Структура и функция универсального участка внутреннего связывания рибосомы из мРНК вируса RhPV (Rhopalosiphum padi virus)

• Автор: Теренин, Илья Михайлович
• Шифр специальности: 02.00.10
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2005
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 85 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

Список сокращений

Введение.

Обзор литературы.

Глава I. Молекулярные механизмы инициации трансляции у про и эукариот

1. Прокариоты

1.1 Общий механизм инициации трансляции у прокариот

1.2 Связывание рибосомы с мРНК и выбор инкциаторного кодона.

1.3 Энхансеры трансляции

1.4 Структура и функции индивидуальных

факторов инициации

1.4.1 1П
1.4.2 1Г2.
1.4.3 1СЗ.
2. Эукариоты и Археи.
2.1 Археи.
2.2 Структура эукариотических мРНК
2.3 Сканирующая модель инициации трансляции.
2.4 Эукариотические факторы инициации.
2.4.1 еХП. . .
2.4.2 еША. .
2.4.3 е1Г2.
2.4.4 е1ГЗ.
2.4.5 еГ4А
2.4.6 е1Г4В
2.4.7 е1Г4 Г
2.4.8 е1Г5.
2.4.9 еГ5В
Глава II. Вирус i
Результаты и обсуждение 4
1. Iэлемент V эффективно направляет
трансляцию в лизате ретикулоцитов кролика.4
2. Факторы инициации 4й группы I4, 4В, 4
не являются абсолютно необходимыми для образования
комплекса на 5концевом Iэлементе V
3. Фактор инициации необходим рибосомной субчастице
для достижения инициаторного кодона мРНК V.4
4. Анализ целостности мРНК в ходе экспериментов4
5. 5I V не содержит специфических сайтов
связывания с компонентами инициаторного аппарата4
6. Структурный анализ 5НТО V
7. Рибосомная субчастица и фактор инициации I
образуют стабильный комплекс с Iэлемектом V.
8 . Заключение.
Выводы.
Экспериментальная часть.,.
Список литературы


Введение. Обзор литературы. Глава I. Связывание рибосомы с мРНК и выбор инкциаторного кодона. Г2. СЗ. Эукариоты и Археи. Археи. Сканирующая модель инициации трансляции. Эукариотические факторы инициации. ХП. ША. Г2. ГЗ. Г5. Глава II. РНК V. Iэлемектом V. Заключение. Выводы. Экспериментальная часть. Список литературы. V вирус паралича сверчка от англ. Сконцевой домен белка от англ. V вирус гепатита С от англ. I ингибитор рибонуклеаз из плаценты человека от англ. Ф I межцисгронный участок мРНК Vподобных вирусов от англ. I участок внутренней посадки рибосомы от англ. РНК от англ. V вирус тли от англ. РНК от англ. Т i трисгидроксимегаламинометан. Белковый синтез является сложным процессом, регулируемым на нескольких уровнях. Однако после попадания в цитоплазму влиять на эффективность трансляции становится возможным только на уровне стабильности мРНК и скорости образования инициаторных комплексов, и именно эти области регуляции трансляции вызывают повышенный интерес исследователей. Не последнюю роль играет и то, что многие вирусы в процессе эволюции научились перепрограммировать трансляционный аппарат клетки на преимущественное использование вирусных мРНК. Очень часто это достигается именно на стадии инициации за счет наличия в ряде вирусных мРНК сложных структур, называемых участками внутреннего связывания рибосомы или Iэлементами от англ. I i i. Ввиду сложного устройства клеток высших эукариот, до сих пор не разработаны эффективные методы анализа инициации трансляции i viv. Поэтому, по крайней мере, в ближайшие годы наилучшим методом изучения трансляции останется реконструкция комплексов рибосомамРНК из очищенных компонентов в сочетании с техникой тоупринта ингибирования обратной транскрипции рибосомными комплексами. На сегодняшний день этим методом были определены механизмы инициации трансляции на ряде клеточных и вирусных мРНК. Как уже упоминалось, мРНК многих вирусов содержит Iэлементы. Это сложно организованные последовательности РНК, взаимодействующие с определенными компонентами инициаторного аппарата, направляющие рибосому к инициаторному кодону. Ввиду сложности Iэлементов неудивительно, что большинство их функционирует лишь в определенных организмах, а небольшие вариации их первичной структуры могут в значительно мере понизить или даже свести на нет их активность. В связи с этим представляют интерес те редкие Iэлементы, которые функционируют в разных организмах, а также обладают модульной структурой, поскольку механизм их работы в настоящее время не совсем понятен. Одним из подобных универсальных Iэлементов является I, находящийся в 5неторанслируемой области 5НТО мРНК вируса насекомых V i i vi. Настоящая работа посвящена исследованию взаимодействий Iэлемента V с компонентами инициаторного аппарата и механизма его работы.