Изучение топографии рРНК и матричного полинуклеотида в рибосомах

• Автор: Евстафьева, Александра Георгиевна
• Шифр специальности: 02.00.00
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 1983
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 146 c. : ил

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

Глава I. СТРУКТУРНЫЕ АСПЕКТЫ ДЕКОДИРОВАНИЯ МАТРИЧНСЁ РНК

В РИБОСОМАХ ПРОКАРИОТ (Обзор литературы)

1.1. Взаимодействие матричной РНК с рибосомой

1.1.1. Инициаторные участки матричной РНК

1.1.2. Роль рибосомных белкоЕ и конформационного состояния 165 РНК в связывании матрицы

1.2. Топография мРНК и тРНК на рибосоме

1.2.1. Классификация рибосомных участков связывания тРНК

1.2.2. Топография мРНК и А- и Р-саитов связывания тРНК

1.3. Взаимная ориентация мРНК и тРНК в А- и Р-сайтах

1.4. Структурные изменения тРНК в процессе декодирования матрицы. Роль 5з РНК

Глава II. ИЗУЧЕНИЕ ТОПОГРАШИ рРНК И МАТРИЧНОГО ПОЛИНУКЛЕОТИДА
В РИБОСОМАХ (Обсуждение результатов)
П.1. Локализация 3' -концов 235 РЖ и 55 РЖ в
субчастицах рибосом
П. 1.1. Модификация 3' -концов 235 РЖ и 5 5 РЖ лактозным
гаптеном
П. 1.2. Реконструкция 50 Б субчастиц, содержащих
модифицированную 235 РЖ или 55 РЖ
П.1.3. Выделение димерных комплексов реконструированных
50 5 субчастиц с лактозными антителами
П. 1.4. Локализация 3'-конца 23б РЖ на поверхности
50 5 субчастицы
П.1.5. Локализация 3'-конца 5э РЖ е 50б субчастице

П.2. Локализация 3- и 5'-концов связанного с рибосомой
матричного полинуклеотида
П.2.1. Получение фрагментов рову, (и) , модифицированных
по одному из концов динитрофенильным гаптеном
П.2.2. Взаимодействие комплексов 30$-Ш§-ро(?у,(и)
с анти-ДНФ
П.2.3. Локализация З1- и 5*-концов матричного полинуклеотида, связанного с ЗОБ субчастицей рибосом
П.2.4. Локализация З1- и б'-концоЕ матричного полинуклеотида, связанного с 70 Б рибосомой
П.2.5. Участок "входа" и "выхода" матричного полинуклеотида на рибосоме
Глава III. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
Ш.І. Получение препаратов
Ш.2. Методы исследования
Ш.З. Аналитические методы исследования
БЫВОда
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ЭМ - электронная микроскопия - иммуноглобулин £ я.-ЛБА - 3-Ы-/п ~(р -$-лактозил)бензил/ашногексиламиіі ДНФ-ЭД, ДНФ-этилепдиамин - 2- М-(2 4-динитрофенил)амипоэтиламип ДНФ-гидразид - гидразид ЇЇ-(г-2,4 -дипитрофепил)ашиомасляной кислоты
ДНФ- ро^(і/)~ полиуридиловая кислота, модифицированная по одному из концов дшштрофенильпым гаптеном Анти-ДНФ - антитела против динитрофеиилышх гаптеиов ^260“ поглощение при 260 пы ОЕ260 “ оптическая единица /260 нм
ДОН - додецилсульфат натрия
ДМФА - диметилформамид
ДІ7ІС0 - дшле тил сульфоксид
ЭДТА - этилендиаминтетрауксусная кислота
ТК - тройной комплекс 708-рО^([/)-[,г|с] РЬе -тРНК^6

под углом друг к другу (рис.10 В).
Более короткое расстояние между "углами" тРНК, измеренное б работе Джонсона и др. /107/, авторы /105/ объясняют тем, что:
I) Б*и е восьмом положении находится очень близко к ССА-концу тРЖ и Еовсе не в вершине "угла", поэтому в результате поворота молекулы при транслокации в1* V -8 сдвигается отнюдь не на максимальное расстояние, как это делает -петля; 2) если более аккуратно обработать данные работы /107/, то расстояние между

в А и Р-сайтах составит (28+8) А, что вполне согласуется с данными Пауслена и др. /105/, учитывая сказанное в /I/.
Итак, имеющиеся на сегодня данные о взаимной ориентации мРНК и двух тРНК, связанных с рибосомой, лучше всего согласуются с моделью Рича /97/, хотя точный угол поворота плоскостей молекул тРНК друг относительно друга не известен. Существенной чертой этой модели является необходимость изгиба матрицы между двумя кодон-антикодоновыми дуплексами. Главнцм ограничением модели является предположение о неизменности конформации тРНК при взаимодействии с мРНК и рибосомой, что, возможно, отражает истинное положение вещей лишь в грубом приближении.
1.4. Структурные изменения тРНК в процессе декодирования матрицы. Роль 5Б РЖ
В настоящее время все больше распространяется точка зрения об активной роли тРЖ в рибосомном цикле элонгации трансляции, о том, что конформационные изменения тРЖ ответственны за ряд этапоЕ этого цикла.
Обсуждается два основных центра конформационных превращений тРЖ на рибосоме. Во-перЕЫх, это конформационные переходы в анти-