитидиловых нуклеотидных остатков .
П.2.7. Количественное определение оодержания
фракций изоплитов
ГЛАВА Ш. Исследование степени сплоченности пиримидиновых
изоплитов в ДНК насекомых в видовом аспекте .
ГЛАВА 1У. Сравнительное исследование блочной организации пиримидиновых последовательностей, различающихся содержанием цитидиловых и тимидиловых нуклеотидов, в ДНК некоторых представителей класса насекомых
1У.1. Общие закономерности в организации и содержании пиримидиновых последовательностей в ДНК насекомых
1У.2. Организация пиримидиновых последовательностей ДНК насекомых в видовом аспекте
ГЛАВА У. Организация пиримидиновых последовательностей в
ДНК породы УФ тутового шелкопряда в эмбриогенезе.
УЛ. Изменение степени сблоченности пиримидиновых нуклеотидов ДНК породы УФ тутового шелкопряда в эмбриогенезе
У.2. Динамика содержания пиримидиновых изоплитов, различающихся соотношением цитидиловых и тимидиловых нуклеотидов, в ДНК породы УФ
тутового шелкопряда на разных фазах постдиапаузного развития грены
ГЛАВА У1. Блочная организация пиримидиновых нуклеотидных последовательностей в ДНК пород и гибридов тутового шелкопряда в эмбриогенезе .
У1.1. Сравнительное исследование степени сблоченности пиримидиновых нуклеотидов в ДНК пород и гибридов тутового шелкопряда в начале и конце постдиапаузного развития грены.
У1.2. Организация пиримидиновых последовательностей, различающихся содержанием тимидиловых и цитидиловых нуклеотидных остатков в ДНК пород и гибридов тутового шелкопряда в эмбриогенезе .
Заключение
Выводы
Литература


Немаловажной характеристикой геномов насекомых являются данные по общему содержанию ДНК в клетке. Размер генома, рассчитан
шй по скорости реассоциации медленной фракции, у разных видов насекомых отличается значительной вариабильностью. В пределах класса его величина изменяется в раз от 0, пг до пг i . Петров, Алешин, i, , , i ,. Это свидетельствуют о том, что в пределах класса насекомых общее содержание ДНК в клетке не коррелирует с эволюционной продвинутостью вида. Размеры генома заметно варьируют и в пределах одного отряда насекомых например, у представителей отряда его величина изменяется от 0, пг до 1,7 пг. Однако, в
рамках одного семейства, например, стрекоз Петров, Алешин,
различия по этому показателю ничтоены. Причины варьирования содержания ДНК на гаплоидную клетку пока не известны. Считается, что большая часть генома не несет информативной нагрузки, будучи представлена избыточной ДНК. Повидимому, за счет этой ДНК и возникают отмеченные выше различия в размерах геномов насекомых. Алешин, i . ДНК позволил выявить тенденцию, согласно которой небольшие по величине геномы имеют меныпее количество повторяющихся нуклеотидных последовательностей и устроены по типу i i . ПГ соответственно i , i . I6. В время i, i и i i , характеризующиеся коротким ТИПОМ интерсПерсии повторов в геноме, имеют и большее количество ДНК 0, пг 0, пг и 5,6 пг соответственно i . Высказано предположение, что длиннопериодичный тип организации генома мог возникнуть из короткопериодичного путем частичной потери ДНК, что нашло свое выражение в уменьшении величины генома и числа коротких повторяющихся последовательностей, чередующихся в геноме с уникальными i . Наличие разнообразных по частоте повторяемости последовательностей в ДНК генома насекомых предполагает и разнообразие выполняемых ими функций. С совершенной очевидностью можно пока говорить о функциональной значимости лишь незначительной части этих последовательностей, составляющих в общей сумме около i i , , . Наиболее изученными в структурнофункциональном отношении являются фракции повторяю
. Остановимся на их характеристике подробнее. Классификация повторяющихся последовательностей ДНК эукариот и насекомых в том числе связана с определенными трудностями. Предложено множество способов классификации повторов, но до СИХ пор единого мнения не существует i, i ,. Чаще всего как высоко, так и умеренно повторяющиеся последовательности в ДНК насекомых классифицируют на основании их хромосомного распределения I рассеянные короткие повторы, перемежающиеся с длинными неповторяющимися последовательностями ДНК и 2 кластеризованные повторы. ДНК i i 9
. Кроме того, некоторые авторы выделяют еще обращенные повторы палиндромы Тарантул и др. П.1. Сателлитная ДНК
Большая часть кластеризованных повторов, относящихся к фракции сателлитной ДНК, значительно отличается по нуклеотидному составу от остальной ДНК, вследствие чего эти повторы могут быть обнаружены в виде отдельного пика при ультрацентрифугировании в градиентах плотности или с добавлением антибиоти
ков иле ионов тяжелых металлов , . Сателлитные ДНК насекомых обычно состоят из коротких фрагментов длиной ОТ 2х ДО ти нуклеотидных пар . I раз i . ДНК вгеноме насекомых выявлены сателлитные ДНК, характеризующиеся большей длиной повторов, и обозначение как сложные i , , . Типичным примером слокных сателлитных ДНК является ст ДНК с плавучей плотностью 1,8 гсм3 i , длина повтора В которой достигает 9 пар оснований i , , . Доля сателлитных ДНК в геноме насекомых существенно варьирует. Так, например, У i сателлитные последовательности составляют 8 от тотальной ДНК, а в геноме близкородственного вида i vii их содержится Максимовский и др. ДНК , . Как правило в геноме насекомых встречаются несколько сателлитных ДНК, отличающихся по плавучей плотности. Получены данные о последовательности оснований в повторяющемся элементе большинства сателлитных компонентов ДНК . Сателлитные ДНК . Такая близость отражает, повидимому, общий источник этих повторяющихся последовательностей. Сателлитные ДНК .