Изучение взаимосвязи полиморфизма систем групп крови и N-ацетилирования с риском развития рака прямой кишки и с целью индивидуализации терапии

• Автор: Маркарова, Екатерина Васильевна
• Шифр специальности: 14.00.25
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2007
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 0 с. : 133 ил.

Оглавление
ВВЕДЕНИЕТ.З

ГЛАВА 1 Обзор литературы.

1.1 Геном человека и генетический полиморфизм

1.1.1. Генетический полиморфизм системы ФУпп крови

1.1.2. Г енетический полиморфизм системы ацетилироваиия.

1.2 Рак прямой кишки общая характеристика патологии.

ГЛАВА2. Материалы и методы

ГЛАВА 3. Экспериментальная часть результаты и обсуждение. .

3.1. Анализ клинических данных пациентов с раком прямой

3.2. Сравнительное изучение полиморфизма систем фупп крови у пациентов с раком прямой кишки и здоровых индивидуумов московской выборке
3.3. Сравнительное изучение результатов генотипирования и фенотипирования ацетилироваиия в московской выборке индивидуумов
3.4. Сравнительное изучение полиморфизма систем Ыаиетилирования у пациентов с раком прямой кишки и здоровых индивидуумов московской выборке
3.5. Взаимосвязь генетического полиморфизма в системах фу пп крови и ацетилироваиия с риском развития рака прямой кишки и чувствительностью к лекарственным препаратам.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ.4
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


В современной классификации повторов принято различать часто повторяющиеся последовательности, число которых превышает 5 на гаплоидный геном, и умеренно повторяющиеся, представленные - 4 копиями. Хорошо изученными представителями первых является сателлитная ДНК. Патрушев Л. И., ]. Мутации типа инсерцийделеций (indels), возникающие из-за сдвига и неточного спаривания цепей ДНК при репликации и из-за жрзавцого кроссниговсра, изменяют число повторов, т е. Патрушев Л. И ]. За счет этого свойства такие последовательности часто называют тандемными повторами с изменяющимся числом копий VNTR (variable number of tandem repeats). Другой тип повторов - диспергированные повторяющиеся последовательности ДНК, не организованные в крупные блоки, а рассеянные по всему геному. Повторы этого типа, иначе называемые умеренно повторяющимися последовательностями (medium reiterated frequency repeats - MERs). SINE (short interspersed elements) - короткие и LINE (long interspersed elements) - длинные диспергированные элементы. Длина SINE-элсментов составляет -0 п. LINE-последоватсльносгей может достигать п. Хорошо изученными повторами класса S1NE в геноме человека являются так называемые Alu-повторы, длина повторяющей единицы которых составляет около 0 п. Alu-повторы представлены в геноме человека порядка 6 копиями и в среднем встречаются через каждые п. ДНК [Патрушев Л,И. Несмотря на широкую распространенность повторяющихся и уникальных некодирующих последовательностей в геноме человека, биологическое значение этих н других некодирующих элементов генома остается непонятным. Отличие между мутацией и полиморфизмом достаточно условно. По соглашению, вариабельность в нуклеотидной последовательности определенного участка ДНК, выявляемая менее чем у 1% людей в популяции, называется мутацией, если же один из вариантов нуклеотидной последовательности в определенном участке ДНК выявляется более чем у 1% людей в популяции, такую вариабельность принято называть полиморфизмом (т. Omerni G. S., Motulsky A. G., ]. Термин «генетический полиморфизм» определяет моногенные признаки, представленные в популяции, но меньшей мере, двумя фенотипами, ни один из которых не является редким [Meyer U. A Zanger U. M ]. Генетический полиморфизм может проявляться как на уровне белков (за счет изменений в генетической информации кодирующих последовательностей генома), так и на уровне ДНК (за счет изменений в генетической информации некодирующих уникальных и повторяющихся последовательностях генома). При этом, следует подчеркнуть, что кодирующая часть генома человека, которая составляет лишь более 1% хромосомной ДНК. Патрушев Л. И ]. Следовательно, для генетической паспортизации необходим поиск последовательностей в геномах одного вида, которые обладают генетической нестабильностью при патологических состояниях организма. Такие последовательности принято называть генетическими маркерами. Первыми молекулярными маркерами были маркеры, созданные на основе белкового полиморфизма (биохимические маркеры). Использование нескольких сотен биохимических маркеров позволило оценить уровень генетического полиморфизма у более 2 ООО биологических видов (от микроорганизмов до человека) и разработать основные теоретические положения популяционной генетики (Алтухов Ю. П. и др ; Алтухов Ю. П., Курбатова O. JI. Сулимова Г. Е. и др ]. Использование в качестве маркерных систем полиморфные нуклеотидные последовательности ДНК представляется перспективным. Полиморфные последовательности ДНК позволяют тестировать генетический полиморфизм непосредственно на уровне генетической информации, а не только на уровне продуктов генов, как в случае использования метода белкового полиморфизма. ДНК-маркеры позволяют решить проблему насыщения генома маркерами и маркировать практически любые участки ДНК. Кроме этого, эта маркерная система дает возможность использовать для анализа любые ткани и органы, независимо от стадии развитии организма и имеет целый ряд преимуществ по сравнению с другими маркерами [Сулимова Г. Е. и др. Наиболее частой формой вариаций ДНК в геноме человека является полиморфизм единичного нуклеотида или однонуклеотидный полиморфизм.