Исследование методами СЗМ иммобилизации молекул ДНК и оценка их проводимости

• Автор: Шарипов, Талгат Ишмухамедович
• Шифр специальности: 03.01.02
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2011
• Место защиты: Саратов
• Количество страниц: 111 с. : ил.

Список сокращений

Введение

Глава I. Молекула ДНК: строение, свойства, наблюдение

1.1. Строение молекулы ДНК

1.2. Визуализация молекул ДНК

1.3. Иммобилизация молекул ДНК

1.4. Биочипы

1.5. Проводимость молекул ДНК

Глава II. Применение методов СЗМ к исследованию молекул ДНК

2.1. Принцип работы АСМ и различные режимы

2.2. Выбор подложки, ее модификация

2.3. Выбор кантилеверов
2.4. Выбор, подготовка, синтез ДНК
2.5. Методика приготовления образцов для изучения иммобилизации
2.6. Методика приготовления образцов для изучения проводимости ДНК
Глава III. АСМ-визуализация ДНК различного происхождения.
3.1. Исследование нативных ДНК
3.2. Исследование влияния буферного компонента раствора на характер иммобилизации олигонуклеотидов
Выводы по главе III
Глава IV. Исследование одиночных олигонуклеотидов и агрегатов на их основе
4.1. Воспроизводимость результатов, статистический анализ одиночных олигонуклеотидов
4.2. Изучение агрегатов и построение градуировочной кривой
4.3. Исследование зависимости плотности иммобилизованных одиночных олигонуклеотидов от концентрации компонентов раствора-образца
4.4. Измерение электрической проводимости олигонуклеотидов
Выводы по главе IV
Заключение
Список литературы
ПРИЛОЖЕНИЕ А

Список сокращений
СЗМ — сканирующая зондовая микроскопия
ACM — атомно-силовая микроскопия
СТМ - сканирующая туннельная микроскопия
СТС- сканирующая туннельная спектроскопия
ОДН - олигонуклеотид
нт - (количество) нуклеотидов
п.о. - пар оснований
дцДНК - двуцепочечная дезоксирибонуклеиновая кислота оцДНК - одноцепочечная дезоксирибонуклеиновая кислота ВОПГ - высокоориентированный пиролитический графит А,-ДНК - молекул ДНК бактериофага X АПТЕС (APTES) - 3-аминопропилтриэтоксисилан ГЕПЕС (HEPES) - 4-(2-гидроксиэтил)-1-пиперазинэтансульфоновая кислота
ВУП - вакуумный универсальный пост

50 нм друг напротив друга. Вся работа проводилась в воздушной среде, при комнатной температуре.

Je '
thiol modified DNA + Au nanoparticle

electrode

electrode
Au nanoelectrodes
Au nanoparticle + ——
thiol modified DNA 20€ nm
Рис. 1.15 Схема эксперимента из работы [73].
Молекула ДНК была связана с золотым электродом сильной химической связью.