Анализ изменчивости митохондриальных ДНК тубаларов Горного Алтая и эвенов Восточной Сибири

• Автор: Мазунин, Илья Олегович
• Шифр специальности: 03.01.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2010
• Место защиты: Новосибирск
• Количество страниц: 104 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ СОКРАЩЕНИЙ И ТЕРМИНОЛОГИЯ

Введение

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Митохондриальная ДНК человека

1.2. Номенклатура митохондриальных гаплогрупп

1.3. Молекулярные методы для идентификации мтДНК гаплогрупп

1.4. Филогеографический подход к изучению разнообразия мтДНК и концепция молекулярных часов

1.5. Хронология эволюционных событий

1.6. Эволюционная история митохондриального генома человека

1.7. Особенности применения мтДНК при изучении расселения человека

1.8. Причины территориально-специфического разнообразия мтДНК человека
1.9. Структура генетических изолятов
1.10. Краткая этническая история популяций
1.10.1. Тубалары горного Алтая
1.10.2. Эвены Нижней Индигирки и Приохотья
1.11. Заключение
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Величина и состав выборки
2.2. Молекулярно-генетический анализ
2.2.1. Выделение и очистка ДНК
2.2.2. Гаплотипирование образцов
2.2.3. Секвенирование мтДНК

2.3. Филогенетический и статистический анализ
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
3.1. Разнообразие мтДНК тубаларов горного Алтая
3.2. Разнообразие мтДНК эвенов восточной Сибири
3.3. Сравнительный анализ разнообразия мтДНК тубаларов горного Алтая и эвенов восточной Сибири
3.4. Сравнительный анализ разнообразия мтДНК гаплогрупп популяции Сибири
3.5. Оценка генетических дистанций популяций коренных жителей Сибири
3.6. Филогенетический анализ
Глава 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ СОКРАЩЕНИЙ И ТЕРМИНОЛОГИЯ ГВС-I - гипервариабельный сегмент, нуклеотиды с позиции 16024 по 16
КР - контрольный район, участок мтДНК с позиции 16024 по
мтДНК — митохондриальная ДНК
п.н. — пара нуклеотидов
ОФ - окислительное фосфорилирование
ПДРФ - полиморфизм по длине рестрикционных фрагментов
ПЦР — полимеразная цепная реакция
ЧСВ - человек современного вида, Homo sapiens sapiens
яДНК - ядерная ДНК
SNP - ОНП, одно-нуклеотидный полиморфизм (Single Nucleotide Polymorphism)
Время коалееценции/дивергенции - время существования наиболее близкогообщего предка для группы последовательностей.
Гаплогруппа (линидж) - совокупность гаплотипов, производных гаплотипа-основателя.
Гаплотип — набор полиморфных сайтов (вариант нуклеотидной последовательности), наследуемый в виде одной группы сцепления.
Гомоплазия - независимое приобретение мутаций в разных ветвях филогенетического древа. Выделяют обратные и параллельные мутации.
Кластер - определяется при филогенетическом анализе, включает группу последовательностей, объединяемую общим предком (является синонимом для понятий гаплогруппа, субгаплогруппа).
Макрогаплогруппа - совокупность гаплогрупп, объединяемых наличием/отсутствием определенных мутаций мтДНК.
Субгаплогруппа - более мелкое подразделение гаплогруппы (может также выступать в виде синонима для понятия гаплогруппа при дальнейшем повествовании).

1.10.1. Тубалары горного Алтая
Тубалары известны ещё по китайской летописи с конца V века. Относительно происхождения тубаларов существует несколько точек зрения. Согласно первой, язык и верования тубаларов являются общими с алтайскими калмыками (Вербицкий, 1870). Другая точка зрения основана на том, что самоназвание «туба» («черневые татары») также принадлежит сойотам (тувинцам). Другими словами, этноним «туба» указывает на возможное переселение с востока самодийских племён (Кас11о£(, 1883). Все племена Алтае-Саянского нагорья, именующие себя «туба» (тувинцы, тофалары), Радлов считал смесью самодийских и кетских этнических элементов, подвергшихся тюркизации по языку. Согласно третьей точке зрения, северные алтайцы рассматриваются как отюреченные енисейские остяки и самодийцы, за исключением кумандинцев и челканцев (лебединцев), которые, вероятно, связаны с древними тюрками (Богораз, 1926). Л. П. Потапов изучая историю происхождения северных алтайцев (шорцев, кумандинцев, челканцев и тубаларов), пришел к выводу об их смешанном этническом происхождении при участии самодийских, кетских и даже угрских элементов, а также о присутствии древне-тюркского этнического компонента (Потапов, 1953). Согласно переписи 1897 года, территория их обитания разделялась на четыре волости Южная, Кузенская и Комляшская, которые, в свою очередь, объединяли 22 рода. В силу своего территориального расположения тубалары впитали в себя некоторые культурные элементы кумандинцев и челканцев, двух других племен, обитающих на Алтае. Однако благодаря большей обособленности, монголоидные черты тубаларов выражены слабее, нежели у остальных алтайских племен, например, встречаются и светловолосые, и светлоглазые представители.
Для тубалар был характерен уклад жизни, включающий пешую охоту, таежное рыболовство, мотыжное земледелие и собирание диких съедобных растений, резко отличающийся от такового у южных алтайцев. Охота, будучи