Физико-химические и шапероноподобные свойства малого белка теплового шока Hsp22 человека

• Автор: Казаков, Алексей Сергеевич
• Шифр специальности: 03.00.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2009
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 151 с. : ил.

Введение

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1. Погребенные почвы

1.1. Изучение погребенных почв 1 I

1.2. Характеристика микробных сообществ палеопочв

2. Грибы рода i

2.1. Общая морфологическая характеристика i

2.2. Методы, используемые в систематике i

2.3. Современные подходы к идентификации i

2.4. Внутривидовая изменчивость i

2.4.1. Гетерогенносгь i
2.4.2. Культуральноморфологические типы КМТ грибов
2.4.3. Исследование популяционной структуры грибов
2.4.4. Вегетативная совместимость
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
1. Объекты исследования
1.1. Отбор образцов почвы Мурзихинского II могильника
1.2. Отбор образцов почвы БольшеКляринского городища
2. Методы
2.1. Определение численности почвенных микроорганизмов
2.2. Определение структуры микромицстного сообщества
2.3. Измерение интенсивности дыхания почвы
2.4. Расчет углерода микробной биомассы
2.5. Расчет метаболического коэффициента
2.6. Определение потенциальной активности азотфиксации
2.7. Выделение i из почвы
2.8. Получение моноспоровых культур i
2.9. Изучение культуральноморфологических свойств i
2 Изучение морфологии спор i
2 Идентификация i
2 Молекулярногенетический анализ i
2 Изучение кинетических параметров i
2 Определение интенсивности спороношения i
2 Изучение вегетативной совместимости i
2 Определение культуральноморфологических типов колоний i
2 Изучение антагонистической активности i
2 Определение ферментативной активности i
2 Определение фитотоксичности культуральной жидкости i
2 Статистическая обработка
РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ОБСУЖДЕНИЕ
1. Микробиологическая характеристика выщелоченных черноземов в районе расположения археологических памятников 1 БольшеКляринского городища КамскоУстьинский район и Мурзихинского И могильника Алексеевский район
1.1. Оценка биологической активности современных горизонтов в районе расположения археологических памятников 1 БольшеКляринского городища КамскоУстьинский район и Мурзихинского II могильника Алексеевский район
1.2. Микробиологический анализ погребенных и новообразованных почв в районе БольшеКляринского городища
1.2.1. Микробиологическая характеристика почв БолыиеКляринского городища, трансформировавшихся в гидроморфных условиях водного режима
1.2.2. Микробиологическая характеристика почв БолынеКляринского городища, трансформировавшихся в автоморфных условиях водного режима
1.3. Микробиологический анализ погребенных и новообразованных почв в районе Мурзихинского И могильника Алексеевский район
1.4. Микологическая характеристика выщелоченных черноземов в районе расположения археологических памятников
2. Характеристика i из погребенных почв
2.1. Видовое разнообразие почвенных грибов рода i из погребенных черноземов КамскоУстьииского и Алексевского районов
2.2. Идентификация i с помощью объектноориентированного подхода ООП
2.3. Молекулярногенетический анализ изотятов i
2.4. Характеристика структуры природных популяций i
2.5. Прорастание конидий i
2.6. Скорость роста i, изменение скорости роста при расщеплении
2.7. Интенсивность спороношения i
2.8. Антагонистическая активность изолятов i по отношению . x
2.9. Сгратегии жизни i
2 Ферментативная активность i
2 Фитотоксичность изолятов i
2 Влияние i на жизнедеятельность почвенных микроорганизмов
Заключение
Литература
Список сокращений БГТМФА бактерии, потребляющие минеральные ДН денитрифицирующие бактерии КГ А карто ф ел ь н о гл ю к оз н ы й агар КЖ культуральная жидкость КМ коэффициент минерализации КО коэффициент педотрофности КОЕ колониеобразующие единицы КП коэффициент педотрофности МКБ молочнокислые бактерии РТ Республика Татарстан СО спорообразующие бактерии СР сульфатредуцирующие бактерии С1. бактерии р. ii I I i i i . i
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность


