Изменчивость митохондриальной ДНК и Y-хромосомы в популяциях Волго-Уральского региона

• Автор: Трофимова, Наталья Вадимовна
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2015
• Место защиты: Уфа
• Количество страниц: 192 с. : ил.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Этническая характеристика народов Волго-Уральского региона

1.1.1. Заселение Волго-Уральского региона по данным этнографии, археологии и антропологии

1.1.2. Этногенез народов Волго-Уральского региона

1.1.2.1. Башкиры

1.1.2.2. Татары

1.1.2.3. Чуваши

1.1.2.4. Марийцы

1.1.2.5. Мор два

1.1.2.6. Удмурты

1.1.2.7. Коми
1.1.2.8. Бесермяне
1.2. Преимущества использования в популяционных исследованиях
маркеров мтДНК и У-хромосомы
1.3. Номенклатура маркеров мтДНК
1.4. Характеристика основных гаплогрупп мтДНК
1.5. Номенклатура маркеров У- хромосомы
1.6. Характеристика основных гаплогрупп У хромосомы
1.7. Генетическое исследование популяций Волго-Уральского региона
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1 МАТЕРИАЛЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.2 МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.2.1 Выделение геномной ДНК
2.2.2. Полимеразная цепная реакция синтеза ДНК
2.2.3. Метод электрофореза
2.2.4 Анализ полиморфизма Y-хромосомы
2.2.5 Анализ полиморфизма мтДНК
2.2.6. Полное секвенирование мтДНК
2.2.7 Статистический анализ
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Генетическая структура популяций Волго-Уральского региона по данным митохондриального генома
3.1.1 Общая характеристика популяций Волго-Уральского региона по данным о изменчивости мтДНК
3.1.2 Филогеография гаплогруппы R0 мтДНК
3.1.3. Филогения гаплогруппы U мтДНК
3.1.4.Филогения гаплогруппы JT мтДНК
3.1.5. Филогеография гаплогруппы N мтДНК
3.1.6 Филогеография гаплогруппы М мтДНК
3.1.7. Генетическое разнообразие митохондриальных генофондов этнических групп Волго-Уральского региона
3.1.8. Генетические взаимоотношения между этническими группами Волго-Уральского региона
3.2. Общая характеристика популяций Волго-Уральского региона по данным о изменчивости Y-хромосомы
3.2.1. Филогеография гаплогруппы R Y-хромосомы
3.2.2. Филогеография гаплогруппы N Y-хромосомы
3.2.3. Филогеография гаплогруппы I Y-хромосомы
3.2.4. Филогеография гаплогруппы J Y-хромосомы
3.2.5. Филогеография гаплогруппы Е Y-хромосомы
3.2.6. Фипогеография гаплогруппы G Y-хромосомы
3.2.7. Восточноевразийские линии Y-хромосомы в Волго-Уральском регионе
3.2.8. Генетическое разнообразие Y-хромосомных генофондов этнических групп Волго-Уральского региона
3.2.9. Генетические взаимоотношения популяций Волго-Уральского региона по данным об изменчивости Y-хромосомы
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1 МАТЕРИАЛЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
Материалом для исследования служили образцы ДНК, выделенные из цельной крови неродственных индивидов. В исследовании были задействованы образцы из популяций удмуртов (г. Ижевск, населенные пункты Якшур-Бодьинского района, Удмуртия), бесермян (с. Юкаменское, с. Ежево, д. Шемордан, Удмуртия), коми (г. Сыктывкар), марийцев (Мишкинский район Республики Башкортостан), мордвы (г. Саранск), чувашей (г. Чебоксары), башкир (Бурзянский район РБ), башкир (Архангельский район РБ), башкир (Пермский край), а также из субпопуляций татар. К последним относятся казанские татары из различных районов Татарстана и татары, проживающие на территории Туймазинского района РБ. В виду того, что по разным системам маркеров было проанализировано различное число индивидов, размеры выборок указаны в разделе «Результаты и обсуждение» в соответствующих таблицах. Несмотря на то, что в настоящей работе обсуждаются туймазинские и казанские татары, данное разделение на субпопуляции условно, поскольку указывает только на географическое различие, причем казанские татары, как было отмечено выше, представляют собой дисперсную выборку. Этническая принадлежность, происхождение и родственные отношения уточнялись путем анкетирования. Все добровольцы дали информировашюе согласие на участие в исследовании. В исследовании были использованы только ДНК индивидов, относящих себя к определенному этносу, и чьи предки принадлежали к данном этносу до третьего поколения включительно.