Этногеномика населения Северной Евразии

• Автор: Степанов, Вадим Анатольевич
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2001
• Место защиты: Томск
• Количество страниц: 335 с. : ил

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИСТОРИЯ ПОПУЛЯЦИЙ ЧЕЛОВЕКА: СОВРЕМЕННЫЕ ПОДХОДЫ И ПРЕДСТАВЛЕНИЯ
1.1. Эволюция и систематика гоминид
1.2. Модели происхождения современного человека: моноцентризм
и полицентризм
1.3. Генетика происхождения современного человека
1.3.1. Генетические деревья и время коалесценции
1.3.2. Генетическое разнообразие внутри популяций
1.3.3. Межпопуляционное генетическое разнообразие
1.3.4. Генетическая демография древних популяций
1.3.5. ДНК неандертальца
1.4. Резюме
ГЛАВА 2. СИСТЕМЫ ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ ДЛЯ ЭВОЛЮЦИОННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ
2.1. Мобильный генетический элемент Alu в геноме человека
2.2. Микросателлитные локусы в геноме человека
2.3. Y-хромосома как инструмент эволюционной генетики человека 56 ГЛАВА 3. НАСЕЛЕНИЕ СИБИРИ И СРЕДНЕЙ АЗИИ. КРАТКАЯ ЭТНО-ИСТОРИЧЕСКЯ СПРАВКА
3.1. Народы Сибири
3.1.1. Этническая история населения Сибири
3.1.2. Антропологический состав населения Сибири
3.1.3. Этногенез алтайцев
3.1.4. Этногенез тувинцев
3.1.5. Этногенез бурят
3.1.6. Этногенез эвенков
3.1.7. Этногенез якутов
3.2. Народы Средней Азии

3.2.1. Этническая история населения Средней Азии
3.2.2. Антропологические характеристики населения Средней

3.2.3. Этногенез таджиков
3.2.4. Этногенез узбеков
3.2.5. Этногенез киргизов
3.2.6. Этногенез дунган
ГЛАВА 4. ХАРАКТЕРИСТИКА ИССЛЕДУЕМЫХ ПОПУЛЯЦИЙ И МЕТОДЫ АНАЛИЗА ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ
4.1. Объем и структура материала
4.2. Системы генетических маркеров
4.2.1. Генотипирование полиморфных Alu-инсерций
4.2.2. Г енотипирование аутосомных микросателлитов
4.2.3. Гаплотипирование У-хромосомы
4.3. Статистические методы
4.3.1. Анализ частот генов
4.3.2. Меры генетического разнообразия
4.3.3. Меры генетической дифференциации популяций
4.3.4. Анализ молекулярной дисперсии (AMOVA)
4.3.5. Оценки генетических расстояний
4.3.6. Филогенетический и факторный анализ
4.3.7. Анализ потока генов
4.3.8. Филогенетический анализ гаплотипов Y-хромосомы и
оценка времени генерации генетического разнообразия
4.3.9. Анализ корреляции матриц по Мантелю
4.3.10. Используемые компьютерные программы и базы данных 114 ГЛАВА 5. ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ НАСЕЛЕНИЯ СИБИРИ И СРЕДНЕЙ АЗИИ
ПО ПОЛИМОРФНЫМ ALU-ИНСЕРЦИЯМ
5.1. Генетическое разнообразие в популяциях

5.2. Генетическая дифференциация популяций
5.3. Генетические взаимоотношения между популяциями
5.4. Анализ потока генов
5.5. Резюме
ГЛАВА 6. ПОПУЛЯЦИОННАЯ ГЕНЕТИКА АУТОСОМНЫХ МИКРОСАТЕЛЛИТОВ У НАРОДОВ СИБИРИ И СРЕДНЕЙ АЗИИ
6.1. Генетическое разнообразие микросателлитных локусов в популяциях
6.2. Генетическая дифференциация популяций
6.3. Генетические взаимоотношения между популяциями
6.4 Анализ потока генов
6.5. Резюме
ГЛАВА 7. ЭВОЛЮЦИЯ И ПРОИСХОЖДЕНИЕ ЛИНИЙ У-ХРОМОСОМЫ В ПОПУЛЯЦИЯХ СИБИРИ И СРЕДНЕЙ АЗИИ
7.1. Распределение «диаллельных» гаплогрупп
7.2. Разнообразие микросателлитных гаплотипов в популяциях
7.3. Генетическая дифференциация популяций Сибири и Средней
Азии по гаплотипам У-хромосомы
7.4. Филогенетический анализ линий У-хромосомы (эволюция и
возраст гаплогрупп)
7.5. Резюме 213 ГЛАВА 8. ФИЛОГЕОГРАФИЯ ЛИНИЙ У-ХРОМОСОМЫ В
СТАРОМ СВЕТЕ
8.1. Гаплогруппа 7
8.2. Гаплогруппа 2/2’
8.3. Гаплогруппы 21 и 4
8.4. Гаплогруппа 26
8.5. Гаплогруппа 1
8.6. Гаплогруппа 3
8.7. Г аплогруппа 9

расстояния друг с другом, чем по отношению к Африке. Такой характер генетической дифференциации населения мира выявлен при анализе краниометрии (Lynch et al., 1989; Relethford and Harpending, 1994), классического белкового полимофизма (Nei, 1978; Cavalli-Sforza, Menozzi, Piazza, 1994), ПДРФ-маркеров (Bowcock et al., 1991; Mountain and Cavalli-Sforza, 1994; Jorde et al., 1995), микросателлитного полиморфизма (Bowcock et al., 1994; Deka et al., 1995a; Jorde et al., 1995; Tishkoff et al., 1996), Alu-повторов (Batzer et al., 1994; Stoneking et al., 1997), мтДНК (Vigilant et al., 1991; Jorde et al., 1995) и Y-хромосомы (Underhill et al., 1997).
Картина генетической дифференциации населения регионов мира хорошо совместима с африканским происхождением современного человека, поскольку эта гипотеза предсказывает разделение африканцы/не-африканцы в качестве первого ветвления генетического древа человечества. В этом случае популяции Азии и Европы должны быть ближе друг к другу, чем к африканцам, поскольку имеют менее древнего общего предка. Аргумент против "африканской" гипотезы заключается в том, что генетические дистанции между популяциями, представленные в виде генетического древа, не означают, что сама модель древа является корректной. Тот же характер дифференциации генофондов может отражать не последовательное происхождение популяций, а характер и интенсивность потока генов между ними (Relethford and Harpending, 1994; Sherry and Batzer, 1997).
Анализ генетической дифференциации популяций позволяет извлечь и еще один важный показатель, а именно, оценить степень дифференциации генного пула современного человека (таблица 3). Большинство генетических систем демонстрируют, что на долю межпопуляционного разнообразия приходится 10-15% генетической вариабельности, а большая ее часть (85-90%) сосредоточена внутри популяций. По сравнению с другими видами животных степень генетических различий между популяциями человека очень низка, что может отражать относительно недавнее происхождение биологического вида, что соответствует гипотезе африканского корня, и/или интенсивный обмен