Диссертация на тему "Молекулярно-цитогенетический анализ путей и механизмов кариотипической эволюции саранчовых подсемейства Gomphocerinae (Orthoptera, Acrididae)", скачать бесплатно автореферат по специальности 03.02.07

Оглавление
Оглавление
Введение

I лава 1. Обзор литературы

1. Подходы и методы цитогенетического анализа.

1.1 Начальный этап изучения хромосомных наборов.

1.2 Дифференциальное окрашивание хромосом.

1.2.1 Сдиффсренциальное окрашивание и конститутивный гетерохроматин

1.2.2 Особенности Сдифференциального окрашиваниия хромосом саранчовых

1.2.3 Распределение стандартных Спозигивных блоков в хромосомах саранчовых подсемейства ОотрЬосеппае

1.2.4 кшивни активных ядрышковых организаторов.

1.3 Методы молекулярной цитогенетики
1.3.1 Организация и эволюция рибосомных генов.
1.3.2 Мобильные элементы в кластерах рибосомных генов.
1.3.3 Локализация кластеров рДПК у саранчовых.
1.3.4 Организация и роль теломерных повторов
1.3.5 Распределение теломерных повторов у саранчовых
1.3.6 Организация центромерных и прицентромерных районов хромосом
1.3.7 Прицентромерные районы саранчовых.
1.4 Особенности организации генома саранчовых.
1.4.1 Вхромосомы саранчовых
1.5 Эволюционные изменения хромосомных наборов
1.5.1 Хромосомные перестройки.
1.5.2 Роль хромосомных перестроек в кариотипической эволюции
Глава 2. Материал и методы исследования.
2.1 Список реактивов
2.2. Материал.
2.3. Получение яйцекладок саранчовых.
2.4. Приготовление препаратов митотических хромосом из нейробластов эмбрионов
2.5. Приготовление препаратов мейотических хромосом
2.6. Дифференциальное окрашивание районов конститутивного гетерохроматина
2.7. Выявление активных ядрышко образующих районов ЯОР.
2.8. Микродиссекция метафазных хромосом
2.9.Приготовление ДНКбиблиотек из диссектированного материала.
2 Мечение микродиссекционных ДНКбиблиотек.
2. Получение и мечение зондов рДНК.
2. Получение теломерного зонда.
2 Флуоресцентная гибридизация i i
2 Детекция на цитологических препаратах ДЦКзонда
2. Совместное выявление двух гаптенмеченых ДНКпроб на одном препарате
2. Микроскопический анализ.
Глава 3. Результаты
3.1. Локализация Спозитивных блоков у саранчовых подсемейства i пае.
3.2.Локализация активных ЯОР у i и iii
3.3. Локализация теломерных повторов и рибосомной ДНК на хромосомах видов подсемейства i.
3.4. Локализация последовательностей ДНК, гомологичных ДНК микродиссекционных ДНКбиблиотек.
3.4.1 Характеристика ДНКбиблиотек.
3.4.2 Локализация последовательностей, гомологичных последовательностям прицен громерного Спозитивного блока аутосомы . ii
3.4.3 Локализация последовательностей, гомологичных последовательностям прицентромерного Спозитивного блока X хромосомы . iii
3.4.4 Локализация последовательностей, гомологичных последовательностям
прицентромерного Спозитивного блока X хромосомы 5. 8са1апБ
Глава 4. Обсуждение
Список литературы

