Идентификация, клонирование и биохимическая характеристика нового сердечно-специфического белка Сердина-1

• Автор: Адамейко, Игорь Игоревич
• Шифр специальности: 03.00.04, 03.00.13
• Научная степень: Кандидатская
• Место защиты: Нижний Новгород
• Количество страниц: 135 с. : ил.

Постоянно увеличивающееся число новооткрываемых белков с различными функциями постепенно обнаружило интересную особенность организации ряда белков в виде набора тандемно повторяющихся мотивов i, . Один из таких повторяющихся мотивов был впервые обнаружен в альфа2гликопротеине и получил название лейцинбогатый повтор i , или от английского i , соответствующий структурной единице, которая представляет собой суперспиральный компонент и формирует структуру белка соленоидного типа , . Белки данной группы не являются чисто эукариотическими, функционально почти все из них вовлечены в процессы белокбелкового взаимодействия. Лейцинбогатый повтор состоит главным образом из аминокислотных остатков и имеет консервативный сегмент из аминокислот с консенсусной последовательностью xxxxxx, при этом X может быть любой аминокислотой, а позиции лейцина могут быть заняты валином, изолейцином или фенилаланином. За прошедшие несколько лет было определено большое количество 3 структур белков, содержащих повтор i . Обзоры по функциям данной группы белков предполагают, что главной ролью лейцинбогатых белков является формирование структуры, необходимой для осуществления белокбелковых взаимодействий. Однако точная структурная информация о механике взаимодействия доступна только для двух белков лорцина I и 2 i , . Мутагенетичесие исследования предполагают существование множественных важных контактов, формируемых для реализации этих взаимодействий . Лейцинбогатые белки участвуют во многих важных биологических процессах, таких как гормонрецепторное узнавание, ингибирование ферментов, клеточная адгезия и внутриклеточный транспорт. Несколько последних работ демонстрируют участие содержащих белков в процессах органогенеза и раннего развития млекопитающих . I . Также было показано, что домен может иметь критичную функцию для морфологии и динамики цитоскелета X . Исключение может составлять бслок моркови, который может использовать свою повторяющуюся структуру для ингибирования кристаллизации льда . Все состоят из консервативного и вариабельного участков Консервативный сегмент обычно состоит из аминокислот Было предложено разделение всех на 7 классов по отношению к длине, количеству повторов и их консенсусу. Были выделены такие классы как типичные , Iподобные. СС. В настоящее время все чаще делаются попытки создания искусственных библиотек белков, способных к сильному специфическому связыванию наподобие антител. Одним из самых удобных регулярных повторяющихся мотивов, использующихся в подобном моделировании, является повтор . Известно, что состоит из консервативных и вариабельных учаегков. За пределами сети иммуноглобулинов природа создала целый ряд белков с повторяющейся структурой для поддержания широкого профиля разнообразных белокбелковых взаимодействий Чтобы подчеркнуть важность аминокислотных повторов в природе нужно сказать, что имунная система полагается на белки как на основу лигандраспознавательных процессов v, . Как подтверждение этой теории лейцинбогатый повтор был идентифицирован в качестве важнейшего компонент в гормонзависимых рецепторах гликопротеидной природы, протеогликанах, белках. Часто повторы кодируются отдельными экзонами и процесс эволюции может приводить к варьированию числа и позиции одиночных повторов внутри конкретной структуры. Дупликации повторов являются наиболее частым эволюционным сценарием. В ряде недавних работ было проанализировано богатство белков, содержащих наиболее распространенные повторы в том числе и . Одна из наиболее притягательных гипотез заключается в том. V. . Многочисленные повторы обычно формируют белковый домен с гидрофобным ядром, поддерживаемым лейцином и другими гидрофобными аминокислотами. Вытянутая и изогнутая форма поддерживает большую облаегь. Имеются определенные предпосылки считать, что в исключительных случаях домен способен взаимодействовать не только с белковыми мотивами, но и с нуклеиновыми кислотами. Например. IV v белок может связывать РНК. Это может свидетельствовать о специфичной роли повтора в связывании РНК. Видимо, похожим образом компонент 2 может связывать 2 мяРНК.