Остаточное диполь - дипольное взаимодействие в ЯМР исследованиях пространственного строения олигопептидов

• Автор: Клочков, Антон Владимирович
• Шифр специальности: 01.04.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Казань
• Количество страниц: 129 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ
СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. СПЕКТРОСКОПИЯ ЯМР ВЫСОКОГО РАЗРЕШЕНИЯ В ИССЛЕДОВАНИЯХ СТРУКТУРЫ ОРГАНИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ
1.1 Введение
1.2 Физические основы ЯМР спектроскопии
1.3 Принципы двумерной спектроскопии ЯМР
1.4 Остаточное диполь-дипольное взаимодействие в определении пространственного строения органических соединений
ГЛАВА 2. ИССЛЕДОВАНИЕ СВОЙСТВ ЛИОТРОПНЫХ ЖИДКОКРИСТАЛЛИЧЕСКИХ СРЕД МЕТОДОМ ЯМР
2.1 Введение
2.1 Спектроскопии ЯМР ориентированных молекул как метод СТРУКТУРНОГО АНАЛИЗА
2.3 Типы жидкокристаллических сред, используемых в СПЕКТРОСКОПИИ ЯМР ДЛЯ СЛАБОГО ОРИЕНТИРОВАНИЯ МОЛЕКУЛ
2.4 КВАДРУПОЛЬНОЕ РАСЩЕПЛЕНИЕ 2Н ЯМР СИГНАЛА ДЕЙТЕРИРОВАННОЙ ВОДЫ (П20) КАК ТЕСТ СУЩЕСТВОВАНИЯ
2.5 Жидкокристаллические лиотропные системы на основе и-алкил-ПОЛИ(ЭТИЛЕН)ГЛИКОЛЕЙ (С8Е5 И С12Е5) И НОРМАЛЬНЫХ спиртов
2.6 Жидкокристаллическая лиотропная система на основе х-алкил-ПОЛИ(ЭТИЛЕН)ГЛИКОЛЯ (С12Е5) И ДИМЕТИЛСУЛЬФОКСИДА ((СГ>,)280)
2.7 Жидкокристаллические лиотропные системы на основе хлорид (или бромид) цетилпиридиния и нормального спирта (гексанол)
ГЛАВА 3. ПРОСТРАНСТВЕННОЕ СТРОЕНИЕ И ГЕОМЕТРИЧЕСКИЕ ПАРАМЕТРЫ НЕКОТОРЫХ МОДЕЛЬНЫХ НИЗКОМОЛЕКУЛЯРНЫХ ОРГАНИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ И ОЛИГОПЕПТИДОВ
3.1 Введение
3.2 Остаточное диполь-дипольное взаимодействие между ядрами 13С и 'н в бензойной кислоте
3.3 Пространственное строение изомеров тиакал'икс[4]арена
3.4 Остаточное диполь-дипольное взаимодействие и пространственное строение олигопептидов
3.4.1 Дипептид 01и-Тгр

3.4.2 Триглицин 01у-01у-01у
3.4.3 Трипептид глицин-глицин-гистидин (01у-01у-Ш8)
3.4.4 Трипептид глицин-глицин-тирозин (С1у-С1у-Туг)
3.4.5 Трипептид С1и-Суз-С1у (глутатион)
3.4.6 Тетрапептид пАс-8ег-РЬе-Уа1-01у-0Ме
ГЛАВА 4. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ И ВЫВОДЫ
ЛИТЕРАТУРА
ПРИЛОЖЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ
Актуальность темы исследования. Одной из важнейших задач химической и биологической физики является установление пространственного строения органических и биоорганических соединений. Хорошо известно, что биологическая активность протеинов связана с их пространственным строением. Изучение конформаций олигопептидов также важно, так как они являются структурными блоками полипептидов, и знание их пространственного строения может быть использовано для предсказания конфигурации цепей протеинов. Кроме того, многие из олигопептидов обладают фармакологическими свойствами, а некоторые короткие пептидные последовательности, синтезируемые клеткой, являются частью иммунной системы живого организма.
Традиционно исследования пространственного строения органических соединений в растворах основаны как на данных одномерной ЯМР спектроскопии, включая динамический ЯМР, так и на использовании современных подходов в ЯМР, таких как двумерная ЯМР ЫОЕЗУ спектроскопия (спектроскопия ядерного эффекта Оверхаузера и обмена), которая позволяет определять расстояния между магнитными ядрами, отстоящими друг от друга на расстоянии до 5 А. К сожалению, применение двумерной ЕЮЕЗУ ЯМР спектроскопии к исследованию низкомолекулярных органических соединений, подпадающих под условие быстрого движения (Й) о * <<: 1) где Тс - время корреляции
молекулярного движения, Шо - угловая скорость прецессии магнитных ядер) не всегда эффективно. В этом случае наблюдаются слабые по ~ интенсивности кросс-пики в спектрах ЯМР ЫОЕ8У, что затрудняет получение количественной информации о межпротонных расстояниях.
Среди направлений в приложениях ЯМР спектроскопии особое место

Глава 2. ИССЛЕДОВАНИЕ СВОЙСТВ ЛИОТРОПНЫХ
ЖИДКОКРИСТАЛЛИЧЕСКИХ СРЕД МЕТОДОМ ЯМР 2.1 Введение
Среди новых перспективных направлений в приложениях спектроскопии ЯМР особое место занимает исследование пространственного строения молекул, частично ориентированных в лиотропных жидкокристаллических системах. Такой подход позволяет независимым образом определять пространственную структуру различных молекул, в том числе и биологических макромолекул, в жидкой фазе.
На сегодняшний день различные жидкокристаллические среды используются для необходимого частичного ориентирования биохимических объектов в магнитном поле. В данной главе будут представлены оригинальные исследования методом ЯМР спектроскопии ламеллярных жидкокристаллических фаз лиотропных систем на основе п-алкил-поли(этилен)гликолей, хлорид или бромид цетилпиридиния и нормальных спиртов в воде, в частности, будут представлены границы (диаграммы) существования ламеллярных фаз (в координатах концентрация компонентов - температура раствора). Нужно отметить, что подобные исследования с использованием метода ЯМР в литературе не описаны.
2.1 Спектроскопии ЯМР ориентированных молекул как метод структурного анализа
Идея ориентировать молекулы для получения структурной информации возникла и получила практическое воплощение в начале 1960-х годов, когда в качестве ориентирующих сред были предложены жидкие кристаллы (ЖК) [26].