Персистенция Mycoplasma hominis у человека : восприимчивость к микоплазменной инфекции и ответные реакции микоплазмы на стрессоры

• Автор: Баранова, Наталья Борисовна
• Шифр специальности: 03.02.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2010
• Место защиты: Казань
• Количество страниц: 194 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК ПРИНЯТЫХ СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Молекулярная и клеточная биология микоплазм

1.1.1. Современные представления о таксономии и филогении микоплазм

1.1.2. Особенности морфологии и ультраструктуры микоплазм

1.1.3. Геном микоплазм и особенности структурной организации генетического материала Mycoplasma hominis PG

1.1.4. Концепция «минимальной» клетки и постгеномые исследования микоплазм

1.2. Феноменология микоплазменных инфекции у человека

1.2.1. Взаимодействие микоплазм с иммунной системой человека
112.1.1. Цитоадгезия и генетически опосредованная антигенная вариабельность микоплазм Mycoplasma hominis
1.2.1.2. Прямое и опосредованное воздействие микоплазм на иммуноциты: хромосомные аберрации и анергия иммунокомпетентных клеток
1.2.1.3. Провоспалительные и противовоспалительные цитокины и
полиморфизм генов ключевых иммуномедиаторов (IL-1, IL-

1.2.2. Клинические и биохимические аспекты персистенции
микоплазм: особенности инфекций, вызываемых Mycoplasma hominis
1.3. Адаптация микоплазм к неблагоприятным условиям среды и контроль микоплазменных инфекций
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Культивирование М. hominis на искусственных питательных
средах
2.2. Определение численности колониеобразующих единиц М. hominis PG
2.3. Трансмиссивная электронная микроскопия препаратов
2.4. Атомно-силовая микроскопия ДНК
2.5. Оценка токсичных и генотоксичных эффектов клеток М. hominis PG
2.6. Выделение и очистка ДНК
2.6.1. Выделение ДНК из клинического материала с помощью коммерческих наборов
2.6.2. Выделение ДНК из клеток микоплазмы, культивируемых in
vitro
2.6.3. Выделение ДНК из препаратов цельной крови
2.7. Амплификация нуклеотидных последовательностей генов полимеразной цепной реакцией
2.8. Рестрикционный анализ ампликонов
2.9. Электрофоретическое разделение фрагментов ДНК в агарозном геле
2.10. Выделение, дифференциальная окраска и разделение белков с помощью двумерного электрофореза
2.11. Идентификация белков М. hominis PG37 с помощью MALDI TOF/TOF MS
2.12. Определение нуклеотидных последовательностей ДНК
М. hominis PG
2.13. Анализ нуклеотидных и аминокислотных последовательностей in silico
2.14. Статистическая обработка полученных данных
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Частота встречаемости М. hominis у индивидов с отягощенным

акушерским анамнезом
3.2. Распределение частоты встречаемости вариантов IL-1 (JL-1B-511С>Т, IL-1 В+3954С>Т и IL-IKN(VNTR)) и IL-10 (IL-10-1082G>A) у инфицированных и не инфицированных М. hominis индивидов
3.3. Особенности структуры vaa-гена у клинических изолятов
М. hominis
3.3.1. Сравнительный анализ структуры vaa-гена у клинических изолятов М. hominis с помощью ПЦР и ПДРФ
3.3.2. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей vaa-гена у клинических изолятов М. hominis
3.4. Особенности морфологии и ультраструктуры клеток М. hominis
PG37, образующихся в различных условиях среды
3.5. Сравнительный анализ метрических параметров и матричных свойств ДНК клеток М. hominis PG37, образующихся в различных условиях среды
3.6. Сравнительный анализ токсигенности М. hominis PG37 при культивировании микоплазмы в различных условиях
среды
3.7. Сравнительный протеомный анализ клеток М. hominis PG37, образующихся в различных условиях среды
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ

соответствующие ферментативные системы и интермедиаты присутствуют в клеточном экстракте М. hominis 07 [VanDemark, Smith, 1964].
В качестве основных источников энергии микоплазмы могут использовать глюкозу и (или) аргинин, а также мочевину; дополнительно могут утилизировать фруктозу, трегалозу, сахарозу, мальтозу, малат, мальтодекстрины и ксилулозу [Jaffe et al., 2004; Razin, 2006, Dybvig et. al., 2008; Kube et al., 2008].
M. hominis способна использовать аргинин в качестве источника АТФ — АДГ . путь в геноме М. hominis PG21 представлен генами, кодирующими аргининдезиминазу (агсА, МНО_0690), орнитин-карбамоилтрансферазу
(агсВ, МНО_0640) и карбаматкиназу (arcG, МНОДЗбЗО) [Pereyre et al., 2009]. Поступление аргинина в клетку осуществляется в виде: аминокислоты: с помощью^ предполагаемого транспортера (N41Ю 5040) и/или в пептидевязанной: форме с помощью олигопептид-пермеазной системы-(Ml Ю 1510-1550) |Pereyre et al., 2009]; Предполагается; что OEC МНО_25.40 кодирует диметиларгинин-диметиламиногидролазу (ДДАГ) — фермент, который! в отличие: от аргининдезиминазы, может использовать. N-диметиларгинин в качестве альтернативного: аргинину источника: энергии [Pereyre: al., 2009]. Ассиметричныи. диметиларгинин является эндогенным
конкурентным блокатором: NO-синтаз человека. [Еилинский, 2007]..
Потребление соответствующего компонента микоплазмой может быть полезным для инфицированного- организма с ТОЧКИ: зрения биохимии патологических процессов при атерогенезе — обусловливать, более «мягкое течение» инфаркта миокарда, наблюдаемое у больных с персистенцией М. hominisАрлеевский и др., 2003].
Считается, что АДГ путь в клеткак М. hominis PG21 является основным для; получения АТФ микоплазмой [Pereyre et al., 2009]. Между тем интеграция ЭМП и ПФ путей, представленных у М; hominis PG21 полным спектром компонентов, за исключением 6-фосфофруктокиназы, глюкозо