Генетическая структура популяций человека юга Сибири в эпоху неолита и ранней бронзы : VI - начало III тыс. до н.э.

• Автор: Трапезов, Ростислав Олегович
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2014
• Место защиты: Новосибирск
• Количество страниц: 169 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. История развития палеогенетики

1.2. Проблема достоверности палеогенетических результатов

1.2.1. Специфические свойства древней ДНК

1.2.2. Проблема контаминации

1.2.3. Верификация палеогенетических данных

1.3. Области применения палеогенетики

1.4. МтДНК как молекулярно-генетический маркер для этногенетических и палеогенетических исследований
1.4.1. Особенности структуры генофонда мтДНК современного коренного населения юга Сибири
1.4.2. Палеогенетические работы, посвященные анализу древней мтДНК человека
1.5. Молекулярно-генетическое установление половой принадлежности останков человека и определение степени родства древних индивидов
1.6. Этнокультурные сообщества на территории юга Сибири в эпоху неолита и ранней бронзы
1.6.1. Археологическая и антропологическая характеристика населения Барабинской лесостепи эпохи неолита и ранней бронзы (VI - III тыс. до н.э.)

1.7. Археологическая и антропологическая характеристика населения Прибайкалья периода неолита и ранней бронзы (VI - III тыс. до н.э)
1.8. Археологическая и антропологическая характеристика населения афанасьевской культуры с территории Алтае-Саянской горной страны периода ранней бронзы (IV - III тыс. до н.э)
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Материалы
2.1.1. Критерии формирования выборок фрагментов скелетных останков
2.1.2. Палеоантропологические материалы, исследованные в работе
2.2. Методы
2.2.1. Предварительная обработка посткраниального костного материала
2.2.2. Предварительная обработка зубов
2.2.3. Экстракция ДНК
2.2.4. Амплификация участка ГВС 1 мтДНК
2.2.5. Меры против контаминации
2.2.6. Клонирование продуктов ПЦР
2.2.7. Определение нуклеотидной последовательности ДНК
2.2.8. Филогенетический и филогеографический анализ полученных данных по мтДНК
2.2.9. Метод многомерного шкалирования
2.2.10. Определение профиля БТК-локусов и установление половой принадлежности образцов
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ

3.1. Результаты генотипирования мтДНК представителей населения Барабинской лесостепи эпохи неолита и раннего металла (VI - начало III тыс.
до н.э.)
3.1.1. Гаплогруппа А10 в составе генофонда мтДНК древних популяций Барабинской лесостепи эпохи бронзы
3.2. Результаты генотипирования мтДНК представителей населения Прибайкалья эпохи неолита и ранней бронзы (VI - начало III тыс. до н.э.).
3.3. Результаты генотипирования мтДНК представителей населения афанасьевской культуры Алтае-Саянской горной страны эпохи ранней бронзы (IV - начало III тыс. до н.э.)
3.4. Профили БТЯ-локусов и статус молекулярно-генетических маркеров половой принадлежности представителей усть-тартасской культуры из коллективных захоронений могильника «Сопка-2» Барабинской лесостепи эпохи раннего металла (V - IV тыс. до н.э.)
Глава 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
4.1. Достоверность полученных экспериментальных данных
4.2. Структура генофонда мтДНК населения Барабинской лесостепи эпохи неолита и ранней бронзы (VI - начало III тыс. до н.э.)
4.2.1. Гаплогруппа А10 - возможный генетический маркер независимой локальной эволюции популяций человека в Западной Сибири
4.3. Формирование структуры генофонда мтДНК населения Прибайкалья эпохи неолита и ранней бронзы (VI - начало III тыс. до н.э.)
4.4. Структура генофонда мтДНК населения афанасьевской культуры Алтае-Саянской горной страны эпохи ранней бронзы (IV - начало III тыс. до н.э.)
4.5. Степень родства и половая принадлежность представителей населения усть-тартасской культуры из коллективных захоронений могильника «Сопка-2» Барабинской лесостепи эпохи ранней бронзы (V - IV тыс. до н.э.)

групп охотников-собирателей с первыми носителями навыков сельского хозяйства Центральной и Восточной Европы (эпоха неолита) и с современным населением региона (Haak et al., 2005; Bramanti et al., 2009). Была обнаружена существенная разница в структурах мтДНК между всеми тремя группами, которая не может наблюдаться для непрерывно существующей на протяжении нескольких тысячелетий популяции. Установлена необычно высокая частота (82 %) линий гаплогруппы U в исследованной серии древних охотников-собирателей (14 образцов относились к подгруппе U5, 2 - к U4, 2 - к неопределенной линии гаплогруппы U, при суммарной численности выборки 22 образца). Значительную часть этой выборки составляет подгруппа U5 (65 %), тогда как из современного населения Европы принадлежат к этой подгруппе 1-5 % для Средиземноморья, 5-7 % для Центральной Европы, 10-20 % для Северо-Восточной Европы. Частота подгруппы U4 - 1-5 %, с преобладанием в Северо-Восточной Европе. Таким образом, предполагается, что линии гаплогруппы U, в особенности подгруппы U5, доминировали в генофонде мтДНК охотников-собирателей Центральной Европы. Гаплогруппа U также была выявлена в мезолитических группах Испании (Hervella et al., 2012), в палеолитических и верхнепалеолитических образцах ДНК на территории современной Германии, Люксембурга и Чехии (Fu et al., 2013b), неолитических популяциях Скандинавии, Португалии и Франции (Chandler et al., 2005; Malmstrom et al., 2009; Lacan et al., 2011).
Присутствие подгруппы U2e было отмечено в образце мтДНК человека из верхнепалеолитической стоянки близ села Костенки Воронежской области возрастом около 32 тыс. лет (Krause et al., 2010). Показано, что первое население Центральной Европы с производящим типом хозяйства, появившееся в регионе в эпоху неолита, резко отличалось по структуре генофонда мтДНК от автохтонного населения региона, что указывает на миграционный характер их появления. Источником миграции по мнению Haak с соавторами (2010) является территория Ближнего Востока. Однако было показано, что имело место и параллельное сосуществование охотников-собирателей и пришлых групп с навыками сельского