Значение межклеточных взаимодействий у бактерий Micrococcus luteus и Rhodococcus rhodochrous для инициации роста

• Автор: Волошин, Сергей Александрович
• Шифр специальности: 03.00.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2005
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 125 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

ОБОЗНАЧЕНИЯ И СОКРАЩЕНИЯ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Химические факторы коммуникации

1.1.1. МЕЖКЛЕТОЧНЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ОПОСРЕДОВАННЫЕ ХИМИЧЕСКИМИ ФАКТОРАМИ.

1.1.2. СПОРУЛЯЦИЯ И КОМПЕТЕНТНОСТЬ В. ii.

1.1.3. АФАКТОР В РЕГУЛЯЦИИ СТРЕПТОМИЦЕТОВII

1.1.4. ДЕЛЕНИЕ КЛЕТОК.

1.1.5. БЕЛКИ СЕМЕЙСТВА СТИМУЛЯТОРЫ РОСТА БАКТЕРИЙ

1.2. Межклеточные взаимодействия опосредованные физическими факторами МЕЖКЛЕТОЧНЫЕ КОНТАКТЫ.
1.2.1.БИОПЛНК И
1.2.2. БАКТЕРИАЛЬНЫЕ КОЛОНИИ
1.3. АПОПТОЗ В МИКРОБНЫХ СООБЩЕСТВАХ.
1.4. Клеточная стенка и е роль в коммуникации бактерий
1.5. Агрегация бактерий в жидких средах
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ..
2.1. Выращивание бактериальных культур.
2.2. Общее число клеток ОЧК
2.3. Микроскопические исследования.
2.4. Распределение клеток
2.5. Разрушение бактериальных агрегатов исследуемых культур
2.6. Получение супернатантов для стимуляции роста бактерий.
2.7. Электрофорез белков в ПААТ по Лэммли
2.8. Иммуноблоттинг рекомбинантных белков
2.9. Иммуноферментный АНАЛИЗ.
2 Получение белка и его модифицированных форм
2 Секвенирование белков
2 Масспектрометрия.
2 Приготовление грубого препарата клеточных стенок М. .
2 Измерение литической активности белка в отношении грубого препарата КЛЕТОЧНЫХ СТЕНОК М.
2 Определение мурамидазной активности белков и его модификаций.
2 Гель фильтрация СН со стимулирующей активностью
2 Тестирование фракций супернатанта М. на активность стимулирующую рост КЛЕТОК
2 Ультрафильтрация СН со стимулирующей активностью.
2 Хроматомассспектросколия.
2 Проточная цитометрия.
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ
3.1. Ингибирующее влияние интенсивного перемешивания на рост культур
И В ЖИДКИХ ОБЕДНЕННЫХ СРЕДАХ
3.2. Клеточная агрегация на ранних стадиях развития бактериальных культур .
И М. И ЕЕ МЕХАНИЗМЫ.
3.3 РОЛЬ БЕЛКА в ДЕЗАГРЕГАЦИИ КЛЕТОЧНЫХ АСС0ЦИАТ М. .
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


В попытках ответа на вопрос, зачем бактерии иметь две системы были проведены исследования, которые показали, что синтез и секреция фуранонов встречается среди разных бактерий намного чаще, чем синтез АГЛ. Эта находка привела к гипотезе о том, что фураноны являются языком для межвидового общения между клетками, а АГЛ для внутривидового. Действительно, фураноны синтезируются как грамположительными, так и грамотрицательными бактериями. Как полагают, этот неспецифический фурановый язык может использоваться в сообществах бактерий, таких, например, как бйопленки или бактериальные консорциумы в которых часто пребывает V. АГЛ используется однородными бактериальными популяциями , . Сходное явление было найдено при образовании биопленок, содержащих Р. В. i, когда продукция одного аутоиндуктора влияла на продукцию другого что приводит, в конце концов, к эффективной колонизации органов хозяина при заболевании фиброзом . Существуют также случаи, когда конкурирующие микроорганизмы угнетают развитие своих соседей других видов бактерий за счет секреции ферментов, разрушающих их коммуникационные молекулы . Как показали недавние исследования, некоторые экзометаболиты . Николаев, в том числе к окислительному и тепловому стрессам. Было показано, что супернатанты изпод культуры растущей в стрессовых условиях термо, Холодовой шоки и окислительный стресс оказывали защитное действие на клетки . Николаев, . Оказалось, что подобные факторы адаптации есть у других микроорганизмов, причм в некоторых случаях экзометаболиты одного вида могут влиять на рост и развитие микроорганизмов других видов даже далеко отстоящих друг от друга в таксономическом плане Николаев и др. Показано, например, что добавление клеточных экстрактов пролионовокислых бактерий приводило к восстановлению инактивированных ультрафиолетом клеток . Воробьва и др. Эти данные позволяют предположить, что в микробном сообществе возможно существование межвидовых взаимодействий разного типа, за которые ответственны внеклеточные факторы адаптации к стрессам. Описанные наблюдения о взаимовлиянии микроорганизмов посредством специфических факторов адаптации к стрессам дополняют давно и хорошо известные трофические взаимоотношения микроорганизмов Звягинцев, . СПОРУЛЯЦИЯ И КОМПЕТЕНТНОСТЬ 8. В настоящее время доказано, что два важнейших процесса у В. ДНК трансформации, и споруляция контролируются секретируемыми феромонами по механизму i. В данном случае в качестве феромонов выступают пептидные молекулы. , . Однако, у клеток В. В этом случае бактерии секретируют в окружающую среду другой пептидный феромон. Предполагается, что механизм i в этих случаях помогает усиливать генетический обмен между клетками одного вида, поскольку сигнал феромон специфичен для данного вида, а вероятность переноса ДНК возрастает, если концентрация клеток высока. И хотя роль сигналов для процесса споруляции не совсем ясна, предполагается, что, возможно, в условиях высокой плотности клеток и недостатка питания переход клеток в споруляцию является выгодной для клеток стратегией выживания , . Рецепторный тип передачи сигнала для пептидных феромонов достаточно универсален для разных бактерий и на уровне генов связан с функционированием так называемого пептидокиназного каскада. Уже упомянутый выше процесс регуляции компетентности у В. Первый ген кодирует белок , который участвует в процессинге предшественника СотХ кодируется вторым геном каскада, третий ген кодирует синтез киназырецептора СотР и, наконец, четвертый ген кодирует регулятор транскрипции СотА. Подобный сигнальный каскад генов найден у . . i . v . Второй механизм передачи сигнала транспорт сигнальной молекулы внутрь клетки также, очевидно, распространен среди грамположительных бактерий. Например, регуляция переноса плазмиды между клетками . , секретируемого реципиентными клетками в окружающую среду. Внутри донорной клетки в конечном итоге стимулирует синтез белков конъюгации и репликацию плазмиды.