Диссипотрофные бактерии ксилотрофного сообщества в пресноводных экосистемах

• Автор: Зайчикова, Марина Викторовна
• Шифр специальности: 03.02.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2011
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 118 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

Актуальность проблемы

Цель и задачи исследования

Научная новизна

Научно-практическое значение

Апробация работы

Публикации

Структура диссертации

Место проведения работы и благодарности

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

ГЛАВА 1. РАЗЛОЖЕНИЕ ДРЕВЕСИНЫ КАК ГЛОБАЛЬНЫЙ ПРОЦЕСС
1.1. Масштабы процесса
1.2. Особенности лесо-болотных систем севера России
ГЛАВА 2. ДРЕВЕСИНА
2.1. Нахождение древесины в природе
2.2. Состав древесины
2.3. Разложение древесины
ГЛАВА 3. ГРИБЫ-КСИЛОТРОФЫ
3.1. Микогенная деструкция древесины в условиях наземных экосистем.
3.2. Характер разложения древесины
ГЛАВА 4. МИКО-БАКТЕРИАЛЬНОЕ СООБЩЕСТВО ПОЧВ
ГЛАВА 5. ОСОБЕННОСТИ КСИЛОТРОФНОГО СОБЩЕСТВА ПРЕСНОВОДНЫХ ЭКОСИСТЕМ
5.1. Грибы в условиях водных биоценозов
5.2. Микроорганизмы ксилотрофного консорциума в условиях
пресноводных экосистем
ГЛАВА 6. ДИСТРОФНЫЕ ВОДЫ

6.1.Формирование дистрофных вод
6.2. Физико-химические характеристики дистрофных вод
6.3. Гуминовые соединения
ГЛАВА 7. БАКТЕРИАЛЬНЫЕ СООБЩЕСТВА В ПРЕСНОВОДНЫХ ЭКОСИСТЕМАХ
7.1. Анализ бактериального разнообразия микробного сообщества
7.2. Омброфилы — обитатели дистрофных ультрапресных вод
7.3. Бактерии начальной стадии формирования дистрофных вод
7.4. Типичные представители пресноводной микробиоты
7.4.1. ПорядокРіапсіотусеіаіев
7.4.2. Группа Уеггисопи'сгоЬіа
7.4.3. Семейство ХаШйоЬаМегасеае
7.4.4. Порядок СаиІоЬасіегіаІез
ЗАКЛЮЧЕНИЕ ПО ЛИТОБЗО РУ
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
ГЛАВА 8-ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
8.1. Выделение чистых культур бактерий-диссипотрофов, входящих
в состав исследуемого сообщества
8.1.1. Объект исследования
8.1.2. Лабораторная модель
8.1.3. Разложение древесины в условиях лабораторной модели
8.1.4. Выделение микроорганизмов
8.2. Методы исследования
8.2.1. Микроскопические исследования
8.2.2. Определение экофизиологических характеристик
8.2.3. Молекулярно-генетические исследования
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
ГЛАВА 9. БИОРАЗНООБРАЗИЕ БАКТЕРИЙ В ИССЛЕДУЕМОМ
СООБЩЕСТВЕ
ГЛАВА 10. ХАРАКТЕРИСТИКА НОВЫХ ВИДОВ БАКТЕРИЙ,

ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ ИССЛЕДУЕМОГО СООБЩЕСТВА
10Л. Ancylobacter abiegnus sp. nov. - новый ацидотрофный представитель рода Ancylobacter
10.2. Xanfhobacter xylophilus sp.nov. штамм Z-0
10.3. Singulisphaera mucilagenosa sp. nov. штаммы Z-0071T и Z-0072.
ГЛАВА 11. ДРУГИЕ ПРЕДСТАВИТЕЛИ БАКТЕРИАЛЬНОГО СООБЩЕСТВА ДИСТРОФНЫХ ВОД
11.1. Seliberia sp. штамм Z-0
11.2. Spirosoma sp. штамм Z-0
11.3. Methylobacterium isbiliense, штаммы Z-0033, Z-0
11.4. Hyphomicrobium facile subsp tolerans штамм Z-0
ГЛАВА 12. ГИДРОЛИЗ ДРЕВЕСИНЫ БИНАРНОЙ КУЛЬТУРОЙ
PSEUDOMONAS SP. Z-0044 И STREPTOMYCES PSEUDOGR1SEOLUS
ГЛАВА 13. ПОЛОЖЕНИЕ ВЫДЕЛЕННЫХ ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ ОМБРОФИЛЬНЫХ ДИССИПОТРОФОВ В ТРОФИЧЕСКОЙ СХЕМЕ
МИКО-БАКТЕРИАЛЬНОГО СООБЩЕСТВА
13.1. Характеристика представителей ацидотрофной группировки
13.2. Характеристика представителей сахаролитической группировки
13.3. Характеристика представителей метилотрофной группировки
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ
ЛИТЕРАТУРЫ

дистрофных вод формируются кислые условия, данные бактерии относятся к ацидофилам либо ацидотолерантам. [Wiley, 1990].
2. Также для подобных сообществ, в особенности для микофильной группировки, характерны широко распространенные, обычные для наземных и водных биоценозов виды, представители родов Micrococcus, Methylobacterium и т.д., для которых данное сообщество служит естественным резервуаром. Последний прежде был обнаружен в ассоциации с растениями, продуцирующими оксалат [Sahin, 2003].
7.4. Типичные представители пресноводной микробиоты.
Из наиболее важных представителей климактерической микрофлоры ультрапресных кислых дистрофных вод можно выделить несколько групп.
7.4.1. Порядок Planctomycetales.
Представители планктомицетов, выделенные в чистые культуры, образуют порядок Planctomycetales с единственным семейством Planctomycetaceae, которое в настоящее время содержит 9 родов: Planctomyces, Pirellula, Gemmata, Isosphaeara, Schlesneria, Singulisphaera, Zavarzinella, Rhodopirellula, Blastopirellula [Ward N. et al, 2006; Schlesner H.K., 1994]. Данная группа включает специфическую группу микроорганизмов, имеющую ряд отличий от других представителей домена Bacteria. В число их уникальных особенностей входит отсутствие пептидогликана в клеточной стенке, вместо которого присутствует гликопротеин. Поверхность покрыта кратероподобными структурами, назначение которых пока неизвестно. В их мембранах обнаружены гопаноиды, цитоплазма разграничена на компартменты, окруженные мембраной [Lindsay, 2001], нуклеоид также ограничен двойной мембраной. Последнее является особенностью, характерной скорее для эукариот [Fuerst, 2005]. Компартмент, содержащий рибосомы и белки называется пиреоплазма или рибоплазма, безрибосомный