Структура ионофорных антибиотиков энниатинового и валиномицинового рядов

• Автор: Тищенко, Галина Николаевна
• Шифр специальности: 01.04.18
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 1984
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 461 c. : ил

Глава I. Строение линейных и циклических олигопептидов

в кристаллах

1.1 Введение

1.2. Классификация пептидов

1.3 Номенклатура конформационного состояния

пептидов

1.4 Строение линейных пептидов

1.4.1 Конформация основной цепи

1.4.2 Строение концевых групп незащищенных пептидов

1.5 Циклические пептиды

1.5.1 Циклические дипептиды и дидепсипептиды

1.5.2 Циклические трипептиды
1.5.3 Циклические тетрапептиды
1.5.4 Циклические пентапептиды
1.5.5 Циклические гексапептиды
1.5.6 Циклические гептапептиды
1.5.7 Циклические октапептиды
1.5.8 Циклодека- и ундекапептиды
1.5.9 Циклододекапептиды
1.6 Внутримолекулярные водородные связи в пептидах
1.7 Строение пептидной группы
1.8 Боковые цепи
1.9 Строение комплексов пептидов с металлами.
Упаковка молекул
Глава 2. Строение циклических дипептидов и дидепсипептидов 109 2.1 Введение
2.2. Строение циклического дидепсипептида Т) -метил-валил- ]] - оА -оксиизовалерила, цикло
[-Л-МеМа^-Л-Н^-]

2.3. Строение циклического дидепсипептида L -валилL - с/ - оксиизовалерила, цикл о -
L-Hyi
2.4. Строение циклического дипептида L -валилсарко-зила, цикло [-L-Va£-Scrr-] 13°
2.5. Строение цис-ашдной и цис-сложноэфирной групп в валил-содержащих циклических дипептидах и дипепсипептидах
2.6. Сравнительная характеристика конформаций шестичленных валил-содержащих циклов
Глава 3. Строение циклических стереоизомерных тетрадепсипептидов цикло [-(Met/aL-Нуі)г~]
3.1. Введение
3.2. Строение DHL - стереоизомера теградепси-пептида цикло [-(MeVai-H^i)z~l
3.3. Строение DLL]) - стереоизомера тетрадепсипептида цикло [-(Mel/аі-И^і)2']
3.4. Строение "тетраэнниатина" - LJJLD - стереоизомера тетрадепсипептида цикло[~('MeVctt-H^)z]
3.5. Строение LDDD - стереоизомера тетрадепсипепгида цикло[-(Mes/aL-Н^)г~1
3.6. Строение LLBU - стереоизомера тетрадепсипептида цикло [- (MeVaL- Иуі )2 ~]
3.7. О строении ПЛІ)В и LLLL - стереоизомеров тетрадепсипептида цикло [-(MeVaС- Ну])г~]
3.8. Сравнение конформаций молекул ряда стереоизомеров тетрадепсипептида щ.шо[-(Ме/аі-Ну^-)г'] 4
3.9. Геометрические характеристики N -метиламидной
и сложноэфирной групп в тетрациклах

Глава 4. Строение циклических гексадепсипептидов
4.1. Введение
4.2. Строение циклического гексадепсипептида цикло
-ионофорного антибиотика энниатина В
4.3. Строение Net, Mi - комплекса энниатина В -w&jLo[-[L-MeVai-])~Hui)3-J-MaMi(N03)3 ■ /,SCH3OH-3HzO r
4.4. Строение циклического гексадепсипептида цикло
[-L - Ме Ш-Л-Hyi-L -Не I/а C-L-Hyi-l-MeVa t-L -Hyi - J, LJJLLJDL -аналога энниатина В
4.5. Строение Rё+- комплекса LJDLLIL -аналога энниатина В - щкло [-L-MeVat-JJ-Ну* - L'HteVai'
L-Hyi-D-MeVaL-L-Byi-]‘ R&NC&
4.6. Сравнение конформационных состояний остатков
М -метилвалина ( M-MeVcrt ) и сА -окси-изовалериановой кислоты ( Hui ) в изученных гексадепсипептидных циклах
4.7. Строение А/ -метиламидной и сложноэфирной групп
в изученных гексадепсипептидных циклах
Глава 5. Строение циклических депсипепгидов с большими
размерами циклов
5.1. Введение
5.2. Строение окта-мезо- Ну-с - валиномицина
цикло t-(S)-Va€-L-Hyi- L-Va€-D'Hyi)z~]
5.3. Строение [М^Й-Са2'6] октавалиномидана
цикло [- (Л- lal-L-Meft&t~L-Vat-I}~Hyi)z~]
5.4. Строение [МгйВи2] валиномицина
цикло [~1 - У а t-L -MtfllcL-L *1tat-D-Иу* -(D-Vai-L'Lac-L-Vae-D-Hyi);]
5.5. Сравнение конформаций структурно изученных соединений октавалиномицинового и валиномицинового рядов. О механизме взаимодействия молекулы вали-номивдна с ионом металла

1.5. Циклические пептиды
В 1938 г. была определена структура первого циклического пептида - дикетопиперазина, с минимальным размером цикла [1]
Это структура впоследствии была уточнена на основе рентгенографического [2] и электронографического [3,4] экспериментов. Следующая публикация - результат расшифровки структуры циклогекса-глицила [14] , появилась лишь в 1963 г. Кстати, это была одна из первых расшифровок с использованием прямого метода. К настоящему моменту около 150 циклических пептидов изучены методом рентгеноструктурного анализа, причем большинство структурных определений завершено после 1969 г.* В табл. 9 приведены все циклические пептиды и депсидедтиды, как синтетические, так и природные, изученные методом рентгеноструктурного анализа. Соединения расположены в порядке увеличения размера цикла. Та же последовательность сохранена и при описании кристаллических структур. Как и в случае линейных пептидов, здесь рассматриваются главным образом конформации молекул циклических пептидов в кристаллах.
1.5.1. Циклические дипептиды и дидепсипептиды
Возросший в последние годы интерес к этим соединениям объясняется прежде всего тем, что они представляют собой удобные модели для изучения конформаций больших пептидов и белков, а некоторые из них являются биологически активными соединениями. Интенсивно изучается конформация этих соединений в растворах и кристаллах для того, чтобы связать структуру и функцию для активных соединений и найти закономерности формирования пространственной структуры молекул.
К настоящему времени определены структуры свыше 40 циклических дипептидов и дидепсипептидов, а также пяти природных био-логически-активных соединений, содержащих в качестве части моле35 До 1969 г. появилась лишь одна работа по строению феррихрома А в 1966 г. [15]