Взаимодействие базидиальных грибов с гуминовыми веществами

• Автор: Кляйн, Ольга Ивановна
• Шифр специальности: 03.01.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 160 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ
1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ. ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ БАЗИДИОМИЦЕТОВ С ТВ (НА ПРИМЕРЕ ГРИБОВ РОДА TRAM ETES)

1.1. Общая характеристика базидиальных грибов рода Trame/es

1.1.1. Распространение и роль в природе

1.1.2. Практическое применение базидиомицетов рода Trametes

1.1.3. Основные ферменты лигнинмодифицирующей системы грибов — возбудителей белой гнили

1.2. Общая характеристика ГВ

1.2.1. Основные функции ГВ в природе

1.2.2. Физико-химические свойства и структура ГВ

1.2.3. Биологическая активность ГВ
1.2.4. Гипотезы образования ГВ
1.3. Взаимодействие базидиомицетов с ГВ
1.3.1. Разложение ГВ базидиомицетами и влияние ГВ на их рост
1.3.2. Поступление ГВ в клетки базидиомицетов и влияние на основные метаболические пути
1.3.3. Исследование взаимодействия базидиомицетов с ГВ на молекулярном уровне

2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2Л. Культивирование базидиомицетов
2.1.1. Подготовка посевного материала
2.1.2. Твердофазное культивирование
2.1.3. Жидкофазное стационарное культивирование
2.1.4. Жидкофазное глубинное культивирование
2.2. Оценка динамики активности основных ферментов ЛМС
2.2.1. Определение лакказной активности
2.2.2. Определение активности Мп-пероксидазы
2.2.3. Определение активности лигнинпероксидазы
2.3. Выделение и физико-химическая характеристика препаратов ГВ
2.3.1. Элементный анализ !
2.3.2. Эксклюзионная хроматография
2.3.3. 13С ЯМР спектроскопия ГВ
2.4. Изучение морфологии Т. maxima и трансформированных ГВ методами световой и электронной микроскопии
2.4.1. Изучение морфологии Т. maxima методом световой микроскопии с использованием прижизненного окрашивания
2.4.2. Изучение особенностей морфологии Т. maxima методом ПЭМ
2.4.3. Изучение морфологии Т. maxima методом СЭМ
2.4.4. Исследование угля методом СЭМ
2.5. Исследование взаимодействия Т. maxima с ГВ

2.5.1. Исследование состава и содержания углеводов в цитозоле
2.5.2. Исследование клеточного дыхания
2.5.3. Определение активности и идентификация СОД
2.5.4. Исследование поступления ГВ
2.6. Исследование влияния ГВ на протеом и секретом Т. maxima
2.6.1. Выделение и очистка внутри- и внеклеточных белков
2.6.2. Измерение концентрации белка
2.6.3. Разделение белков методом двумерного электрофореза
2.7. Исследование влияния ГВ на экспрессию генов Т. maxima
2.7.1. Выбор исследуемых генов
2.7.2. Выделение суммарной РНК
2.7.3. Синтез комплементарной ДНК
2.7.4. Амплификация дц-ДНК
2.7.5. Проведение ПЦР в реальном времени
2.7.6. Выбор референсного гена
2.8. Оценка биологической активности продуктов взаимодействия базидиомицстов с ГВ
2.8.1. Проведение мелкоделяночного эксперимента
2.8.2. Проведение лабораторно-вегетационных экспериментов
2.8.3. Оценка антиоксидантной емкости ГВ
3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Трансформация ГВ базидиомицетами

Таблица 1.4 - Базидиальные грибы, для которых показана способность деградировать ГВ
Гриб Источник
Auricularia sp. m37а Hofrichter and Fritsche, 1
Bjerkandera adusta Solarska et al., 2009; Komillowicz-Kowalska et al., 2008; Gramss et al., 1999; Bclcarz ct al., 2
Coriolus corners Yanagi et al., 2002, 2
Clitocybulci ditsenii Scheel et al., 1999; Hofrichter et al., 1999; Gramss et al., 1999; Ziegenhagen and Hofrichter, 1997, 1
Collybia diyophila K209 Steffen et al., 2
Fomilopsis pinicola Gramss et al., 1
Gynmopus erythropusa Snajdr et al., 2
Gymnopilus sapineus Gramss ct al., 1
Geotrichum-like strain R59 Belcarz et al., 2
Gloeophyllum trabeum Pozo et al., 2
Hypholoma fascicnlare Snajdr et al., 2011; Gramss et al., 1999; Hurst et al., 1
Hypholoma frowardii Gramss et al., 1
Lenzites betulina Yanagi et al., 2
Lentinula edodes Gotzand Fakoussa, 1
Kuehneromyces mutabilis Gramss etal., 1
Nematoloma frowardii Wunderwald et al., 2
Nematoloma frowardii Hofrichter et al., 1999; Hilden et al., 2008; Scheel et al., 1999; Hofrichter et al., 1998; Hofrichter and Fritsche, 1997, 1997a
Piptoporus belulinus Gramss et al., 1
Polyporus versicolor Claus and Filip, 1
Polyporus brumalis Hurst et al., 1
Polyporus arcularius Flurst et al., 1
Polyporus resinosus Hurst et al., 1
Polyporus schweinitz Hurst et al., 1
Polyporus sp. Solarska et al., 2
Polystictus versicolor Hurst et al, 1
Pleurotus ostreatus Loffredo et al., 2012; Gramss et al., 1
Phanerochaete chrysosporium Elbeyli et al., 2006; Kabe et al., 2005; Stevens et al., 1996; Dehorter and Blondeau, 1992; Dchortcr et al., 1992; Kontchou