Дифференциация митохондриальных генов цитохрома b и контрольного региона и ядерного c-mos гена у тетеревиных птиц на основе биохимического и филогенетического анализа

• Автор: Буторина, Ольга Тимофеевна
• Шифр специальности: 03.00.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2001
• Место защиты: Магадан
• Количество страниц: 126 с.

Оглавление
Страницы
Введение

Глава 1. Обзор литературы

1.1 Нуклеотидные последовательности биохимические документы эволюции

1.2 Митохондриальный геном птиц

1.3 Ген цитохрома Ь митохондриального генома птиц

1.4 Контрольный регион митохондриального генома птиц

1.5 Стоя ген ядерного генома

1.6 Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей

1.7 Скорость эволюции митохондриальною генома

1.8 Курообразные птицы Глава 2. Материалы и методы
2.1 Материалы исследования
2.2 Методы исследования
2.3 Филогенетический анализ Глава 3. Результаты исследований и обсуждение
3.1 Биохимический и генетический анализ гена цитохрома Ь митохондриального генома тетеревиных
3.2 Эволюция гена цитохрома Ь у птиц отряда куриных
3.3 Филогенетическое родство гена цитохрома Ь у тетеревиных птиц
3.4 Внутривидовая изменчивость левого домена контрольного региона митохондриального генома
3.5 Время дивергенции и трансбсрснгийскис связи тетеревиных птиц
3.6 Молекулярная филогения гена стоя ядерного генома тетеревиных птиц
Заключение
Выводы
Список литературы


Однако среди них имеется высококонсервативная фракция, кодирующая структурные гены, скорость дивергенции которых соизмерима со скоростью дивергенции кодируемых ими белков. Скорость дивергенции уникальных последовательностей значительно ниже, чем умеренно и высоконовторяющнхся Медников, . Сложность структуры генома эукариот, по мнению Мелникова Медников, , затрудняет оценку дивергенции, с другой стороны открывает перед методом новые перспективы. Для оценки степени дивергенции методом молекулярной гибридизации необязательно знать функцию сопоставляемых нуклеотидных последовательностей, поскольку этим методом сопоставляются значительные доли геномов, так что они неизбежно оказываются полифункцнональными. Нужно только в каждом конкретном случае, в зависимости от поставленной задачи, сопоставлять данные по гибридизации нужной фракции. Другим перспективным методом является недавно разработанный отечественными исследователями метод таксономического тонирования или таксономического фикгерпринта ДНК. Проведенные с его помощью работы на представителях различных классов позвоночных животных позволили оценить генетический полиморфизм среди животных, относящихся к разным видам и родам. Полученные данные свидетельствовали. Гречко и др. Гречко, . Соколовым Соколов, в исследованиях степени вариабельности геномной ДИК у шести видов . . i. . ii. . ii, . . рада vi эволюционно молодого отряда воробьинообразных i. Таксонопринты разных видов даже очень близких эволюционных значительно различаются, что позволяет безошибочно установить принадлежность особи к тому или иному биологическому виду. Метод гаксонопринта. В.В. Гречко Гречко, , может быть успешно использован для дифференциации организмов на видовом, родовом и более высоких уровнях. Для оценки внутри и межпопуляционной генетической изменчивости может быть успешно, как в случае с ящерицами, использован другой метод ii i . Использование разных праймеров, дающих специфические картины паттерны электрофоретического разделения продуктов амплификации, позволяет получить достаточное число анонимных молекулярных маркеров для характеристики теистической изменчивости и молекулярногенетического родства внутри таксонов и. Гречко. С года начались активные исследования митохондриального генома, выявившие ряд уникальных особенностей и позволившие использовать его в дальнейшем как удачный молекулярный маркер для изучения филогенетических и эволюционных взаимоотношений организмов для разных таксономических категорий. Данные о степени генетическою разнообразия митохондриального мт генома широко используются в охране генофонда редких животных, в том числе и птиц. К г. В настоящее время их численность удаюсь увеличить до 3 тин из них 4 обитают н природе. Ранее было показано, что изменчивость ядериых аллоэимных локусов у американского журавля близка к типичному для птиц уровню для локусов средняя гетерозиютность составляла 0,8. С использованием эндонуклеаз были исследованы рестрикционные фрагменты контрольного региона митохондриальной мт ДНК журавлей, происходивших из 9 мест гнездования. У всех птиц паттерн рестрикционных фрагментов оказался одинаковым. По видимому, все ныне живущие американские журавли имеют один и тот же гаплотип мт ДНК. i, . В работе Алана Купера с соавторами а Материалом анализа являются два таких вида лайсанская утка эндемик небольшого 0 га острова Лай сан в Гавайском архипелаге численность вида не превышает 0 особей и гавайская угка . Для сравнения с параметрами геномов этих видов использовали данные палеонтологического анализа методом полимеразной ценной реакции ПЦР амплифицировалн отдельные фрагменты из ДНК, сохранившиеся в ископаемых костях уток, обнаруженных на Гавайях и представляющих отложения Голоцена и Плейстоцена. Полученные данные указывают на то. .vii и ранее была распространена на большинстве островов Гавайского архипелага, в связи с этим считается правильным проведение рсингродации лайсанской утки.