Идентификация генетических маркеров, ассоциированных с предрасположенностью к сахарному диабету 1-го типа в локусах IDDM8, IDDM9, IDDM10, IDD12 и HLA

• Автор: Зильберман, Любовь Иосифовна
• Шифр специальности: 14.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2005
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 139 с. : 7 ил.

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1 Основные методические подходы, используемые при изучении молекулярной генетики СД типа 1

1.1.1 Метод выявления ассоциации между генам икандидата ми и заболеванием .

1.1.2 Метод сцепления областей генома с заболеванием.

1.1.3 Полиморфные участки ДНКтипы и основные методы выявления .

1.1.4 Основные методы выявления полиморфных участков ДНК.

1.2 Сахарный диабет

Сахарный диабет типа I

. .1 Эгиопатогснсз сахарного диабета типа 1.

1.3.2 Модели деструкции бетаклеток

1.3.3 Лондонская модель деструкции 1клеток

1.3.4 Стенфордская модель
1.4 Аналит генетических фагсгоров предрасположенности к СД 1 типа.и
1.5 Характеристика изученных в работе генов и полиморфных маркеров .
1.5.1 Локс главного комплекса гистосовмсстимости
1.5.2 Локус ШОМ8 .
. 5.3 Супсроксиддисмутаза 2.
1.5.4 Ген Л0С. .
1.5.5 Локус ЮОМ9.
1.5.6 Локус ЮОМЮ. .
1.5.7 Локус ЮО2
2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Популяционные выборки и пациенты
Молекулярногенетическое исследование .
Статистическая обработка результатов . .
3 РЕЗУЛЬТАТЫ ПРОВЕДЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ.
3.1 Изучение сцепления с сахарным диабетом типа 1 маркеров, расположенных в локусе ШЛМ8 .
3.1.1 Изучение сцепления однонуклеотидного полиморфизма СТс СД типа 1.
3.1.2 Изучение сцепления однонуклеотидного полиморфизма СТ с СД типа
3.1.3 Изучение снепления однонуклеотидного полиморфизма С6Тс СД типа 1.
Изучение сцепления с сахарным диабетом типа 1 маркеров, расположенных в локусе ШПМ
.1 Изучение сцепления полиморфного микросатсллита Д 9 с СД типа I.
3.2.2 Изучение сцепления полиморфного микросатсллита 5 с СДтима 1.
Изучение сцепления с сахарным диабетом типа 1 маркеров, расположенных в локусе ШЭМЮ .
.1 Изучение снепления полиморфного микросатсллита с СД типа 1.
.2 Изучение сцепления полиморфного микросатсллита ОЮБ7 с СД типа 1
3.3.3 Изучение снепления полиморфного микросателлита с СД типа 1
.4 Изучение сцепления полиморфного микросагеллзгга с СД типа
3.4 Изучение сцеплении с сахарным диабетом тина 1 маркеров, расположенных в локусе Ю1М .
3.4.1 Изучение сцепления полиморфного микросатсллита АТп с СД типа
3.4.2 Изучение сцепления однонуклсотидного полиморфизма АС с СД типа
3.5 Определение защитных и предрасполагающих к развитию сахарного диабета типа 1 НЬЛгаплотниов в русской популяция .
3.5.1 Методика выделения гаплотипов
3.5.2 Сравнительное изучение частот предрасполагающих и защитных гаплотипов л о куса Н1А у больных СДтипа 1 и здоровых
3.6 Поиск ассоциации локусов ШЛМ8, ПЮМ9, ЮбМЮ и ЮОМ с предрасполагающими и
защитными генотипами локуса
4 ОБСУЖДЕНИЕ ПОЛУЧЕННЫХ РЕЗУЛЬТАТОВ.
4.1 Проблемы применения полученных результатов к клинической практике .
4.2 Обсуждение результатов исследования
Обсуждение результатов исследования НХА
ВЫВОДЫ
КРАТКИЙ СЛОВАРЬ ИСПОЛЬЗУЕМЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ТЕРМИНОВ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Сатсллитная ДНК представляет собой высокоповторяющиеся последовательности, которые составляют до 7 всего генома человека. Особое место среди сателлитных ДНК занимают микро и минисателлитньте последовательности, являющиеся многочисленной группой рассеянных по всему геному коротких тандемных повторов и располагающихся либо внутри гена например, в ингроне, либо рядом с геном в межгенных областях. Микросателпитиые полиморфизмы , это тандемные повторы с изменяющимся числом повторяющихся единиц, каждая из которых имеет длину от 1 до 6 н. Минисателлитные полиморфизмы представляют собой тандемные повторы с изменяющимся числом повторяющихся единиц, каждая из которых имеет длину от 7 н. Микро и минисателлитные повторы являются очень информативными системами, т. В большинстве случаев полиморфные маркеры не являются этиологическими вариантами, определяющими предрасположенность к заболеваниям, но часто они находятся в неравновесии по сцеплению с различными этиологическими вариантами. Согласно мнению ряда авторов, наличие ассоциации или сцепления полиморфного маркера с заболеванием позволяет судить и об ассоциации или сцеплении соответствующего этиологического варианта конкретного гена ,5. В настоящее время основными характеристиками полиморфных маркеров, используемых в анализе наследственной предрасположенности, являются уровень полиморфизма, определяемый числом аллелей маркера, и информативность, которая зависит от гетсрозиготности маркера. Высокоинформативными и высокополиморфными считаются маркеры с числом аллелей от пяти и гетсрозиготностью 0, и выше. Одновременно с этим.