До сих пор стоит вопрос, является ли наблюдаемая стабильность кариотипов следствием малого количества изменений в геноме группы, либо же она является результатом ограниченности использованных методов. Развитие методов молекулярной цитогенетики позволило использовать районо и хромосомоспецифичные последовательности ДНК в качестве маркеров для решения задач, связанных с эволюционной трансформацией хромосомных наборов. Эти методы успешно применяются на позвоночных i, iv, , растениях . . . . . . v . Однако их применение ограничивалось лишь небольшим набором ДНКпроб и видов. Большинство видов подсемейства i остались за рамками этих исследований. Другой отличительной особенностью саранчовых является большой размер генома. Среди насекомых саранчовые обладают самыми большими геномами, размеры которых варьируются от до 0 миллионов пар нуклеотидов . Большинство работ по изучению организации геномов было выполнено на видах с геномами небольших например, двукрылые насекомые или средних размеров таких как млекопитающие, в то время как хромосомная организация крупных геномов остается слабоизученной. Одной из составных частей генома являются повторенные последовательности. Так как число генов остается примерно одинаковым для всех видов эукариот, то можно предположить, что у саранчовых доля повторенных последовательностей значительно больше, чем у млекопитающих. Как организованы эти повторенные последовательности, и как они располагаются в хромосомах саранчовых, остается не выясненным. Одним из типов повторенных последовательностей являются кластерированные повторы. Они образуют Спозитивные блоки и играют значительную роль в структурнофункциональной организации генома. Как было показано ранее i, . v . , , Бугров и др. Таким образом, изучение молекулярной композиции Спозитивных блоков у саранчовых подсемейства i будет значительным вкладом в понимание организации геномов саранчовых и позволит лучше понять общие принципы организации больших геномов. Цель настоящего исследования описать распределение повторенных последовательностей ДНК в хромосомах видов подсемейства ОотрЬосеппае и оценить их возможную роль в кариотипической эволюции саранчовых. Дать детальное описание кариотипов видов подсемейства ОотрЬосеппае, используя Сдифференциальное окрашивание митотических хромосомах эмбриональных клеток изучаемых видов. Провести сравнительный анализ локализации кластеров повторенных последовательностей, гомологичных рибосомной и геломерной ДИК в хромосомах ряда видов подсемейства ОотрЬосеппае. Спозитивных блоков в митотических хромосомах нейробластов видов саранчовых подсемейства ОотрЬосепш. ДНК, в прицентромерных Спозитивных блоках хромосом 5. Ыопб и А. Шпсыб. Полученные данные являются весомым вкладом в изучение кариотипического разнообразия в слабо изученной группе саранчовых, дают новую информацию об организации геномов саранчовых и могут быть использованы в учебном процессе. Спозитивные блоки хромосом саранчовых могут состоят из субблоков, отличающихся молекулярной композицией. В этих районах идут активные процессы молекулярной эволюции, которые приводят к значительным различиям молекулярного состава прицентромерных Спозитивных блоков хромосом близких видов саранчовых, а, в некоторых случаях, и прицентромерных Спозитивных блоков разных хромосом набора одного вида саранчовых. Для саранчовых подсемейства i не характерно наличие интерстициальных теломерных сайтов. Особенности локализации ряда кластеров рДНК позволяют использовать их в качестве маркеров гомеологичных хромосом у близких видов. Парацентрические инверсии могут играть значительную роль в кариотипической эволюции саранчовых. Международная научная студенческая конференция Студент и научнотехнический прогресс Новосибирск, , г. XII съезд Русского энтомологического общества. Краснодар, 9 сентября года. Отчтная конференция, посвященная памяти академика Ю. П. Алтухова. Москва, год. Ii .

Название работы	Автор	Дата защиты
Генетическая модификация штаммов Escherichia coli, направленная на получение продуцентов бутирата и бутанола	Серегина, Татьяна Александровна	2012
Биохимические и генетические особенности реализации патогенности госпитальными штаммами Staphylococcus epidermidis и Staphylococcus haemolyticus	Корниенко, Мария Андреевна	2016
Изучение генетической структуры народов Западного Кавказа по данным о полиморфизме Y-хромосомы, митохондриальной ДНК и Alu-инсерций	Литвинов, Сергей Сергеевич	2010

Электронная библиотека диссертаций

Молекулярно-цитогенетический анализ путей и механизмов кариотипической эволюции саранчовых подсемейства Gomphocerinae (Orthoptera, Acrididae)