Гордеин-кодирующие локусы как генетические маркеры в популяционных, филогенетических и прикладных исследованиях ячменя

• Автор: Поморцев, Андрей Анатольевич
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 372 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1Л. Происхождение культурного ячменя
Hordeum sativum Jessen
1.1.1. Дикіш предок я чменя культурного
1.1.2. Географические центры разнообразия (происхождения) ячменя культурного
1.2. Гордеин-кодирующие локусы как генетические
маркеры у ячменя
1.2.1. Наследование и генетический контроль электрофоретических компонентов гордеинов
1.2.2. Полиморфизм гордеинов и способы регистрации электрофореграмм
1.2.3. Молекулярная организация гордеинов и механизмы возникновения их полиморфизма
1.3. Использование гордеин-кодирующих локусов как генетических маркеров у ячменя
Заключение
ГЛАВА II. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
2.1. Материал
2.2. Методы исследований
2.2.1. Электрофоретический анализ гордеинов
2.2.2. Статистические методы обработки результатов 99 ГЛАВА III. ПОЛИМОРФИЗМ ГОРДЕИН-КОДИРУЮЩИХ
ЛОКУСОВ
3.1. Наследование и генетический контроль
электрофоретических компонентов гордеина
3.2. Полиморфизм гордеинов, контролируемых локусами
Hrd A, HrdВ и HrdF у ячменя

3.2.1. Полиморфизм горд енна, контролируемого аллелями локуса Hrd А
Полиморфизм гордеинов, контролируемых локусами Hrd В и Hrd F
3.2.2. Полиморфизм гордеинов, контролируемых локусами Hrd А и Hrd В у H. spontaneum C. Koch.
Заключение
ГЛАВА IV. ГОРДЕИН-КОДИРУЮЩИЕ ЛОКУСЫ КАК
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ В ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЯХ ЯЧМЕНЯ
4.1. Полиморфизм локусов Hrd А, Hrd В и Hrd F у ячменя из Эфиопии
4.2. Полиморфизм гордеин-кодирующих локусов у ячменя из стран Северной Африки
4.3. Полиморфизм гордеин-кодирующих локусов у ячменя из стран Ближнего Востока
4.4. Оценка генетического сходства ячменей Северной Африки, Ближнего Востока, Южной Аравии и Эфиопии на основе полиморфизма гордеин-кодирующих локусов
4.5. Оценка генетического сходства ячменей из стран, входящих в центры разнообразия ячменя и граничащих с ними на, основе полиморфизма гордеин-кодирующих локусов Заключение
ГЛАВА V. ФАКТОРЫ, ВЛИЯЮЩИЕ НА ГЕОГРАФИЧЕСКОЕ РАСПРОСТРАНЕНИЕ АЛЛЕЛЕЙ ГОРДЕИН-КОДИРУЮЩИХ ЛОКУСОВ
5.1. Полиморфизм гордеин-кодирующих локусов у сортов ярового ячменя, районированных в СССР
5.2. Закономерности распространения аллельных вариантов трех гордеин-кодирующих локусов у ярового ячменя в СССР
5.3. Полиморфизм и закономерности распространения аллелей гордеин-кодирующих локусов у сортов ярового
ячменя, допущенных к использованию в Российской Федерации
5.4. Сопоставление результатов, полученных при анализе распределения аллелей локусов HrdA, В, F у сортов ячменя
на территориях СССР и Российской Федерации
5.5. Закономерности распределения аллелей гордеин-кодирующих локусов при выращивании популяций ячменя
в горных условиях на различных высотах над уровнем моря
5.5.1. Полиморфизм и структура популяций культурного
ячменя по гордеин-кодирующим локусам на Западном Памире
5.5.2. Динамика структуры популяции сорта Дэюау Кабутак
при репродуцировании на различных высотах над уровнем моря
5.6. Изучение естественного отбора в искусственных гибридных популяциях ярового ячменя
Заключение
ГЛАВА VI. АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ ГОРДЕИН-КОДИРУЮЩИХ ЛОКУСОВ У ЯРОВОГО ЯЧМЕНЯ РОССИИ ЗА СТОЛЕТНИЙ ПЕРИОД НАУЧНОЙ СЕЛЕКЦИИ
6.1. Краткая история возделывания ячменя в России
6.2. Анализ внутрисортового разнообразия ярового ячменя по гордеин-кодирующим локусам
6.2.1. Анализ внутрисортовой гетерогенности ярового ячменя
на его ареале в Российской Федерации
6.2.2. Аллельное разнообразие сортов ярового ячменя, районированных в Российской Федерации
6.2.3. Анализ эффективного числа аллелей у сортов ярового ячменя в северных и южных регионах Российской Федерации
6.2.4. Частоты адаптивно значимых аллелей локусов Hrd А,
Hrd В и Hrd Fy ячменя в Российской Федерации в период
хпДНК в семи локусах: їіУсрряЬК, ЪусрряЬА, ИусргроА, Иусрірзі 2, ИусрітБІ, Ііуср1т82 и ЬмсрЬ-пЬР. Авторами была проанализирована хпДНК у 31 образца, представляющих 24 вида дикого ячменя, у 51 образца
Н. вроШапеит из Передней Азии, у 125 образцов местных сортов культурного ячменя и у 101 современного сорта ярового ячменя из Европы. У исследованных этими авторами 24 диких видов ячменей, все семь локусов оказались полиморфными и имели от двух до семи аллелей. Из 31 образца этих видов, 21 оказался генетически уникальным, и всего было обнаружено 25 гаплотипов. У Н. яроМапеит полиморфными являлись 5 локусов, имевшие по 2 - 3 аллеля, и было обнаружено 11 гаплотипов. У исследованных местных сортов культурного ячменя только для одного локуса куср1гпЬР были обнаружены два аллеля и, соответственно, у этой группы культурных ячменей присутствовали два гаплотипа. Причем оба были обнаружены и у Н. яропіапеит. Полиморфизм по указанным локусам у современных европейских сортов ячменя вообще не был выявлен. Единственный обнаруженный в этих сортах гаплотип был идентичен одному из гаплотипов, найденному в местных ячменях. Такую картину некоторые авторы рассматривают как результат одомашнивания дикого предка, когда генетическое разнообразие резко снижается и в процессе доместикации, и при дальнейшей истощающей селекции, жестко направленной на отбор хозяйственно-полезных признаков (Тапкєіеу, МсСоисй, 1997). Эти данные позволили 1. Ргочап с сотрудниками (1999) проанализировать филогенетические связи между исследованными видами (рис. 3). Как видно из рисунка, в полученном авторами филогенетическом древе четко выделяются два кластера: в один из них входят только исследованные образцы Н. яроМапеит и культурных ячменей, в другой -все остальные 24 вида диких ячменей. Такая дифференциация между дикими видами НогАеит, с одной стороны, и Н. spon.tan.eum и культурными ячменями - с другой, полностью согласуется с результатами, полученными при изучении филогенетических отношений этого рода с использованием