Особенности генетической структуры современных штаммов Bordetella pertussis.

• Автор: Гадуа, Натия Торникеевна
• Шифр специальности: 03.02.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2012
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 120 с. : 15 ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

Список сокращений

ВВЕДЕНИЕ

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

ГЛАВА I. ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ И КЛИНИЧЕСКИЕ

АСПЕКТЫ КОКЛЮШНОЙ ИНФЕКЦИИ

1.1. Особенности эпидемического процесса коклюшной

инфекции на рубеже веков в России и зарубежом.

1.2. Особенности клинической картины коклюша. 7 Глава II. МИКРОБИОЛОГИЧЕСКАЯ И МОЛЕКУЛЯРНОГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ВОЗБУДИТЕЛЯ 21 КОКЛЮША
2.1. Культурально - морфологические свойства Bordetella pertussis.
2.2. Антигенная структура Bordetella pertussis
2.2.1. Особенности структуры поверхностных агглютиногенов.
2.2.2. Основные факторы патогенности B.pertussis.
2.2.3. Патогенные свойства штаммов B.pertussis.
2.4. Генетическая структура B.pertussis.
2.5. Молекулярно-генетическая характеристика
циркулирующих штаммов B.pertussis.
СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
Глава III. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
3.1. Штаммы микроорганизмов
3.2. Методы исследования.
3.2.1. Микробиологические методы.
3.2.2. Определение вирулентности штаммов В. pertussis
3.2.3. Молекулярно-генетические методы.
3.2.4. Статистическая обработка результатов, анализ данных и программное обеспечение.
РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

Глава IV. Структура генов (ptxA, ptxB, ptxC, ptxD и ptxE), кодирующих S2, S3, S4 и S5 субъединицы В-комплекса коклюшного токсина и гена ргп штаммов B.pertussis, выделенных от больных коклюшем в настоящее время.
4.1. Структура гена ptxA, кодирующего S1 субъединицу А-комплекса коклюшного токсина.
4.2. Структура гена ptxB, кодирующего S2 субъединицу В-комплекса коклюшного токсина.
4.3. Структура гена ptxC, кодирующего S3 субъединицу В-комплекса коклюшного токсина.
4.4. Структура генов ptxD и ptxE, кодирующих S4 и S5 субъединицы В-комплекса коклюшного токсина.
4.5. Структура промоторной области коклюшного токсина (ptxP).
4.6. Структура гена ргп, кодирующего пертактин.
Глава V. Распространение штаммов В. pertussis, выделенных от больных коклюшем в различные периоды эпидемического процесса коклюшной инфекции с различными аллельными вариантами генов (ptxA, ptxB, ptxC, ptxD и ptxE), кодирующих A- (SI субъединица) и В- (S2, S3, S4 и S5 субъединицы) комплексы коклюшного токсина и его промоторную область, и гена ргп, кодирующего пертактин.
5.1. Распространение штаммов B.pertussis с различными аллельными вариантами гена ptxA, кодирующего S1 субъединицу A-комплекса коклюшного токсина.
5.2. Распространение штаммов B.pertussis с различными аллельными вариантами гена ptxB, кодирующего S2 субъединицу В-комплекса коклюшного токсина.
5.3. Распространение штаммов B.pertussis, с различными

аллельными вариантами гена ptxC, кодирующего S3 субъединицу В-комплекса коклюшного токсина.
5.4. Распространение штаммов В.pertussis с различными аллельными вариантами промоторной области коклюшного токсина (ptxP).
5.5. Распространение штаммов В.pertussis с различными аллельными вариантами генаргп, кодирующего пертактин. Глава VI. Сравнительный анализ структуры генов (ptxA, ptxB, ptxC, ptxP и ргп) штаммов B.pertussis, используемых для производства коклюшного компонента АКДС-вакцины, и современных штаммов B.pertussis, выделенных от больных коклюшем в России.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

B.bronchiseptica и В.pertussis- 0,7 - 3,5 миллионов лет и для В.parapertussis и B.pertussis - 0,8 - 4,0 миллионов лет. Следовательно, наиболее поздняя дивергенция произошла между В.parapertussis и B.pertussis, что также дало возможность считать, что самым последним видом среди трех видов Bordetella был возбудитель коклюша. Исследователи полагают, что В.parapertussis и B.pertussis имеют общего предшественника и произошли от B.bronchiseptica путем потери генов в процессе эволюции и приспособления к полному паразитизму. У этих видов утрачены гены, отвечающие за метаболические процессы, и возбудители используют ферментативные системы хозяина. В то время как основной состав генома представлен генами, входящими в островки патогенности, кодирующие большое количество факторов патогенности [204]. Кроме того, B.pertussis содержит самое большое количество псевдогенов и IS-элементов по сравнению с другими видами бордетелл. Такие гены кодируют детерминанты, отвечающие за различные функции, в первую очередь, рибонуклеиновый биосинтез, содержат 6,8% открытых рамок считывания (ORF) и ответственны за потерю или приобретение генетического материала у микроорганизов [19, 40, 159, 204].
В клетках микроорганизмов рода B.pertussis синтез всех главных факторов вирулентности регулируется единственным генетическим локусом, обнаруженным еще в 1983 году с помощью транспозонного мутагенеза и известным сейчас под названием bvg (bordetella virulence gene). Большинство знаний о данной системе регуляции получены при изучении В. bronchiseptica, но принцип ее действия аналогичен у всех Bordetella (рис. 11) [59, 64, 71, 94, 114, 125, 206, 226].
Координированная регуляция осуществляется посредством передачи сигнала из окружающей среды к генетическому аппарату клетки, приспособленному к реагированию на определенные изменения внешних условий.