Алтая работы Крупенникова по почвам, погребенным под Траяновым валом в начале нашей эры в черноземной зоне Молдовы Золоту на по подкурганным палеопочвам бронзового века и л. Украины, Безугловой и др. Иедвиговского городища л. Дергачевой по палеопочвам эпохи бронзы Самарского Заволжья. В этих работах только констатируется наличие живых микроорганизмов в погребенных почвах. Демкиной , впервые при почвенноархеологических исследованиях использовался комплекс современных методов почвенной микробиологии. Почвенные микроорганизмы являются неотъемлемой составной частью почвы. Практически все процессы, протекающие в ней, в той или иной степени связаны с жизнедеятельностью микроорганизмов. Поэтому характеристика микробного сообщества относится к числу важнейших диагностических показателей, отражающих условия почвообразования. Пазеопочвьт, в зависимости от степени консервации, сохраняют ряд свойств с моменга погребения Демкин, , а, следовательно, это должно быть отражено в соответствующих параметрах их микробного сообщества. Более того, на основании величин микробиологических параметров можно судить о палеоэкологической ситуации в ту или иную историческую эпоху, что было показано на примере изученных подкургапных палеопочв пустынностепной зоны волгодонского междуречья, погребенных в IV в. Принципиально новыми являются данные о пространственновременной изменчивости экологотрофической структуры микробного сообщества, отражающей вековую динамику почвенноландшафтных и климатических условий. В частности, при микробиологических исследованиях разновозрастных подкурганных и современных каштановых почв Северных Ергеней установлено, что на протяжении последних лет численность и экологотрофическая структура микробных сообществ испытывали заметную динамику, обусловленную изменчивостью факторов почвообразования. Полученные данные свидетельствуют о том, что в исследуемом регионе в первой половине IV, в начале II тыс. I в. Во ИШ вв. Крайне важной представляется согласованность палеоэкологических выводов, полученных по микробиологическим данным, с природными реконструкциями, проведенными путем традиционного морфологогенетического и химических анализов палеопочв. В последнее время в литературе появились данные, свидетельствующие о сохранении диагностических свойств микробных сообществ почв археологических памятников. В частности, установлено Марфенина, , что комплекс микроскопических грибов культурных слоев древнерусских поселений 1ХХ1 вв. По мнению авторов, это дает возможность использовать микологические характеристики с целью биодиагностики культурных слоев древнерусских поселений. Весьма перспективным представляется характеристика микробных сообществ почв по количеству и качеству генетического материала суммарной ДНК Добровольская и др. В настоящее время для изучения их структуры активно используются методы молекулярной генетики, позволяющие оценить разнообразие микроорганизмов на основе полиморфизма гена 8 РНК, то есть посредством оценки разнообразия риботипов микроорганизмов ПесЦе Щ а1. ТогеуНс, . С помощью анализа содержания суммарной ДНК и определения полиморфизма концевых фрагментов гена 8 рРНК исследованы микробные сообщества современной светлокаштановой и разновозрастных подкурганных почв, погребенных в хроноинтервале конец IV рубеж ШН тыс. Южные Ергени. Установлено, что в профиле современной почвы горизонты А,, В, В2 содержание суммарной ДНК снижается с глубиной, тогда как горизонт В2 палеопочв может содержать больше ДНК по сравнению с вышележащими слоями и даже превышать таковое в горизонте В2 современной почвы. Микробные сообщества исследованных почв достоверно отличаются друг от друга. Так, в современной светлокаштановой почве насчитывается более сотни микробных риботипов, каждый из которых представляет определенную группу микроорганизмов, имеющую идентичные последовательности анализируемого участка гена 8 рРНК. В палеопочве выявлено около риботипов, причем до риботипов являются общими для обеих почв. Около риботипов современной и риботипов погребенной почвы являются специфическими для соответствующего микробного сообщества.