Молекулярная филогения и организация редактируемых митохондриальных генов у моногенетических и дигенетических трипаносоматид

• Автор: Мерзляк, Екатерина Марковна
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2002
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 123 с.

ОГЛАВЛЕНИЕ

Список сокращений Введение

Об юр литературы

Конверсия Си, иС Растения

Цисэлементы

Трансфакторы

Эволюция процесса редактирования у растений М иксом и цеты

Котранскрипционная вставка незакодированных нуклеотидов Редактирования за счет РНКзависимой РНКполимеразы Редактирование у гриманосоматид Модели редактирования Белки редактирующего комплекса Белки, взаимодействующие с гРНК р УШтНашаснЬш СОН рПО
КВР ГВКСС

Взаимодействие гРНК с гтремРНК

. Отредактированные транскрипты являются матрицей для трансляции

Молекулярная эволюция триланосоматид Эволюция редактирования у трипаносоматид Материалы и методы Объекты исследования Ферменты и реактивы
Культивирование моногенетических триианосоматид Выделение ДНК
Полимеразная цепная реакция ПЦР
К л о н и ро в а н и е ГIЦР п ро д у кто в

Выделение плазмидной ДНК
Определение первичной структуры ДНК по Сэнгеру .
Выделение суммарной и митохондриальной РНК
Выделение митохондрий i i , с модификациями
Обратная транскрипция и полимеразная цепная реакция
Электрофоретические методы
Компьютерный анализ
Результаты и обсуждение 5
I 1 О согласованности ядерных и митохондриальных маркеров
при классификации лейшманий
Ядерные маркеры
А6
ГЛАВА 2 Характеристика полученных изолягов моногенетических трипаносоматид с помощью различных молекулярных маркеров
I
Область гена 8
Область гена А6
Г Л АВА 3 Изменение длины редактируемого домена в разных митохондриальных генах и филогенетические построения
Выводы
Список литературы


Первым наблюдением, которое привело к изменению схемы ДНК РНК белок, можно считать открытие некодирующих последовательностей внутри кодирующих, то есть открытие экзон интронной структуры и, соответственно, явления РНК сплайсинга. Далее необходимо отметить открытие РНК редактирования, которое заключается во вставке и делеиин уриднловых оснований в митохондриях простейших, относящихся к отряду ii. Оба этих наблюдения, по мнению самого Уотсона, принципиально изменили основную догму молекулярной биологии i, . Дальнейшие исследования показали, что редактирование РНК, приводящее к изменению той информации, которая закодирована в ДНК ядерном, митохондриальном, либо хлоропласгном геномах, является широко распространенным явлением, включает различные механизмы и встречается у широкого круга организмов i . i . Значение процесса редактирования для жизнедеятельности организмов не подлежит сомнению. Так, в случае i попытки вывести линии дефектные по белкам компонентов редактирующего комплекса не увенчались успехом. Поэтому можно предположить, что белки этого комплекса оказываются необходимыми для выживания и ничем не комплементируются. Хорошим примером необходимости редактирования могут служить также мутанты по гену у i. Отсутствие продукта этого гена не приводит к летали, однако, наблюдаются дегенеративные расстройства нервной системы. Для дневных мух характерно долгое пребывание в неактивном отдыхе, в периоды которого они лежат на спине. К ому дню у мух постоянно подняты крылья, часто встречаются асимметричные позы с одним поднятым крылом и ногой i . В большей части описанных примеров роль редактирования заключается в увеличении количества изоформ того или иного белка. Так, например, в гене кодирующего белок кальциевого канала нервных клеток i, показано сайтов редактирования. Однако, роль редактирования не всегда столь однозначна. Так, известны примеры, когда этот процесс происходит в некодирующих областях интронах, а также 3 и 5 нетранслируемые области. Можно думать, что необходимость сплайсинга и редактирования сводится к увеличению количества белковых продуктов, считываемых с одного гена, в результате чего организм становится более лабильным к внешним воздействиям. Например, поразному отредактированный серотониновый рецептор 5НТгс человека имеет разную константу связывания к и другим препаратам этого ряда . В обзоре литературы мы рассмотрим процессы редактирования РНК генов митохондриального и хлоропластного кодирования, также возможную роль редактирования в жизнедеятельности разных организмов. Наряду с этим, в обзоре будут приведены данные об эволюционном происхождении этих процессов. Особое внимание мы уделим процессу редактирования у i организмам, у которых этот процесс был впервые обнаружен и достаточно много исследовался. Именно представители этого семейства явились объектом наших исследований. Таблица 1. РНКрелактирования. i . В случаях дополнения приведены ссылки на оригинальные работы. Конверсия . С высшие растения мхи. С дезаминирование. ИГШюсОмлтиды. Аполипонротеин В Оиор С4 формировмамс лвух типов белков псрсихчиков липидов разной плотности. А РОВНС1 , АРОВЕС стичулируюшиИ фактор . IV . С деьамикироание. Дезаминирование Л М д ско и и та ю шix млекопитающие, i . . Шуядра ди чРНК ссротоминовою рецептора 5ИТ1 ли мРНК натриевых и кальциевых каналов тРНК. 1. 2. 3 , I А дезаминирование мсталдофсрмснт с 7. Замена человека РНК гена а1 а. РЬеТут Замены СкА, Л. Вставки и делении спрял ii сем i. i X прс чРНК. РНК. Котраискрилииониая вставка С, АА. , , рЫусерЬЫит, и др. ixV митохондрии мРНК, рРНК. РНК появление I1 кодонов и полиЛ хвоста гРНК подии хвосты полиА полимераза, ТЛТата . Посттранскрнпиионнап достройка 3 конца тРНК ii ii, митохондрии vv . РНК последовательность комплементарной цепи является матрицей для достройки аминоакисториого стебля.