Породоспецифические особенности аллелофонда микросателлитов ДНК лошадей заводских и местных пород

• Автор: Зайцева, Марина Анатольевна
• Шифр специальности: 06.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2010
• Место защиты: Дивово
• Количество страниц: 140 с. : ил.

Введение З

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Явление генетического полиморфизма и его значение в фундаментальной генетике и теории эволюции

1.2. Типы полиморфных последовательностей ДНК

1.2.1. ДНК-маркеры рестрикционного полиморфизма

1.2.2. ДНК-маркеры полимеразной цепной реакции(ПЦР)

1.3. Локализация микросателлитов в геноме и их функциональные особенности ' '

1.4. Использование сателлитных последовательностей ДНК в молекулярногенетических исследованиях и в сельскохозяйственной биологии

1.5. Контроль достоверности происхождения

Глава 2. Материал и методика исследований

Общая схема проведения исследования -
2.1 .Характеристика исследованного поголовья лошадей
2.2. Характеристика использованных ДНК-маркеров
2.3. Сбор и хранение биоматериала
2.4. Выделение и определение концентрации ДНК
2.5. Проведение и параметры ПЦР
2.6. Капиллярный электрофорез и расшифровка результатов
2.7. Статистическая обработка результатов
Глава 3. Результаты собственных исследований и их обсуждение
3.1. Характеристика полиморфизма изученных локусов микросателлитов ДНК
3.2. Межпородная дифференциация по микросателлнтам ДНК
3.3. Внутрипородная дифференциация но микросателлитам ДНК
3.3.1. Внутрипородная географическая дифференциация чистокровной верховой породы
3.3.2. Внутрипородная генеалогическая дифференциация чистокровной арабской породы

3.4. Использование микросателлитов ДНК в контроле происхождения лошадей
Г лава 4. Выводы и практические предложения
4.1. Выводы
4.2. Практические предложения
Список использованной литературы
Приложение
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность темы. Современные требования к ведению селекционной работы включают различные аспекты применения полиморфных ДНК-маркеров.
На сегодняшний день применение ДНК-маркеров является самым эффективным, информативным и достоверным методом, используемым в фундаментальных и прикладных генетических исследованиях, как на индивидуальном, так и на популяционном уровне.
В ходе работы международного проекта «Г еном лошади» на сегодняшний день охарактеризовано более 4000 полиморфных последовательностей ДНК, для которых уже известна хромосомная локализация, что существенно дополняет предыдущие исследования. Выявленные группы сцепления генов позволяют вплотную приступить к разработке концепции селекции с помощью маркеров (MAS - Marker Assisted Selection) в коневодстве.
В коневодстве в настоящее время использование высокополиморфных ДНК маркеров актуально в нескольких аспектах. Применение ДНК-анализа для проведения контроля достоверности происхождения племенных лошадей в России с 2001 года является обязательной процедурой для лошадей чистокровной верховой, а начиная с 2009 года - для чистокровной арабской породы. Широкое распространение ДНК-типирования за рубежом и необходимость интеграции отечественного коневодства в мировое сообщество предопределяет приоритетное использование ДНК-технологий при контроле достоверности происхождения лошадей и других отечественных пород.
Еще одним важнейшим аспектом является применение ДНК-технологий для проведения мониторинга с целью предотвращения снижения генетического разнообразия, использование его результатов при создании селекционных программ совершенствования существующих и выведения новых пород и внутрипородных типов лошадей.

последовательностей ДНК, а также со спецификой их распределения в геноме различных групп животных.
Особый интерес представляет изучение популяционно-генетических закономерностей в клональных, малых и изолированных популяциях, к которым можно отнести и ряд пород и популяций лошадей, т.к. действие факторов, нарушающих генетическое равновесие (дрейф генов, прохождение через «горлышко бутылки», случайная гибель особей и др.), в таких популяциях может быть легко прослежено. Процесс фиксации аллелей гипервариабельных локусов в малых изолированных популяциях идет быстрее, поэтому метод ДНК-фингерпринтинга является наиболее эффективным для изучения изменчивости в этих популяциях.
Основным вопросом современной сельскохозяйственной генетики является эффективйое ведение селекции с помощью генов, маркирующих хозяйственно-полезные признаки (MAS — marker assisted selection). Для выявления такого рода маркерных генов общепринят следующий подход к решению проблемы. На первом этапе необходимо провести максимально полное обследование интересующей популяции (породы, внутрипородной группы, высокопродуктивного типа и т.п.) и сравнить полученные данные о генетической структуре с другими популяциями. Уже на этом уровне возможно выявление новых специфических последовательностей, эффективно характеризующих приобретенные качества у нового селекционного достижения, что объясняется рядом факторов, в том числе «эффектом основателя» [20, 40, 115].
Даже при отсутствии специфических фрагментов межпородный уровень распространенности разных аллелей локусов микросателлитов позволяет эффективно характеризовать породы. Необходимо отметить, что при анализе генетической структуры черно-пестрого и симментальского скота при использовании микросателлитов был достигнут значительно более высокий уровень достоверности по сравнению с традиционно использующимися фуппами крови крупного рогатого скота [18, 21].