Структурно-функциональная характеристика генов-модификаторов иммунного ответа при заболеваниях печени различной этиологии

• Автор: Хеба Гамаль Абд Ель-Азиз Наср
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2011
• Место защиты: Томск
• Количество страниц: 156 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

Список сокращений

Введение

1. Литературный обзор

1Л. Хронические гепатиты: эпидемиология, патогенез и факторы прогрессирования

1.2. Роль полиморфизма генов-модификаторов иммунного ответа в развитии и течении заболеваний печени различной этиологии

1.3. Гены глутатион S-трансфераз и их вклад в развитие заболеваний печени

1.4. Функциональная активность генов-модификаторов иммунного ответа при патологиях печени различной этиологии

2. Материалы и методы

2.1. Структура и объем исследованного материала

2.2. Характеристика методов исследования

2.2.1. Молекулярно-генетические методы
2.2.2. Статистические методы
3. Результаты и обсуждение
3.1. Характеристика полиморфных вариантов генов IL12B(Al 188С) и (rs3212220 G/T), IL12RB1 (С2087Т) и (G531A), IFNG (Т-1488С),
IFNGR2 (G-1704/-), CTLA4 (G49A), TLR4 (Cl 190Т) у больных хроническим вирусным и алкогольным гепатитом
3.2. Анализ ассоциаций полиморфных вариантов генов IL12B
(Al 188С) и (rs3212220 G/T), IL12RB1 (С2087Т) и (G531 A), IFNG (Т-1488С), IFNGR2 (G-1704/-), CTLA4 (G49A), TLR4 (Cl 190Т) с хроническими вирусными и алкогольным гепатитом
3.3. Анализ ассоциаций генов IL12B (Al 188С) и (rs3212220 G/T),
IL12RB1 (С2087Т) и (G531A), IFNG (Т-1488С), IFNGR2 (G-1704/-),
CTLA4 (G49A), TLR4 (Cl 190Т) с морфологическими особенностями

течения заболевания
3.4. Ассоциаций полиморфных вариантов IL12B (Al 188С), IL12B (rs3212220 G/T), IL12RB1 (С2087Т), IL12RB1 (G531A), IFNG (Т-1488С), IFNGR2 (G-1704/-), CTLA4 (G49A), TLR4 (Cl 196Т) с патогенетически значимыми для течения хронического вирусного
гепатита количественными признаками
3.5 Функционирование генов иммунного ответа при заболеваниях
печени различной этиологии
Заключение
Выводы
Список литературы

Список сокращений
АБП - алкогольная болезнь печени
БГП - белковосвязанный гидроксипролин
Бил — билирубин
AJIT - аланинаминотрансфераза
ACT - аспартатаминотрансфераза
гцк — гепатоцеллюлярная карцинома
КЛ — коллагеназа
МГ - макроглобулин
ОбО - общий гидроксипролин
ПГП — пептидосвязанный гидроксипролин
ПИ - протеиназный ингибитор
ПТИ протромбиновый индекс
ПЦР - полимеразная цепная реакция
РТ-ПЦР - полимеразная реакция в реальном времени
СГП - свободный гидроксипролин
ТП - тимоловая проба
ФН - фибронектин
ЦП - цирроз печени
ХВГ - хронический вирусный гепатит
ХВГВ - хронический-вирусный гепатит В
ХВГС - хронический вирусный гепатит С
ЩФ - щелочная фосфатаза
ЭЛ - эластаза
CTLA4 —Г - лимфоцитарный антиген
HLA - главный комплекс гистосовместимости
HBV - вирус гепатита В
HCV — вирус гепатита С
IgE - иммуноглобулин Е
разработка новых антибиотиков, выявление мишеней для лекарственных препаратов, препаратов опознавания цели, и пролиферации стволовых клеток для терапевтическойимплантации.
Паттерн генной экспрессии может быть выявлен с помощью Нозерн-блот анализа. С помощью этого метода возможно количественное определение уровней РНК конкретных генов. Эта методика была разработана Джеймсом Алвином и Джорджем Старком, которые назвали по аналогии с Саузерн блоттингом (Alwine, 1977). Этот протокол включает несколько шагов. Выявление измененных уровней мРНК в клеточных линиях и тканях, приводящих к повышенной экспрессии онкогенов или отрицательной регуляции генов супрессоров опухолей, выявляет одно из возможных начальных событий, которое в дополнение к мутационным событиям, направляют клетку по пути онкогенной трансформации (Welsch, 2007; Kleeff, 2006). Таким образом, идентификация генов, дифференциально экспрессирующихся в различных клеточных линиях по сравнению с нормальной "здоровой" тканью позволяет уточнить функции гена. При изучении экспрессии, одним из самых популярных методов является анализ микрочипов (Ramsay, 1998).
Микрочиповые технологии были предложены для выявления экспрессии множества генов и улучшения диагностики. Первоначально они были задуманы для изучения экспрессии большого числа генов (DeRisi, 1996; Lockhart, 1996; Schena, 1996), применяются для анализа последовательностей ДНК (Pease, 1994), в иммунологии (Heller, 1997), для генотипирования и диагностики (Drmanac, 1998, Yershov, 1996). В контексте последнего, они могут использоваться для разграничения между последовательностей ДНК, отличающихся всего"лишь один нуклеотид полиморфизм (SNP) (Wang, 1998). Кроме того, в них заключен огромный потенциал для обнаружения патогенов, идентификации и генотипирования в молекулярных