Анализ особенностей генома эпидермических штаммов вируса гриппа А человека

• Автор: Городкова, Наталья Валентиновна
• Шифр специальности: 03.00.06
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 1984
• Место защиты: Рига
• Количество страниц: 164 c. : ил

Обзор литературы
Глава I. Основные свойства вирусов гриппа
Глава 2. Антигенная изменчивость вирусов гриппа типа А.
2.1. Основные закономерности циркуляции эпидемических штаммов вируса гриппа
2.2. Теории происхождения пандемических штаммов вируса гриппа
Глава 3. Эволюция генов эпидемических штаммов вируса
гриппа
Собственные исследования
Глава 4. Материалы и методы
Глава 5. Анализ эпидемических штаммов вируса гриппа А
человека серотипа НЗН2, изолированных во время
эпидемии 1979/1980 года
Глава б. Анализ эпидемических штаммов вируса гриппа А
человека серо типа НВГ1, изолированных во время
эпидемий 1979/1980 и 1981/1982 годов
Глава 7. Сравнительный анализ генома эталонных эпидемических штаммов вируса гриппа А человека
Обсуждение результатов
Выводы
Список литературы

ВЗЕДЕНИЕ
Актуальность проблемы
Значительные успехи вирусологии в познании структуры, репродукции, генетики и иммунологии вируса гриппа не привели, однако, до сих пор к существенному прогрессу в борьбе с самим заболеванием. Гриппозные эпидемии ежегодно поражают десятки тысяч людей с развитием клинических признаков и тяжелых осложнений. Угроза новой пандемии гриппа, подобной пандемии 1918 года, продолжает существовать, к тому же и сейчас в индустриальных странах эпидемии гриппа занимают первое место среди причин смертности от инфекционных болезней /201, 218/. Урон, наносимый гриппом здоровью людей и экономике государств, обязывает проводить постоянное изучение проблемы гриппа во всех ее аспектах, и здесь важнейшим направлением является изучение и постоянный контроль изменчивости вирусов гриппа, поскольку этот процесс имеет прямое отношение к возникновению пандемических и эпидемических штаммов.
Уникальная способность штаммов вируса гриппа к изменению антигенных и биологических свойств существенно затрудняет использование противогриппозных вакцин. В первую очередь вышесказанное относится к вирусам гриппа А, для которых установлено два типа антигенной изменчивости: дрейф и шифт. Понятия дрейфа и шифта сложились на основании изучения антигенных свойств выделяемых штаммов вируса гриппа и включают в себя сведения об
антигенной изменчивости двух поверхностных гликопротеидов ви-риона - гемагглютинина и нейраминидазы. В последние годы существенный прогресс в изучении изменчивости вирусов гриппа был связан с расширением арсенала методов молекулярной биологии,

которые позволили характеризовать вирус гриппа по всем его структурным компонентам. Однако, до последнего времени основное внимание уделялось изучению изменчивости наружных гликопротеидов вируса гриппа. Имелись лишь единичные работы о том, что изменчивость может затрагивать не только гены, кодирующие гемаг-глютинин и нейраминидазу, но и внутренние негликозилированные белки /201, 218, 311/. В то же время широкое изучение изменчивости всех генов вируса гриппа в процессе циркуляции вируса в популяции людей, включая период эпидемии, крайне важно для понимания эволюции этого вируса, механизмов возникновения эпидемических штаммов и роли в этих процессах генов, кодирующих негликозилированные белки.
При изучении эволюции генов вируса гриппа и закономерностей циркуляции эпидемических штаммов важен выбор метода исследований. Широко применяемый метод картирования олигонуклеотидов целого генома и отдельных его сегментов /72, 106, 121, 204,
207, 311/ позволяет сравнивать близкородственные штаммы вируса гриппа лишь по крупным олигонуклеотидам, которые составляют не более 1/3 вирусного генома. Метод гибридизации вирусных РНК, предложенный Scholtissek и др. /104/, достаточно трудоемок и более пригоден для анализа дальнородственных вирусов гриппа. Сравнение последовательностей нуклеотидных оснований генов вируса гриппа является очень трудоемким процессом, к тому же возможно накопление артефактов при клонировании ДНК вируса в плазмидах. В настоящей работе мы проводили изучение гомологии отдельных генов штаммов вируса гриппа по методу, предложенному Itо и Xoklik /156/ и адаптированному для вирусов гриппа Нау и др., /276/. Этот высокочувствительный метод позволяет одновременно анализировать большое количество штаммов вируса гриппа сразу по всем генам.

Таблица
Описок изолятов эпидемических штаммов вируса гриппа человека типа А использованных в работе
серо-

штаммы условное обо- значение месяц и год выделения
А/Moсква/136 6/79 1366/79 10.1979
А/Москва/2175/79 2175/79 12.1979
А/Москва/45/81 45/81 12.1981
А/Москва/46/81 46/81 12.1981
А/Moсква/9058/81 9058/81 12.1981
А/Moсква/9085/82 9085/82 01.1982
АД1осква/1662/79 1662/79 12.1979
А./Мо скв а/2146/80 2146/80 01.1980
А/Moсква/28/80 28/80 02.1980
А/Москва/29/80 29/80 02.1980
АДЬ сква/1192/79 1192/79 12.1979
А/Mo сква/1849/79 1849/79 12.1979
АДЛосква/1472/79 1472/79 12.1979
А/Рига/1/79 Р/1/79 12.1979
А/Рига/2/79 Р/2/79 12.1979
А/Рига/3/79 Р/3/79 12.1979
А/Рига/4/79 Р/4/79 12.1979
А/Рига/5/79 Р/5/79 12.1979
А/Рига/6/80 Р/6/80 01.1980
А/Рига/7/80 Р/7/80 01.1980
А/Грейфсвальд/8Д Ю Г/8/80 03.1980
А/Грейфсвальд/9/80 Г/9/80 03.1980
А/Грейфсвальд/10/80 Г/10/80 02.1980
А/Берлин/5/80 Б/5/80 02.1980
А/Потсдам/9/80 П/9/80 09.1980
А/Дрезден/1/80 Д/1/80 01.1980
примечания
выделен от больного в одном районе Москвы со штаммами группы 1662/79-29/80
выделен от больного
выделен от больного
выделен от больного
выделен от больного
выделен от больного
выделены от больных, в одном районе Москвы в начале, в разгаре и в конце эпидемии гриппа
выделены от больных во время вспышки грин па в одном коллективе
выделен от больного
выделены от больных во время эпидемии гриппа в

выделены от больных во время эпидемии гриппа в ГДР