Поиск, идентификация и изучение экспрессии генов-кандидатов псориатического процесса

• Автор: Брускин, Сергей Александрович
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 135 с. : ил.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
ГЛАВА 1. ПСОРИАЗ: ХАРАКТЕРИСТИКА ЗАБОЛЕВАНИЯ И ГЕНЕТИКА ПАТОЛОГИИ
1.1. Клиническая характеристика заболевания
1.2. Эпидемиология псориаза
1.3. Генетика псориаза
1.4. Наследование псориаза
1.5. Рабочая модель иммунопатогенеза псориаза
1.6. Триггеры внешней среды
Глава 2. ]-АЦЕТИЛТРАНСФЕРАЗЫ ЧЕЛОВЕКА
2.1. Гены, кодирующие 1М-ацетилтрансферазы человека
2.2. Фенотип ацетилирования
■ 2.3. Полиморфизм гена ЫАТ2
2.4. Ассоциация фенотипа ацетилирования с различными многофакторными заболеваниями
Глава 3. ТРАНСКРИПЦИОННЫЙ ФАКТОР АР
3.1. Характеристика транскрипционного фактора АР
3.2. Кожа как система для изучения регуляции и функций АР-1
3.3. Регуляция АР

Глава 4. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
4.1. Определение фенотипа ацетилирования
4.2. Выделение ДНК из крови
4.3. Разработка микрочипа быстрого скрининга генотипа и установления фенотипа ацетилирования у больных псориазом
4.4. Определение генотипа ацетилирования на микрочипах
4.5. Мультиплексная полимеразная цепная реакция
4.6. Гибридизация меченого ПЦР-продукта на микрочипе
4.7. Забор, хранение и гомогенизация образцов кожи
4.8. Выделение РНК кисло-фенольным методом
4.9. Выделение РНК на колонках (Да§еп
4.10. Обратная транскрипция
4.11. Полуколичественная полимеразная цепная реакция
4.12. Полимеразная цепная реакция в реальном времени
4.13. Определение активности каспазы-3 в образцах кожи колориметрическим методом
4.14. Определение содержания белка р53 в образцах кожи методом Вестерн-блот гибридизации
4.15. Экстракты белков для изофокусировки и электрофореза
4.16. Двумерный электрофорез
4.17. Анализ изображений
4.19. Идентификация белков
4.20. Процедуры молекулярного клонирования
4.21. Биоинформационный анализ и базы данных
4.22. Статистическая обработка данных

ГЛАВА 5. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
5.1. Сравнительное изучение фенотипа ацетилирования и полиморфизма гена NAT2
5.2. Полиморфизм гена NAT2 и его ассоциация с псориазом
5.3. Изменение некоторых апоптических медиаторов и эффекторов в коже
у больных псориазом
5.4. Компоненты транскрипционного фактора ЛР-1 как гены - кандидаты при псориазе
5.5. Анализ уровней экспрессии генов, кодирующих компоненты транскрипционного фактора АР
5.6. Идентификация новых белков, участвующих в развитии очага поражения у больных псориазом
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

каждый АР-1 фактор представляет гомо- и гетеродимерные члены Jun, Fos и ATF белковых подсемейств. Образование каждого димера четко зависит от его относительной способности к димеризации и относительной концентрации, в которой присутствуют Jun, Fos и ATF белки в клетке в данное конкретное время.
Дополнительное разнообразие вызывается также различными посттрансляционными модификациями, которые могут быть вызваны сигнальными грансдукционными путями в отношении отдельных субъединиц транскрипционных факторов. Результаты экспериментов с культурой клеток и с «нокаутированными» мышами показали, что определенные представители МАР-киназного семейства (Erks, JNK/SAPKs, р38) селективно направлены на АР-1 белки, в зависимости от воздействия различных клеточных факторов. Следует также добавить, что АР-1 функции контролируются позитивными и негативными взаимодействиями с другими клеточными белками, такими как NF-kB или глюкокортикоидный рецептор. Все эти регуляторные механизмы определяют активность транскрипционного комплекса АР-1 в клетке [Angel, Karin, 1991; Karin et al, 1997; Wagner, 2001].