Полиморфизм митохондриальной ДНК в популяциях коренного населения Западной Сибири и восточных славян

• Автор: Казаковцева, Марина Александровна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 1998
• Место защиты: Новосибирск
• Количество страниц: 148 с. : ил.

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ СОКРАЩЕНИЙ
мтДНК - митохондриальная ДНК н.п. - нуклеотидные пары
ПДРФ - полиморфизм длин рестрикционных фрагментов
ПЦР - полимеразная цепная реакция
сТР - дезоксинукпеозидтрифосфаты
ЭДТА - этилендиаминтетрауксусная кислота
ЗОБ - додецилсульфат натрия
Тац*полимераза - ДНК-полимераза ТЬегтив АриаИсив

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Анализ полиморфизма митохондриальной ДНК в эволюционной антропологии и популяционной генетике человека
1.1.1. Структурно-функциональная характеристика митохондриальной ДНК
1.1.2. Наследование и изменчивость митохондриального генома
1.1.3. Современные подходы к анализу вариабельности мтДНК в антропогенетических исследованиях
1.2. Современные представления об эволюции митохондриального
генофонда населения Евразии
1.2.1. Основные этапы изучения полиморфизма мтДНКв различных
этнических группах Евразии
1.2.2. Современные представления о структуре и эволюции
митохондриального генофонда европейцев
1.2.3. Современные представления об особенностях митохондриального генофонда населения Азии
1.2.4. Полиморфизм митохондриальной ДНК в популяциях Северной Азии
1.3. Этно-исторические сведения об изучаемых популяциях
1.3.1. Кеты
1.3.2. Селькупы
1.3.3. Русские
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Сбор образцов крови
2.2. Выделение ДНК из крови
2.3. Амплификация контрольного и V районов мтДНК
2.4. Электрофоретический анализ полиморфизма V района мтДНК
2.5. Рестрикционный анализ полиморфизма контрольного района мтДНК
2.6. «Прямое» секвенирование контрольного района мтДНК
2.7. Статистический и филогенетический анализ Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Характеристика полиморфизма рестрикционных сайтов
3.1.1. Общая характеристика полиморфизма рестрикционных сайтов контрольного района мтДНК в популяциях северных селькупов, кетов, староверов и русского населения севера Сибири
3.1.2. Качественное сопоставление рестрикционного полиморфизма контрольного района мтДНК староверов Сибири с данными по общей популяции русских
3.1.3. Полиморфизм по сайтам рестрикции контрольного района мтДНК в популяциях северных селькупов, кетов и русских в свете данных по другим этническим группам Евразии
3.1.4. Анализ характера нуклеотидных замен, определяющих вариабельность исследуемых рестрикционных сайтов контрольного района мтДНК, в различных этнических группах Евразии
(по данным литературы)
3.2. Характеристика митотипов
3.2.1. Сравнительный анализ митотипов в некоторых регионах и этнических группах мира
3.3. Характеристика первичных последовательностей контрольного района мтДНК

Было показано, что возникновение этой делеции происходило независимо в пределах, по крайней мере, двух гаплогрупп. Однако, в настоящее время распространение делеции в азиатских популяциях связано преимущественно с одной из них. Кроме этого, были уточнены некоторые детали географического распределения отдельных гаплогрупп у папуасов Новой Гвинеи.
Следует отметить работы С. Хораи с соавторами [Horai et al., 1996], в которых были обследованы 5 народностей из Восточной Азии: японцы, айны, руакуанцы, корейцы и китайцы. У 293 представителей Восточной Азии было выявлено 207 различных митотипов, 189 из которых оказались уникальными. Только 18 митотипов распределились между 2 или 3 этническими группами. Наибольшее число общих вариантов отмечено между японцами и корейцами. По результатам секвенирования в сочетании с анализом на наличие «азиатской делеции» было показано, что в обследованных популяциях делеция имеет единое происхождение. Филогенетический анализ продемонстрировал выраженное сходство между материковыми японцами и корейцами. Нуклеотидное разнообразие в пяти популяциях Восточной Азии оказалось ниже, чем у африканцев, и выше, чем у европейцев [Horai eta!., 1996].
Из популяций Центральной Азии в настоящее время имеются данные по монголам, полученные в рамках рестрикционного анализа контрольного района мтДНК [Самбуугийн и др., 1993], всего митохондриального генома и прямого секвенирования контрольного района [Kolman et al., 1996], а также по коренному населению горного Алтая [Shields et al., 1993] в виде небольшой выборки секвенированных последовательностей контрольного района и рестрикционных митотипов в рамках анализа рестрикционного полиморфизма всего митохондриального генома. Рестрикционные митотипы контрольного района сопоставлялись с аналогичными данными по русским из центральных и южных