Реконструкция процессов формирования населения Барабы эпохи бронзы методами анализа вариабельности мтДНК

• Автор: Пилипенко, Александр Сергеевич
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2010
• Место защиты: Новосибирск
• Количество страниц: 161 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. История развития и современный уровень палеогенетических исследований

1.1.1. История развития палеогенетических исследований

1.1.2. Факторы, осложняющие проведение палеогенетических исследований

1.1.3. Критерии верификации результатов палеогенетических исследований

1.1.4. Современный уровень достижений палеогенетики

1.1.4.1. Изучение ДНК микроорганизмов

1.1.4.2. Палеогенетика растений
1.1.4.3. Исследование останков животных
1.1.4.4. Палеогенетические исследования останков человека
1.2. Митохондриальная ДНК, как филогенетический маркер в исследованиях современных и древних групп человека
1.2.1. Свойства митохондриальной ДНК, как филогенетического маркера
1.2.2. Развитие методических подходов к анализу полиморфизма мтДНК
1.2.3. Некоторые подходы к реконструкции истории популяций на основании данных о структуре генофондов мтДНК
1.2.4. Разнообразие мтДНК в современных популяциях человека и процессы его формирования
1.2.5. Область применения анализа ДНК из древних останков человека
1.2.5.1. Филогенетические взаимоотношения Homo sapiens с другими представителями рода Homo
1.2.5.2. Анализ единичных останков древнего человека современного типа.
1.2.5.3. Анализ серийного палеоматериала для проведения этногенетических реконструкций
1.3. Современное и древнее население Западной Сибири по данным этногеномики и археологии
1.3.1. Состав генофонда мтДНК современного населения Западной Сибири
1.3.2. Этнокультурные сообщества эпохи бронзы на территории Барабинской лесостепи (по данным археологии)
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Материалы
2.1.1. Отбор палеоантропологических образцов для анализа
2.1.2. Палеоантропологические серии, исследованные в работе
2.1.3. Современные популяции Евразии, использованные для филогеографического анализа
2.2. Методы
2.2.1. Предварительная подготовка костного материала
2.2.2. Подготовка материала зубов к выделению ДНК
2.2.3. Экстракция тотальной ДНК
2.2.4. Амплификация фрагментов ГВС I мтДНК
2.2.5. Клонирование продуктов ПЦР
2.2.6. Определение нуклеотидной последовательности ДНК
2.2.7. Филогенетический анализ последовательности мтДНК
2.2.8. Анализ мтДНК из останков лошадей
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ
3.1. Состав линий мтДНК в сериях образцов палеоматериала разных периодов эпохи бронзы
3.1.1. Усть-гартасская культура эпохи раннего металла
3.1.2. Одиновская культура
3.1.3. Кротовская культура (ранний этап)
I 3.1.4. Позднекротовская культура
3.1.5. Андроновская (федоровская) культура Барабы
3.1.6. Культура эпохи поздней бронзы Барабы
3.1.7. Население городища Чича-1 переходного периода от бронзы к железу
3.2. Филогения мтДНК населения Барабы эпохи бронзы
Глава 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
4.1. Достоверность полученных экспериментальных данных
4.2. Специфика анализа образцов ДНК из останков представителей древних этнокультурных групп
4.3. Особенности состава гаплотипов в сериях образцов мтДНК от населения Барабы различных этапов эпохи бронзы и некоторые особенности этногенеза в западносибирской лесостепи
4.3.1. Особенности генофонда мтДНК ранних групп населения Барабы
4.3.2. Население Барабы в эпоху ранней и доандроновской развитой бронзы
4.3.3. Миграция населения андроновской культуры на территорию Барабы
4.3.4. Население культуры эпохи поздней бронзы Барабы
4.3.5. Разнообразие мтДНК населения городища Чича-1 и энтокультурные процессы в Барабе в переходный период от эпохи бронзы к эпохе железа
4.3.6. Специфический субкластер гаплогруппы Л, как вероятный автохтонный компонент генофонда мтДНК населения лесостепной полосы Западной Сибири и Волго-Уральского региона
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЯ

гаплогрупп западно-евразийского кластера: гаплогруппы N1, N2, X, U (Ul, U2e, U3,

U4, U5, U7, U8), TJ, HV (Richards et al., 2002; Metspalu et cd., 2004).
По всей видимости, на данном этапе расселения человека наблюдался низкий уровень генетических потоков между популяциями (Metspalu et al., 2004). Впоследствии, формирование разнообразия евразийских гаплогрупп мтДНК охватило и более северные регионы Евразии. Столь обширный ареал, охватывающий области с разнообразными внешними условиями, предполагает возможность формирования

многочисленных групп, хорошо приспособленных к конкретным локальным условиям внешней среды и изолированных в течение длительного времени географически и постепенно генетически отдаляющихся друг от друга. Это создало предпосылки и для интенсивной генетической диверсификации мтДНК, В результате, в различных регионах Евразии, расположенных севернее первоначальных центров

диверсификации, формируются второстепенные очаги диверсификации гаплогрупп и подгрупп мтДНК. Например, это очаги диверсификации гаплогрупп U4, U5 в Северо-Восточной Европе (Малярчук, 2004; Tambets et al., 2004) и гаплогрупп С, D - на юге Сибири (Derenko et al., 2003). Интересно, что датировки заселения территории Европы, основанные на данных о генетическом разнообразии мтДНК, тесно коррелируют с археологическими представлениями о времени распространения в регионе культур верхнего палеолита (Jorde et al., 1998; Gamble, 1999; Cavalli-Sforza, Feldman, 2003). Согласно предложенной модели, генофонды населения регионов, расположенных между основными ареалами западно- и восточно-евразийских гаплогрупп (Средняя и Центральная Азия, Западная Сибирь), по-видимому, сформировались при участии потомков обоих миграционных потоков (Малярчук, Деренко, 2006).
Таким образом, формирование почти всех крупных ветвей филогенетического дерева мтДНК человека (основных гаплогрупп) заканчивается к концу эпохи верхнего палеолита. Наступление ледникового максимума порядка 18 тыс. лет назад вносит существенные коррективы в процессы дальнейшей диверсификации мтДНК (Forster, 2004). Уменьшение общей численности населения, миграция значительной части оставшегося населения в более южные области (ледниковые рефугиумы), особенно выраженные для западной половины Евразии, с одной стороны, приводят к существенной редукции генетического разнообразия, а, с другой, к формированию