Молекулярно-генетическое исследование аллергических заболеваний

• Автор: Карунас, Александра Станиславовна
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2012
• Место защиты: Уфа
• Количество страниц: 505 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1Л. Эпидемиология аллергических заболеваний
1.2. Этиология аллергических заболеваний
1.3. Патогенез аллергических заболеваний
1.3. Генетические факторы развития аллергических заболеваний
1.4. Исследования генов-кандидатов аллергических заболеваний
1.4.1. Гены цитокинов и их рецепторов
1.4.2. Ген профилаггрина
1.4.3. Ген дизинтегрина и металлопротеазы
1.4.4. Гены ферментов биотрансформации ксенобиотиков
1.5. Полногеномные анализы ассоциаций аллергических заболеваний
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Материал для исследования
2.2. Методы исследования
2.2.1. Выделение геномной ДНК
2.2.2. Полимеразная цепная реакция синтеза ДНК
2.2.3. Рестрикционный анализ
2.2.4. Электрофорез в полиакриламидном геле
2.2.5. Анализ полиморфных вариантов генов ферментов системы биотрансформации с помощью биочипа
2.2.6. Полногеномное генотипирование полиморфных локусов
2.2.7. Статистическая обработка полученных результатов
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Анализ полиморфных вариантов генов-кандидатов у больных
аллергическими заболеваниями и индивидов контрольной группы
3.1.1. Анализ ассоциации полиморфных вариантов генов цитокинов с развитием аллергических заболеваний

3.1.1.1.Анализ ассоциации полиморфного локуса гз2243250 гена 1Ь4 с развитием аллергических заболеваний
3.1.1.2. Анализ ассоциации полиморфного локуса гз20541 генаЛ/З с развитием аллергических заболеваний
3.1.1.3. Анализ ассоциации полиморфного локуса га1805010 гена 114РЛ с развитием аллергических заболеваний
3.1.1.4.Анализ ассоциации полиморфного локуса га/500572 гена 1Ы0 с развитием аллергических заболеваний
3.1.1.5. Анализ ассоциации полиморфного локуса га/500629 гена ТИРА с развитием аллергических заболеваний
3.1.1.6. Анализ ассоциации полиморфного локуса га 17809012 гена ССЫ1 с развитием аллергических заболеваний
3.1.2. Анализ ассоциации мутаций в гене Г1X4 с развитием аллергических заболеваний
3.1.3. Анализ ассоциации полиморфных вариантов гена АйАМЗЗ с развитием аллергических заболеваний
3.1.4. Анализ ассоциации полиморфных вариантов генов системы биотрансформации с аллергическими заболеваниями
3.1.4.1. Анализ ассоциации полиморфных вариантов гена СУР1А1 с развитием аллергических заболеваний
3.1.4.2. Анализ ассоциации полиморфных вариантов гена СУР2С9 с развитием аллергических заболеваний
3.1.4.3. Анализ ассоциации полиморфного локуса га4244255 гена СУР2С19 с развитием аллергических заболеваний
3.1.4.4. Анализ ассоциации полиморфного локуса га3592097 гена СУР206 с развитием аллергических заболеваний
3.1.4.5. Анализ ассоциации делеционного полиморфизма гена С5ГМ/ с развитием аллергических заболеваний
3.1.4.6. Анализ ассоциации делеционного полиморфизма гена <35777 с развитием аллергических заболеваний

3.1.4.7. Анализ ассоциации полиморфных вариантов генаЛЛ72 с развитием аллергических заболеваний
3.2. Полногеномный анализ ассоциации
3.2.1. Анализ ассоциации бронхиальной астмы с полиморфными локусами, локализованными в области 17ц
3.2.2. Репликация результатов анализа ассоциации бронхиальной астмы с полиморфными локусами гена СБОМВ, локализованного в области
17ц 12-21, в независимой выборке индивидов
3.2.3. Анализ ассоциации полиморфных локусов гена СБРМВ с развитием различных аллергических заболеваний
3.2.4. Анализ ассоциации бронхиальной астмы с полиморфными локусами, локализованными в области 9р
3.2.5. Анализ ассоциации бронхиальной астмы с полиморфными локусами, локализованными в области 7р12.
3.2.6. Полногеномный анализ ассоциации бронхиальной астмы в этнических группах русских, татар и башкир
3.2.6.1. Анализ ассоциации бронхиальной астмы с полиморфными локусами, локализованными в области 12ц 12, у индивидов русской этнической принадлежности
3.2.6.2. Анализ ассоциации бронхиальной астмы с полиморфными локусами, локализованными в области 15ц26.3, у индивидов татарской этнической принадлежности
3.2.6.3. Анализ ассоциации бронхиальной астмы с полиморфными локусами, локализованными в области 5цЗЗ, у индивидов башкирской этнической принадлежности
3.3. Исследование роли межгенных взаимодействий в формировании предрасположенности к аллергическим заболеваниям
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ

данным различных авторов, наследуемость при аллергических заболеваниях варьирует от 35% до 95% при БА, 33%-91% при АР и поллинозе, 71%-84% при АД, 35%-84% для уровня общего сывороточного IgE, 30%-66% для бронхиальной гиперреактивности и 24%-41% для количества эозинофилов в крови [Ober C., Yao Т., 2011].
С конца 80-х - начала 90-х годов началось активное изучение молекулярно-генетических основ аллергии с помощью анализа сцепления и исследования генов-кандидатов.
Анализ сцепления является классическим методом для идентификации хромосомных регионов, в которых расположены гены предрасположенности к заболеванию. В 1989 г. Cookson W. с соавт. установили, что атопия сцеплена с хромосомной областью 11 ql 3 [Cookson W. et al., 1989], в которой при последующем картировании был идентифицирован ген ß-цепи высоко аффинного рецептора иммуноглобулина Е [Sandford A.J. et al., 1993]. Сцепление уровня общего IgE с хромосомной областью 5q31-q33, в которой локализован целый ряд кандидатных генов для атопии (цитокинов (IL4, IL5, IL9, IL13, ß-цепь IL12), Б2-адренергического рецептора, кортикостероидного рецептора, гранулоцит-макрофаг-колониестимулирующего фактора), впервые было выявлено в популяции амишей [Marsh D.G., et al., 1994], а в дальнейшем подтверждено в других популяциях. На сегодняшний день проведено более 20 полногеномных анализов сцепления (genome-wide linkage analysis) для БА и атопии в различных популяциях [Ober C. et al., 2006, 2011; Scirica C.V. et al., 2007; Weiss S.T. et al., 2009; Holloway J.W., 2010; March M.E. et al., 2011]. Согласно выводам этих работ, высокую степень сцепления с БА и сопутствующими с ней признаками показали хромосомные области lqter, 2р16, 2ql4, 2q32-33, 5q31-33, 6р21-24, 7р14, llql2-13, 12ql4-24, 13ql4-22, 14q24, 16pl2, 20pl3. В них локализованы как известные гены-кандидаты, так и гены, идентифицированные с помощью позиционного клонирования: ген дизинтегрина и металлопротеазы 33 (ADAM33, 20р 13); ген дипептидил
пептидазы 10 (DPP10, 2ql4); ген хроматин-зависимого транскрипционного