Сравнительная цитогенетика основных таксонов в отрядах Perissodactyla и cetartiodactyla (Laurasiatheria, mammalia)

• Автор: Кулемзина, Анастасия Игоревна
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2010
• Место защиты: Новосибирск
• Количество страниц: 153 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. МЕТОДЫ СРАВНИТЕЛЬНОГО ИССЛЕДОВАНИЯ КАРИОТИПОВ

1.1.1. Методы дифференциального окрашивания

1.1.2. Молекулярно-генетические методы исследования кариотипов

1.1.2.1 Развитие методов in situ гибридизации

1.1.2.2. Метод сравнительного хромосомного пэйнтинга или ZooFISH

1.1.2.3. Получение проб для FISH

1.1.3. Принципы кладистики

1.2. МЕСТО ОТРЯДОВ PER1SSODACTYLA (НЕПАРНОКОПЫТНЫХ) И CETARTIODACTYLA (КИТОПАРНОКОПЫТНЫЕ) НА СОВРЕМЕННОМ ДРЕВЕ ПЛАЦЕНТАРНЫХ МЛЕКОПИТАЮЩИХ
1.3. ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ И КАРИОТИПИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ ОТРЯДА НЕПАРНОКОПЫТНЫХ (PERISSODACTYLA)
1.3.1. Семейство Equidae
1.3.1.1. Филогенетические взаимоотношения внутри семейства Equidae, времена дивергенции
1.3.1.2. Разнообразие кариотипов Equidae
1.3.2. Подотряд Ceratomorpha
1.3.2.1. Филогенетические взаимоотношения внутри Ceratomorpha
1.3.2.2. Кариотипы семейства Tapiridae
1.3.2.3. Кариотипы семейства Rhinocerotidae
1.3.3. Межвидовые гибриды отряда непарнокопытных
1.4. ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ И КАРИОТИПИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ ОТРЯДА КИТОПАРНОКОПЫТНЫХ (CETARTIODACTYLA)
1.4.1. Филогения и систематика отряда китопарнокоиытных
1.4.1.1. Отряд китообразных (Cetacea) является семейством отряда парнокопытных
1.4.1.2. Вопрос о базальной группе отряда китопарнокоиытных
1.4.1.3. Филогенетические взаимоотношения внутри группы семейств Ресога
1.4.2. Сравнительный хромосомный пэйнтинг видов отряда китопарнокопытных
1.4.2.1. Исследования кариотипов группы семейств Ресога
1.4.2.2. Исследования кариотипов группы семейств Suina
1.4.2.3. Исследования кариотипов семейства Camelidae
1.4.2.4. Исследования кариотипов семейств Cetacea и Hippopotamidae
1.5. Заключение
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Материалы
2.1.1. Растворы и реактивы

2.L.2. Культуры клеток, использованные для получения суспензий
2.1.3.Хромосомоспецифичные библиотеки
2.2 Методы
2.2.1. Получение первичных фибробластов из хрящевой ткани
2.2.2. Культивирование и криоконсервация культур фибробластов
2.2.3. Получение суспензии фиксированных клеток из культур фибробластов
2.2.3.1. Хранение фиксированных клеток
2.2.5. Дифференциальное окрашивание хромосом (G-бэндинг)
2.2.6. Хромосомный пэйнтинг
2.2.6.1. Характеризации наборов сортированных хромосом
2.2.6.2. Реамтификация библиотек в DOP-ПЦР
2.2.6.3. Мечение зондов в DOP-ПЦР
2.2.6.4. Флуоресцентная in situ гибридизация
2.2.7. Получение и обработка изображения
2.2.8. Филогенетический анализ хромосомных перестроек в кариотипах видов отряда Perissodactyla60
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ
3.1. МНОГОНАПРЛВЛЕННЫЙ ХРОМОСОМНЫЙ ПЭЙНТИНГ ДЛЯ ВИДОВ ОТРЯДА PERR1SODACTYLA
3.1.1. Выявление районов гомологии в кариотипах чёрного и белого носорогов (Diceros bicornis, Ceratoterium simum, Rhinocerotidae), человека и чепрачного тапира
3.1.2. Выявление районов гомологии в кариотипах чепрачного тапира (Tapirus indicus, Tapiridae) и человека
3.1.3. Выявление районов гомологии в кариотипах зебры Грэви (Equus grevi, Equidae), бурчелловой зебры (Equus burchelli, Equidae), человека и чепрачного тапира
3.1.4. Выявление районов гомологии в кариотипах онагра (Equus hemionus onager, Equidae), зебры Грэви и чепрачного тапира
3.2. Хромосомный пэйнтинг для видов отряда Cetartiodactyla
3.2.1. Выявление районов гомологии в кариотипах обыкновенной гринды (Giobicephala melas, Cetaceae), человека и одногорбого верблюда
3.2.2. Выявление районов гомологии в кариотипах обыкновенного бегемота (Hippopotamus amphibius, Hippopotamidae), человека и одногорбого верблюда
3.2.3. Выявление районов гомологии в кариотипах видов семейства Жирафовых (Giraffidae), человека и одногорбого верблюда
3.2.4. Выявление районов гомологии в кариотипах сибирской кабарги (Moschus moschiferus, Moschidae), человека и одногорбого верблюда
3.2.5. Выявление районов гомологии в кариотипах саолы (Pseudoryx nghetinhensis, Bovidae), человека и одногорбого верблюда
3.2.6. Дополнительные районы гомологии, выявленные в кариотипах свиньи (Sus scrofa, Suidae), коровы (Bos taurus, Bovidae) и одногорбого верблюда
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ
4.1. КАРИОТИПИЧЕСКАЯ эволюция отряда непарнокопытных

хромосома 41 (Trifonov etal., 2003).
Таким образом, семейство носороговых отличается от семейства лошадиных низкой вариабельностью числа хромосом и медленной скоростью изменения кариотипов.
1.3.3. Межвидовые гибриды отряда непарнокопытных
Интересной особенностью представителей отряда непарнокопытных является способность давать жизнеспособные межвидовые гибриды (Ryder et al., 1978). Это свидетельствует о высоком генетическом сходстве этих видов. Несмотря на то, что обычно межвидовые гибриды оказываются стерильными из-за большого количества меж- и внутрихромосомных перестроек, у семейства лошадиных известны и фертильные гибриды. Для гибридов между домашней лошадью и лошадью Пржевальского Шортом была показана возможность образования генетически сбалансированных гамет при сперматогенезе (Short et al., 1974). На основании выявленых районов гомологии между кариотипами осла и лошади, полученных с помощью хромосомного пэйнтинга, было дано объяснение фертильности некоторых мулов и предложен вариант образования возможных мультивалентов в ходе мейоза, которые при расхождении способны давать генетически сбалансированные гаметы (Yang et al., 2003b). Робинсон с соавт. описали животное, имеющее морфологические признаки чёрного и белого носорога. С помощью анализа микросателлитной ДНК и сравнительного хромосомного пэйнтинга было доказано, что данная особь действительно является межвидовым гибридом (Robinson et al., 2005). К сожалению, исследование фертильности этого гибрида оказалось невозможным из-за недоступности необходимых образцов. Наличие подобного гибрида является показателем удивительной консервативности носорогов, которые сохранили способность к скрещиванию, несмотря на 17 млн лет дивергенции.
1.4. Филогенетические и кариотипические исследования отряда китопарнокопытных (Cetartiodactyla)
Отряд китопарнокопытных всегда привлекал большое внимание