Кинетика и механизмы формирования биополикомплексов в белково-полимерных дисперсиях

• Автор: Плотникова, Полина Владимировна
• Шифр специальности: 03.01.02
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2010
• Место защиты: Санкт-Петербург
• Количество страниц: 133 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР

1.1. Особенности процесса взаимодействия биологически

активных веществ с полимерами

1.1.1. Кинетика процесса флокуляции

1.1.2. Теоретические модели механизма процесса флокуляции

1.2. Основные типы полимеров, используемые для регулирования седиментационной устойчивости биологических жидкостей

1.2.1. Катионные полимеры

1.2.2. Неионогенные полимеры

1.2.3. Анионные полимеры
1.3. Сывороточный альбумин
1.4. Антрациклиновые антибиотики
1.5. Плазма крови
ГЛАВА 2. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
2.1. Материалы
2.1.1. Синтетические полимеры 5
2.1.2. Бычий сывороточный альбумин
2.1.3. Физико-химические свойства рубомицина
2.2. Методы
2.2.1. Исследование межмолекулярного взаимодействия полимеров с
БСА (подготовка образцов)
2.2.2. Оптические методы
2.2.2.1. Спектротурбидиметрия
2.2.2.2. Нефелометрия

2.2.2.3. Методы представления результатов
2.2.2.4. Сравнительный анализ использования комплексной методики и традиционных методов оптической спектроскопии
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ
3.1. Влияние молекулярной массы катионных полиэлектролитов на кинетику образования поликомплексов с БСА
3.2. Влияние структурной организации катионных полиэлектролитов на кинетику образования макромолекулярных поликомплексов с БСА
3.3. Влияние pH среды на механизмы и кинетику межмолекулярного взаимодействия БСА с синтетическими полиэлектролитами
3.3.1. Кинетика межмолекулярного взаимодействия БСА с катионными полиэлектролитами при pH = 6,
3.3.2. Кинетика межмолекулярного взаимодействия БСА с катионными полиэлектролитами в присутствии 50% изопропанола при нейтральных значениях pH
3.3.3. Кинетика межмолекулярного взаимодействия БСА с катионными полиэлектролитами при pH = 3,56 ,
3.3.4. Кинетика межмолекулярного взаимодействия БСА с катионными полиэлектролитами при pH = 9,
3.4. Влияние содержания и типа ионогенных групп полимеров на механизмы взаимодействия с БСА и кинетику формирования комплексов
3.4.1. Механизмы и кинетика взаимодействия БСА с полиакриламидом
3.4.1.1. Кинетика межмолекулярного взаимодействия БСА с АА при pH = 6,
3.4.1.2. Кинетика межмолекулярного взаимодействия БСА с АА при pH = 3,

3.4.1.3. Кинетика межмолекулярного взаимодействия БСА с АА при pH = 9,
3.4.2. Механизмы и кинетика взаимодействия БСА с сополимером ААСМС
3.4.3. Механизмы и кинетика взаимодействия БСА с анионным полиэлектролитом
3.5. Кинетика взаимодействия катионных полиэлектролитов с белками в многокомпонентной модельной среде плазме крови
3.6. Кинетика взаимодействия катионных полиэлектролитов с примесными белками в культуральной жидкости противоопухолевого антрациклинового антибтотика рубомицина
ВЫВОДЫ

БИБЛИОГРАФИЧЕСКИЙ СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

остатков цистина и 1 остаток цистеина. При взаимодействии последний реагирует с цистеиновым остатком другой молекулы альбумина с образованием межмолекулярной Б-Б-связи и возникает димер [76].
Результаты кристаллографического анализа с высоким пространственным разрешением (2,5 А) показали, что молекула СА имеет компактную форму (близкую к равнобедренному треугольнику со стороной 80 А и высотой 30 А) [78].
17 дисульфидных связей, которые участвуют в формировании пространственной структуры СА, могут изменять позиции в молекуле. Изменение позиций —Б-Б- мостиков приводит к появлению изомеров с более кислыми и более щелочными значениями изоэлектрической точки [79].
При нейтральных pH суммарные заряды доменов альбумина различаются. Первый и второй домены имеют отрицательный заряд — (-9) и (-8), соответственно, в то время как третий домен заряжен слабо положительно (+2) [80]. Суммарные заряды при pH 7,4 распределяются между двумя половинами молекулы следующим образом: для домена I + субдомен II А (-14) и для домена III + субдомен П А (-1). Рассчитано, что вся молекула при нейтральном значении pH заряжена отрицательно и имеет суммарный заряд (-15). Однако реальный заряд домена может измениться при связывании заряженных органических (-жирных кислот) или неорганических (фосфат) лигандов [81].
Конформация молекулы альбумина в растворе нестатична и даже охарактеризована как гибкая, быстро изменяющая форму [82]. По данным ультразвуковой спектроскопии и тушению флуоресценции изменение конформации СА происходит за микро- и даже наносекунды [83, 84]. Это свидетельствует о том, что состоящая из связанных петель структура белка позволяет молекуле претерпевать быстрое расширение, сжатие и изгибы. Хотя молекулу СА в растворе можно рассматривать как единую структуру, вероятно, она ведет себя как набор подвижных упругих частей, часто изменяющих свою конформацию посредством открытия и закрытия основных «складок» [81]. Под