Термотолерантные актиномицеты в пустынных, вулканических и горной почвах

• Автор: Курапова, Анна Игоревна
• Шифр специальности: 03.02.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2011
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 149 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР

1.1. Влияние условий окружающей среды на рост и развитие

актиномицетов

1.1.1. Отношение актиномицетов к кислотности среды

1.1.2. Алкалофильные и галоалкалотолерантные

актиномицеты

1.1.3. Развитие актиномицетов в условиях засухи

1.2. Термофилия у микроорганизмов

1.3. Систематическое положение термофильных актиномицетов

1.4. Экофизиологические особенности термофильных и
термотолерантных актиномицетов
1.5. Распространение термофильных актиномицетов в почвах
1.6. Термофильные и термотолерантные актиномицеты —
продуценты биологически активных веществ
1.6.1. Актиномицеты - продуценты антибиотиков
1.6.2. Термофильные актиномицеты - патогены животных
и человека
1.7. Прикладные аспекты изучения термофильных актиномицетов.
1.7.1. Участие в разложении труднодоступных соединений
углерода
1.7.2. Термофильные актиномицеты как индикаторы
нефтяного загрязнения почв
Глава 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Объекты исследования
2.1.1. Почвы пустынных степей Монголии
2.1.2. Горно-луговая почва Центрального Кавказа
2.1.3. Слаборазвитая слоисто - пепловая почва
Камчатки
2.1.4. Вулканическая дерновая почва кальдеры вулкана

2.1.5. Лугово-каштановая почва, загрязненная нефтью
2.2. Методы исследования

2.2.1. Методы выделения и дифференцированного учета
актиномицетов
2.2.2. Методы определения зависимости радиальной
скорости роста от температуры культивирования актиномицетов
2.2.3. Электронно-микроскопические исследования
актиномицетов
2.2.4. Метод сукцессионного анализа для исследования
развития актиномицетов в почвах
2.2.5. Флюоресцентный метод гибридизации in situ для
оценки биомассы метаболически активных клеток бактерий
2.2.6. Оценка интенсивности потребления хитина и
разложения углеводородов чистыми культурами микроорганизмов
2.2.7. Определение белка по Бредфорду
2.2.8. Выделение ДНК и амплификация фрагментов генов
16SpPHK
2.2.9. Использоваие метода денатурирующего
градиентнтного гель-электрофореза (ДГГЭ) для установления наличия в прокариотном микробном сообществе исследуемой пустынной почвы филума Actinobacteria
2.2.10. Определение жирокислотного состава липидов
мембран актиномицетов
2.2.11. Метод мультисубстратного респирометрического
тестирования
2.2.12. Опеделение ксеротолерантности умеренного
термофильного стрептомицета
2.2.13. Определение антимикробной активности
микроорганизмов методом агаровых блочков
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
3.1. Численность и таксономический состав актиномицетных комплексов периодически прогреваемых почв
3.2. Дискриминантный анализ пустынных почв Монголии, вулканических почв Камчатки и горно-луговой почвы Центрального Кавказа
3.3. Динамика длины мицелия и биомассы актиномицетов в ходе сукцессии, инициированной увлажнением пустынных почв

Монголии
3.4. Исследование филогенетической группы Actinobacteria прокариотных микробных сообществ периодически прогреваемых почв методом FISH (FISH-fluorescent in situ hybridization)
3.5. Установление присутствия филогенетической группы Actinobacteria в прокариотном микробном сообществе остепненно — пустынной почвы методом денатурирующего градиентного гель-электрофореза (ДГГЭ)
3.6. Зависимость радиальной скорости роста колоний актиномицетов от температуры культивирования
3.7. Экофизиологические свойства термотолерантных актиномицетов, выделенных из периодически прогреваемых почв
3.7.1. Доказательства ксеротолерантности умеренного термофильного штамма Streptomyces sp.
FR716
3.7.2. Выявление функциональных особенностей термотолерантных актиномицетов методом мультиреспирометрического тестирования (МРТ)
3.7.3 Исследование состава жирных кислот липидов
мембран умеренного термофильного стрептомицета Streptomyces sp. 315 FR716528 при разных температурах
3.7.4. Исследование антимикробных свойств термотолерантных актиномицетов
3.7.5. Исследование накопления биомассы и эмиссии ССЬ умеренным термофильным актиномицетом на среде с хитином в качестве единственного источника углерода и азота
3.8. Численность и таксономическая структура комплексов углеводородокисляющих мезофильных и термотолерантных актиномицетов в лугово-каштановой почве при нефтяном загрязнении
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Таблица 3.
Биологически активные вещества, разлагаемые термотолерантными
актиномицетами
Продуцент Биологически активное вещество Автор
Thermomonospora fusca алифатическо- ароматические кополиестры Kleeberg et al., 1
Saccharomonospora viridis пентахлорфенол Webb et al., 2
Microbispora, Saccharomonospora, Thermomonospora curvata, Thermomonospora chromogena MT814 Thermomonospora fusca BD 21 Streptomyces thermoviolaceus ксилан Kulkarni et al., 1
Streptomyces sp. strain AMT-3 ксилан Nascimento et al., 2
Streptomyces sp. Ab 106 ксилан Techapun et al., 2
Thermoactinomyces lanuginosus ксилан Christopher et al., 2
Microbispora spp хитин Nawani et al., 2
Streptomyces thermoviolaceus хитин Tsujibo et al., 1
Streptomyces sp хитин Gomes et al., 2
Streptomyces sp. QG-11-3 пектин, ксилан Beg et al., 2
Streptomyces sp. RCK-SC пектин Kuhad et al., 2
Streptomyces coelicolor пектин Xiao Y. et al., 2
Actinomadura miaoliensis 0-3 -гидроксилбутерат (полиэстер) Tseng et al., 2
Известны данные и о способности термофильных актиномицетов использовать такой природный полимер, как ксилан, содержащийся в большом количестве в древесине и играющий у растений роль запасного вещества (КиИсагш е! а1., 1999).