Эволюция клещевого энцефалита в Центральном федеральном округе России. Моделирование смены подтипов возбудителя в эксперименте.

• Автор: Герасимов, Сергей Геннадьевич
• Шифр специальности: 03.02.02
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2012
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 196 с. : 17 ил.

СОДЕРЖАНИЕ
Список условных сокращений
Введение
Часть I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
Глава 1. Эпидемиология клещевого энцефалита (КЭ). Эволюция заболевания и его особенности на современном
этапе
1.1. Нозоареал КЭ, заболеваемость КЭ в России и отдельных регионах.
1.2. Вопросы экологии ВКЭ
1.3. Пути передачи ВКЭ
1.4. Клинические формы КЭ
1.5. Эволюция КЭ
1.6. Изучение эпидемиологии КЭ в Ярославской области (ЦФО РФ)
Глава 2. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита
2.1. Строение вириона и организация генома ВКЭ
2.2. Классификация ВКЭ по серотипам и методы их дифференцирования
2.3. Классификация ВКЭ по генотипам и методы
типирования (генотипирования) ВКЭ
2.4. Распределение подтипов ВКЭ в разных частях ареала
2.5. Мониторинг популяции ВКЭ на основе типирования хронологических рядов штаммов
2.6. Влияние экологических и климатических факторов на эволюцию возбудителей и переносчиков КЭ (гипотезы)
2.7. Дифференциация природных очагов КЭ в зависимости от структуры вирусных популяций
Глава 3. Смешанные инфекции в природе и эксперименте
3.1. Микстинфекции, переносимые иксодовыми клещами
3.2. Политиповые штаммы ВКЭ
3.3. Основные типы взаимодействия между вирусами
3.3.1. Не генетические взаимодействия арбовирусов при экспериментальной смешанной инфекции
3.3.2. Генетические взаимодействия у арбовирусов
Часть II. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
Глава 4. Материал и методы
4.1. Анализ особенностей эпидемиологии КЭ в Ярославской области за период 1992-2012 гг

4.2. Штаммы и изоляты РНК ВКЭ, выделенные из клещей, от больных и умерших пациентов в Ярославской области (1983-2012 гг.)
4.3. Моделирование смешанной инфекции сибирского и дальневосточного подтипов ВКЭ в экспериментах на животных
4.4. Применение метода ПЦР для детекции РНК/ДНК ВКЭ,
В. burgdorferi sensu lato, A. phagocytophillum, Е. chaffeensis/E muris.
4.4.1. Этапы проведения ПЦР. Методики скрининговых исследований
4.4.2. Генотипирование штаммов и изолятов РНК ВКЭ и определение концентрации РНК ВКЭ в тканях лабораторных животных, полученных при смешанной инфекции
4.5. Описание методики иммуноферментного анализа (ИФА) на определение антигена ВКЭ в клещах
4.6. Статистическая обработка результатов исследований
Глава 5. Особенности эпидемиологии КЭ в Ярославской области в период 1992-2012 гг. Проявления эволюции заболевания
5.1. Ландшафтная, климатическая и эпизоотологическая характеристика
Ярославской области
5.2.Особенности эпидемиологии КЭ в Ярославской области
за период 1992-2012 гг
5.3. Механизмы передачи КЭ
5.4. Клиническая картина КЭ у больных в Ярославской области (1996-2012 гг.)
5.5. Основные методы профилактики КЭ в Ярославской области
Глава 6. Результаты исследования клещей из Ярославской и Костромской областей методами ИФА на антиген ВКЭ и ПЦР на зараженность 4 группами клещевых патогенов
6.1. Исследование клещей из Ярославской области методами ИФА и

6.2. Исследование клещей из природных стаций Костромской области
в 2009 и 2011-2012 гг. методом ПЦР
Глава 7. Мониторинг структуры популяции ВКЭ
в Ярославской области за 30-летний период
7.1. Ретроспективный анализ вирусологических и
иммунологических исследований периода 1974-1998 гг
7.2. Характеристика генетической структуры популяций ВКЭ на основе анализа хронологических рядов штаммов и изолятов РНК
7.3. Нейровирулентность и нейроинвазивность ярославских штаммов

7.4. Локализация РНК ВКЭ сибирского подтипа в структурах мозга умерших пациентов
7.5. Политиповые штаммы ВКЭ; результаты изучения их свойств
и стабильности
Глава 8. Экспериментальная смешанная инфекция дальневосточного и сибирского подтипов ВКЭ
8.1. Изучение взаимодействия двух подтипов ВКЭ в экспериментах на животных, определение факторов, влияющих на характер взаимодействия
8.2. Особенности взаимодействия двух подтипов ВКЭ при острой
и латентной инфекции
Обсуждение
Выводы
Приложения
Список литературы

(Пошехонский, Любимский, Даниловский), расположенных в лесной ландшафтной зоне [39]. Сведения о количестве заболевших были неточными и не позволяли рассчитать заболеваемость. В 1959-1960 годах случаев заболеваний отмечено не было. В период с 1961 по 1963 годы заболеваемость КЭ была незначительной и не превышала показателей 0,07 на 100 тысяч населения (рис. 3). В 1964 году отмечался небольшой подъем заболеваемости до показателя 1,2 на 100 тыс. населения Число заболеваний КЭ в области выросло до 17 случаев. 50% всех случаев регистрировалась у жителей Пошехонского района, 25% - у жителей Рыбинского района. Показатели заболеваемости КЭ в этих районах были максимальными и составили соответственно 18,8 и 7,1 на 100 тыс. населения [39].
Наряду с увеличением заболеваемости КЭ в этот период в области начала увеличиваться распространенность этой инфекцией по другим территориям области, включая города. Впервые в 1964 году заболел КЭ один житель города Ярославля [39].
В 1965-66 годах заболеваемость вновь снизилась до спорадической, единичные случаи выявлялись среди сельского населения северных районов, расположенных в лесной зоне, показатели заболеваемости по области составили соответственно 0,8 и 0,14 на 100 тысяч населения.
Наиболее стремительный рост заболеваемости КЭ отмечался в 1967 году, когда были зарегистрированы 58 заболеваний в 9 районах области и впервые множественные случаи заболеваний КЭ появились среди городских жителей -8 в г. Ярославле и 3 — в г. Рыбинске (19% от числа всех заболевших).
В последующие годы (1969-1991 гг.) кривая заболеваемости характеризовалась небольшими подъемами и спадами (рис. 3) и держалась на низком уровне, в пределах показателей 0,1 - 0,8 на 100 тыс. населения [39].
Особенностью этого периода стало увеличение в числе заболевших КЭ доли жителей городов Ярославль и Рыбинск - они составили 30% от числа заболевших КЭ в области. Однако больше половины заболеваний КЭ по-прежнему происходили в Пошехонском районе, показатель заболеваемости